MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790 plasmid PL47

Total Repeats: 592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008213	TGA	2	6	120	125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644368
2	NC_008213	CTT	2	6	193	198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109644368
3	NC_008213	TGT	2	6	244	249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109644368
4	NC_008213	AGT	2	6	293	298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644368
5	NC_008213	GAC	2	6	325	330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644368
6	NC_008213	CTG	2	6	403	408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644368
7	NC_008213	TCA	2	6	443	448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644368
8	NC_008213	AGC	2	6	467	472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644368
9	NC_008213	TGA	2	6	477	482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644368
10	NC_008213	TCG	2	6	494	499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644368
11	NC_008213	AGG	2	6	613	618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008213	TGG	2	6	622	627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008213	CAG	2	6	658	663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008213	AAG	2	6	692	697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008213	AAC	2	6	749	754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008213	CAC	2	6	854	859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109644369
17	NC_008213	ATC	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644369
18	NC_008213	GAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109644369
19	NC_008213	TCA	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644369
20	NC_008213	TCC	2	6	960	965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109644369
21	NC_008213	TCC	2	6	1198	1203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109644369
22	NC_008213	GAC	3	9	1206	1214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644369
23	NC_008213	CTC	2	6	1385	1390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109644369
24	NC_008213	ATG	2	6	1474	1479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644369
25	NC_008213	GTT	2	6	1501	1506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008213	GTG	2	6	1634	1639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008213	CTG	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644370
28	NC_008213	ACT	3	9	2102	2110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644370
29	NC_008213	GAG	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644370
30	NC_008213	GAC	2	6	2153	2158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644370
31	NC_008213	GGA	2	6	2214	2219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644370
32	NC_008213	TCA	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644370
33	NC_008213	TAT	2	6	2475	2480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008213	AAT	2	6	2513	2518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008213	GTG	2	6	2757	2762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008213	CTG	2	6	3120	3125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008213	TAC	2	6	3224	3229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008213	GAC	2	6	3273	3278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008213	TTA	2	6	3292	3297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008213	GGA	2	6	3334	3339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008213	AAG	2	6	3569	3574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008213	TAA	3	9	3652	3660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008213	ATA	3	9	3676	3684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008213	ACG	2	6	3785	3790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008213	TAT	2	6	3855	3860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008213	TAT	2	6	4001	4006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109644371
47	NC_008213	TTG	2	6	4078	4083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109644371
48	NC_008213	TAA	2	6	4105	4110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109644371
49	NC_008213	AAT	2	6	4247	4252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109644371
50	NC_008213	ATC	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644371
51	NC_008213	ACT	2	6	4445	4450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644371
52	NC_008213	TCA	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644371
53	NC_008213	TGC	2	6	4568	4573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644371
54	NC_008213	TAA	2	6	4647	4652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008213	TAT	2	6	4721	4726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109644372
56	NC_008213	ATT	2	6	4740	4745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109644372
57	NC_008213	ATC	2	6	4756	4761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644372
58	NC_008213	TGA	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644372
59	NC_008213	ATT	2	6	4879	4884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109644372
60	NC_008213	GCT	2	6	5019	5024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644372
61	NC_008213	TAA	2	6	5154	5159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008213	TTA	2	6	5160	5165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008213	GTA	2	6	5180	5185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008213	AGC	2	6	5287	5292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008213	AGA	2	6	5313	5318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008213	ATC	2	6	5332	5337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008213	CGA	2	6	5338	5343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008213	AAG	2	6	5391	5396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008213	CGT	2	6	5484	5489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644373
70	NC_008213	GAT	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644373
71	NC_008213	TGA	2	6	5551	5556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644373
72	NC_008213	ACC	2	6	5601	5606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109644373
73	NC_008213	GAT	2	6	5611	5616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644373
74	NC_008213	GAC	2	6	5617	5622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644373
75	NC_008213	GAC	2	6	5701	5706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644373
76	NC_008213	ACC	3	9	5813	5821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109644373
77	NC_008213	GCA	2	6	5857	5862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644373
78	NC_008213	TCC	2	6	5874	5879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109644373
79	NC_008213	TGC	2	6	5979	5984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644373
80	NC_008213	CTG	2	6	6144	6149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644373
81	NC_008213	ACT	2	6	6238	6243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644373
82	NC_008213	GAC	2	6	6274	6279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644373
83	NC_008213	GTC	2	6	6363	6368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644373
84	NC_008213	ATT	2	6	6397	6402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109644373
85	NC_008213	TCT	2	6	6520	6525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109644373
86	NC_008213	GTG	2	6	6571	6576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109644373
87	NC_008213	CGT	2	6	6629	6634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644373
88	NC_008213	GGA	2	6	6667	6672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644373
89	NC_008213	TCT	2	6	6700	6705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109644373
90	NC_008213	ATT	2	6	6901	6906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008213	ATC	2	6	6960	6965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008213	TGC	2	6	6980	6985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008213	TGA	2	6	7179	7184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008213	GAG	2	6	7289	7294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644374
95	NC_008213	GTT	2	6	7309	7314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109644374
96	NC_008213	GAG	2	6	7324	7329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644374
97	NC_008213	CAC	2	6	7500	7505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109644374
98	NC_008213	ATC	2	6	7790	7795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644375
99	NC_008213	CGA	2	6	7834	7839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644375
100	NC_008213	TAA	2	6	7909	7914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109644375
101	NC_008213	ACT	2	6	7959	7964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008213	CGA	2	6	8095	8100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008213	TCT	2	6	8130	8135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008213	AAG	2	6	8239	8244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008213	AGT	2	6	8260	8265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008213	GAT	2	6	8632	8637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644376
107	NC_008213	CTG	2	6	8696	8701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109644376
108	NC_008213	CTC	2	6	8749	8754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109644376
109	NC_008213	GAT	2	6	8755	8760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644376
110	NC_008213	TGA	2	6	8790	8795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644376
111	NC_008213	CGT	2	6	8934	8939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008213	GAC	2	6	9006	9011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008213	GGA	2	6	9259	9264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109644377
114	NC_008213	CGA	2	6	9272	9277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644377
115	NC_008213	GAT	2	6	9291	9296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109644377
116	NC_008213	GAC	3	9	9382	9390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109644377
117	NC_008213	ATC	2	6	9494	9499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644377
118	NC_008213	CAT	2	6	9522	9527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644377
119	NC_008213	GTC	2	6	9766	9771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008213	TAT	2	6	9866	9871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008213	ACA	2	6	9888	9893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008213	CTC	2	6	9963	9968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_008213	ACG	2	6	10006	10011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008213	CGA	2	6	10129	10134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008213	ACG	2	6	10265	10270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008213	GTT	2	6	10389	10394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008213	CTA	2	6	10425	10430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008213	GGA	2	6	10453	10458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008213	TGA	2	6	10512	10517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008213	CTG	2	6	10590	10595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008213	TCA	2	6	10751	10756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109644378
132	NC_008213	GAA	2	6	10761	10766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109644378
133	NC_008213	GAA	3	9	10812	10820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109644378
134	NC_008213	GAA	2	6	10866	10871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109644378
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259	NC_008213	ATA	2	6	20115	20120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_008213	GAA	2	6	20235	20240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_008213	ATT	2	6	20319	20324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_008213	TGA	2	6	21645	21650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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