MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 8693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008212	ACCC	2	8	253	260	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_008212	TGGA	2	8	370	377	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008212	TAGG	2	8	436	443	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008212	AGAT	2	8	544	551	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008212	TCAA	2	8	797	804	50 %	25 %	0 %	25 %	110666977
6	NC_008212	GTCA	2	8	1164	1171	25 %	25 %	25 %	25 %	110666977
7	NC_008212	TTCA	2	8	1871	1878	25 %	50 %	0 %	25 %	110666977
8	NC_008212	ACTT	2	8	1963	1970	25 %	50 %	0 %	25 %	110666977
9	NC_008212	AATT	2	8	2421	2428	50 %	50 %	0 %	0 %	110666977
10	NC_008212	ATAA	2	8	2794	2801	75 %	25 %	0 %	0 %	110666978
11	NC_008212	TCAC	2	8	2909	2916	25 %	25 %	0 %	50 %	110666978
12	NC_008212	CAAC	2	8	3419	3426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008212	ACCA	2	8	3431	3438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008212	AATC	2	8	3965	3972	50 %	25 %	0 %	25 %	110666979
15	NC_008212	GTTA	2	8	4162	4169	25 %	50 %	25 %	0 %	110666979
16	NC_008212	TCGA	2	8	4177	4184	25 %	25 %	25 %	25 %	110666979
17	NC_008212	GGCA	2	8	5070	5077	25 %	0 %	50 %	25 %	110666979
18	NC_008212	CGGT	2	8	5093	5100	0 %	25 %	50 %	25 %	110666979
19	NC_008212	CTCA	2	8	5435	5442	25 %	25 %	0 %	50 %	110666980
20	NC_008212	GTTT	2	8	5596	5603	0 %	75 %	25 %	0 %	110666980
21	NC_008212	ATAA	2	8	7172	7179	75 %	25 %	0 %	0 %	110666981
22	NC_008212	AATA	2	8	7300	7307	75 %	25 %	0 %	0 %	110666981
23	NC_008212	AAGT	2	8	7390	7397	50 %	25 %	25 %	0 %	110666981
24	NC_008212	GAAC	2	8	7645	7652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008212	GCGT	2	8	7703	7710	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008212	CGGT	2	8	7967	7974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008212	TCAA	2	8	8391	8398	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008212	AGAT	2	8	8406	8413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008212	GTTC	2	8	8423	8430	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008212	ATAC	2	8	9213	9220	50 %	25 %	0 %	25 %	110666982
31	NC_008212	TCAC	2	8	9275	9282	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008212	AAAC	2	8	10064	10071	75 %	0 %	0 %	25 %	110666983
33	NC_008212	CGTC	2	8	10718	10725	0 %	25 %	25 %	50 %	110666984
34	NC_008212	CATA	2	8	10798	10805	50 %	25 %	0 %	25 %	110666984
35	NC_008212	ACAA	2	8	10817	10824	75 %	0 %	0 %	25 %	110666984
36	NC_008212	GCTG	2	8	10914	10921	0 %	25 %	50 %	25 %	110666984
37	NC_008212	AGCA	2	8	11357	11364	50 %	0 %	25 %	25 %	110666984
38	NC_008212	ATTG	2	8	12151	12158	25 %	50 %	25 %	0 %	110666984
39	NC_008212	GTTT	2	8	12309	12316	0 %	75 %	25 %	0 %	110666984
40	NC_008212	TGCT	2	8	12980	12987	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008212	ATGA	2	8	13002	13009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008212	TCAA	2	8	13371	13378	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008212	CTTC	2	8	13539	13546	0 %	50 %	0 %	50 %	110666986
44	NC_008212	CATA	2	8	13675	13682	50 %	25 %	0 %	25 %	110666987
45	NC_008212	TCGT	2	8	13778	13785	0 %	50 %	25 %	25 %	110666987
46	NC_008212	ACAG	2	8	14016	14023	50 %	0 %	25 %	25 %	110666987
47	NC_008212	TCGT	2	8	14051	14058	0 %	50 %	25 %	25 %	110666987
48	NC_008212	TGGA	2	8	14084	14091	25 %	25 %	50 %	0 %	110666987
49	NC_008212	GATT	2	8	14655	14662	25 %	50 %	25 %	0 %	110666987
50	NC_008212	AATA	2	8	15223	15230	75 %	25 %	0 %	0 %	110666987
51	NC_008212	CGAC	2	8	15562	15569	25 %	0 %	25 %	50 %	110666987
52	NC_008212	CACT	2	8	16908	16915	25 %	25 %	0 %	50 %	110666988
53	NC_008212	GGAA	2	8	17115	17122	50 %	0 %	50 %	0 %	110666988
54	NC_008212	TTCT	2	8	17692	17699	0 %	75 %	0 %	25 %	110666989
55	NC_008212	GTAT	2	8	17744	17751	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008212	GATA	2	8	18600	18607	50 %	25 %	25 %	0 %	110666990
57	NC_008212	GTAC	2	8	18885	18892	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008212	GACA	2	8	19058	19065	50 %	0 %	25 %	25 %	110666991
59	NC_008212	GACT	2	8	19797	19804	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008212	AATG	2	8	19968	19975	50 %	25 %	25 %	0 %	110666992
61	NC_008212	TTTA	2	8	20226	20233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008212	TGAG	3	12	20300	20311	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008212	TCGT	2	8	20408	20415	0 %	50 %	25 %	25 %	110666993
64	NC_008212	AGTG	2	8	21220	21227	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008212	TTCT	2	8	22559	22566	0 %	75 %	0 %	25 %	110666994
66	NC_008212	GAGC	2	8	23086	23093	25 %	0 %	50 %	25 %	110666995
67	NC_008212	CACT	2	8	23425	23432	25 %	25 %	0 %	50 %	110666995
68	NC_008212	TTCG	2	8	23518	23525	0 %	50 %	25 %	25 %	110666995
69	NC_008212	ATGG	2	8	23676	23683	25 %	25 %	50 %	0 %	110666995
70	NC_008212	GCAG	2	8	23691	23698	25 %	0 %	50 %	25 %	110666995
71	NC_008212	AAGG	2	8	24426	24433	50 %	0 %	50 %	0 %	110666996
72	NC_008212	ATAC	2	8	24511	24518	50 %	25 %	0 %	25 %	110666996
73	NC_008212	ACGC	2	8	24741	24748	25 %	0 %	25 %	50 %	110666996
74	NC_008212	TCAG	2	8	24791	24798	25 %	25 %	25 %	25 %	110666996
75	NC_008212	TCAA	2	8	24899	24906	50 %	25 %	0 %	25 %	110666996
76	NC_008212	CAAA	2	8	25577	25584	75 %	0 %	0 %	25 %	110666996
77	NC_008212	AATT	2	8	26960	26967	50 %	50 %	0 %	0 %	110666997
78	NC_008212	AGAA	2	8	27260	27267	75 %	0 %	25 %	0 %	110666997
79	NC_008212	CGAC	2	8	27437	27444	25 %	0 %	25 %	50 %	110666997
80	NC_008212	TTCA	2	8	29543	29550	25 %	50 %	0 %	25 %	110666999
81	NC_008212	TGAT	2	8	29591	29598	25 %	50 %	25 %	0 %	110666999
82	NC_008212	GCTG	2	8	30559	30566	0 %	25 %	50 %	25 %	110667000
83	NC_008212	AACC	2	8	30615	30622	50 %	0 %	0 %	50 %	110667000
84	NC_008212	GACG	2	8	30991	30998	25 %	0 %	50 %	25 %	110667000
85	NC_008212	GACT	2	8	31486	31493	25 %	25 %	25 %	25 %	110667000
86	NC_008212	GAAT	2	8	32068	32075	50 %	25 %	25 %	0 %	110667001
87	NC_008212	TCAA	2	8	32420	32427	50 %	25 %	0 %	25 %	110667001
88	NC_008212	AACT	2	8	33724	33731	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008212	CCGA	2	8	34226	34233	25 %	0 %	25 %	50 %	110667003
90	NC_008212	CGGT	2	8	34793	34800	0 %	25 %	50 %	25 %	110667004
91	NC_008212	CCCG	2	8	34835	34842	0 %	0 %	25 %	75 %	110667004
92	NC_008212	GACC	2	8	34899	34906	25 %	0 %	25 %	50 %	110667005
93	NC_008212	CCAA	2	8	35503	35510	50 %	0 %	0 %	50 %	110667005
94	NC_008212	ACTT	2	8	36499	36506	25 %	50 %	0 %	25 %	110667006
95	NC_008212	TATC	2	8	36775	36782	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008212	AATA	2	8	37127	37134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008212	GTTA	2	8	37179	37186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008212	TCTG	2	8	37656	37663	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008212	CGAG	3	12	37666	37677	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008212	CCTC	2	8	37685	37692	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_008212	GATT	2	8	37716	37723	25 %	50 %	25 %	0 %	110667009
102	NC_008212	GCTC	2	8	38574	38581	0 %	25 %	25 %	50 %	110667010
103	NC_008212	GATT	2	8	38605	38612	25 %	50 %	25 %	0 %	110667010
104	NC_008212	TTAT	2	8	38733	38740	25 %	75 %	0 %	0 %	110667010
105	NC_008212	GCAC	2	8	39828	39835	25 %	0 %	25 %	50 %	110667012
106	NC_008212	GGAT	2	8	40215	40222	25 %	25 %	50 %	0 %	110667012
107	NC_008212	ATGG	2	8	40305	40312	25 %	25 %	50 %	0 %	110667012
108	NC_008212	GGGT	2	8	41065	41072	0 %	25 %	75 %	0 %	110667013
109	NC_008212	AACC	2	8	41710	41717	50 %	0 %	0 %	50 %	110667013
110	NC_008212	TCAC	2	8	41823	41830	25 %	25 %	0 %	50 %	110667013
111	NC_008212	CTTC	2	8	42084	42091	0 %	50 %	0 %	50 %	110667013
112	NC_008212	TGGT	2	8	42383	42390	0 %	50 %	50 %	0 %	110667013
113	NC_008212	GCTT	2	8	42414	42421	0 %	50 %	25 %	25 %	110667013
114	NC_008212	ATGG	2	8	42459	42466	25 %	25 %	50 %	0 %	110667013
115	NC_008212	ATAA	2	8	42876	42883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008212	TTAA	2	8	42914	42921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008212	CTGT	2	8	43579	43586	0 %	50 %	25 %	25 %	110667014
118	NC_008212	AGTA	2	8	43811	43818	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008212	AATT	2	8	43831	43838	50 %	50 %	0 %	0 %	110667015
120	NC_008212	AGAC	2	8	44339	44346	50 %	0 %	25 %	25 %	110667016
121	NC_008212	CGAC	2	8	44408	44415	25 %	0 %	25 %	50 %	110667016
122	NC_008212	GAAT	2	8	44767	44774	50 %	25 %	25 %	0 %	110667017
123	NC_008212	AGCG	2	8	44833	44840	25 %	0 %	50 %	25 %	110667017
124	NC_008212	ATTG	2	8	45413	45420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008212	TTAT	2	8	45432	45439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008212	TCTA	2	8	45447	45454	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008212	ATGG	2	8	46902	46909	25 %	25 %	50 %	0 %	110667019
128	NC_008212	CCGA	2	8	47469	47476	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008212	ATCA	2	8	47644	47651	50 %	25 %	0 %	25 %	110667020
130	NC_008212	ATCC	2	8	48709	48716	25 %	25 %	0 %	50 %	110667020
131	NC_008212	TTCA	2	8	49036	49043	25 %	50 %	0 %	25 %	110667020
132	NC_008212	CTGT	2	8	49256	49263	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008212	TATG	2	8	49275	49282	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008212	TCAG	2	8	49338	49345	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008212	AATG	2	8	49507	49514	50 %	25 %	25 %	0 %	110667021
136	NC_008212	GTCC	2	8	49952	49959	0 %	25 %	25 %	50 %	110667021
137	NC_008212	CATG	2	8	49996	50003	25 %	25 %	25 %	25 %	110667021
138	NC_008212	AAAT	2	8	50296	50303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008212	CCCG	2	8	51142	51149	0 %	0 %	25 %	75 %	110667022
140	NC_008212	GCTC	2	8	53491	53498	0 %	25 %	25 %	50 %	110667023
141	NC_008212	TTGA	2	8	53754	53761	25 %	50 %	25 %	0 %	110667023
142	NC_008212	GCAC	2	8	53950	53957	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008212	GACT	2	8	53968	53975	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_008212	CATC	2	8	54277	54284	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008212	CGGA	2	8	54529	54536	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_008212	CTTG	2	8	54762	54769	0 %	50 %	25 %	25 %	110667024
147	NC_008212	ACTC	2	8	55673	55680	25 %	25 %	0 %	50 %	110667024
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150	NC_008212	CAAT	2	8	57731	57738	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_008212	TCCA	2	8	66532	66539	25 %	25 %	0 %	50 %	110667031
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183	NC_008212	CATG	2	8	66577	66584	25 %	25 %	25 %	25 %	110667031
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