MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 67518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008212	TGC	2	6	22983	22988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110666995
502	NC_008212	GAGC	2	8	23086	23093	25 %	0 %	50 %	25 %	110666995
503	NC_008212	TCA	2	6	23227	23232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110666995
504	NC_008212	CTG	2	6	23252	23257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110666995
505	NC_008212	T	6	6	23371	23376	0 %	100 %	0 %	0 %	110666995
506	NC_008212	CACT	2	8	23425	23432	25 %	25 %	0 %	50 %	110666995
507	NC_008212	ATT	2	6	23455	23460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110666995
508	NC_008212	ATC	2	6	23462	23467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110666995
509	NC_008212	TTCG	2	8	23518	23525	0 %	50 %	25 %	25 %	110666995
510	NC_008212	GCA	2	6	23530	23535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110666995
511	NC_008212	CTG	3	9	23543	23551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110666995
512	NC_008212	CTC	2	6	23554	23559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110666995
513	NC_008212	T	6	6	23560	23565	0 %	100 %	0 %	0 %	110666995
514	NC_008212	TA	3	6	23573	23578	50 %	50 %	0 %	0 %	110666995
515	NC_008212	TGC	2	6	23616	23621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110666995
516	NC_008212	GTC	2	6	23662	23667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110666995
517	NC_008212	ATGG	2	8	23676	23683	25 %	25 %	50 %	0 %	110666995
518	NC_008212	GCAG	2	8	23691	23698	25 %	0 %	50 %	25 %	110666995
519	NC_008212	CAC	2	6	23823	23828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_008212	TAATA	2	10	23866	23875	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008212	CTT	2	6	23922	23927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110666996
522	NC_008212	TCG	2	6	23931	23936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110666996
523	NC_008212	AAC	2	6	24026	24031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110666996
524	NC_008212	GAT	2	6	24195	24200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110666996
525	NC_008212	AGC	2	6	24203	24208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110666996
526	NC_008212	GTC	2	6	24228	24233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110666996
527	NC_008212	CG	3	6	24324	24329	0 %	0 %	50 %	50 %	110666996
528	NC_008212	ACG	3	9	24370	24378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110666996
529	NC_008212	AAGG	2	8	24426	24433	50 %	0 %	50 %	0 %	110666996
530	NC_008212	CAA	2	6	24449	24454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110666996
531	NC_008212	TGA	2	6	24478	24483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110666996
532	NC_008212	AGA	2	6	24485	24490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110666996
533	NC_008212	ATAC	2	8	24511	24518	50 %	25 %	0 %	25 %	110666996
534	NC_008212	TGA	2	6	24554	24559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110666996
535	NC_008212	CAA	2	6	24609	24614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110666996
536	NC_008212	ACGC	2	8	24741	24748	25 %	0 %	25 %	50 %	110666996
537	NC_008212	TTG	2	6	24781	24786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110666996
538	NC_008212	TCAG	2	8	24791	24798	25 %	25 %	25 %	25 %	110666996
539	NC_008212	TCG	2	6	24809	24814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110666996
540	NC_008212	GCA	2	6	24837	24842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110666996
541	NC_008212	ATC	2	6	24845	24850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110666996
542	NC_008212	TCAA	2	8	24899	24906	50 %	25 %	0 %	25 %	110666996
543	NC_008212	TTC	2	6	24961	24966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110666996
544	NC_008212	GTG	2	6	24991	24996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110666996
545	NC_008212	ATT	2	6	25005	25010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110666996
546	NC_008212	TC	3	6	25052	25057	0 %	50 %	0 %	50 %	110666996
547	NC_008212	AGC	2	6	25129	25134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110666996
548	NC_008212	AGA	2	6	25196	25201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110666996
549	NC_008212	T	6	6	25236	25241	0 %	100 %	0 %	0 %	110666996
550	NC_008212	CTT	2	6	25320	25325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110666996
551	NC_008212	CGA	3	9	25365	25373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110666996
552	NC_008212	A	7	7	25375	25381	100 %	0 %	0 %	0 %	110666996
553	NC_008212	AAG	2	6	25450	25455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110666996
554	NC_008212	ACA	2	6	25461	25466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110666996
555	NC_008212	CAGACT	6	36	25531	25566	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	110666996
556	NC_008212	AT	3	6	25570	25575	50 %	50 %	0 %	0 %	110666996
557	NC_008212	CAAA	2	8	25577	25584	75 %	0 %	0 %	25 %	110666996
558	NC_008212	A	6	6	25582	25587	100 %	0 %	0 %	0 %	110666996
559	NC_008212	ACAGAG	3	18	25659	25676	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	110666996
560	NC_008212	CAG	2	6	25684	25689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110666996
561	NC_008212	CTG	2	6	25735	25740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110666996
562	NC_008212	TCC	2	6	25751	25756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110666996
563	NC_008212	TTG	3	9	25795	25803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110666996
564	NC_008212	ATT	2	6	25973	25978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110666996
565	NC_008212	GAC	2	6	26011	26016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110666996
566	NC_008212	TA	3	6	26050	26055	50 %	50 %	0 %	0 %	110666996
567	NC_008212	TTC	2	6	26128	26133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110666996
568	NC_008212	CG	3	6	26137	26142	0 %	0 %	50 %	50 %	110666996
569	NC_008212	GA	3	6	26224	26229	50 %	0 %	50 %	0 %	110666996
570	NC_008212	AAC	2	6	26251	26256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110666996
571	NC_008212	TGT	2	6	26264	26269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110666996
572	NC_008212	TTC	2	6	26270	26275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110666996
573	NC_008212	TGA	2	6	26341	26346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110666996
574	NC_008212	CAG	2	6	26347	26352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110666996
575	NC_008212	CAG	2	6	26368	26373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110666996
576	NC_008212	TGT	2	6	26414	26419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110666996
577	NC_008212	ATG	2	6	26435	26440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110666996
578	NC_008212	TGA	2	6	26450	26455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_008212	GCT	2	6	26580	26585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110666997
580	NC_008212	TCG	2	6	26603	26608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110666997
581	NC_008212	CAT	2	6	26614	26619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110666997
582	NC_008212	GTG	2	6	26649	26654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110666997
583	NC_008212	CTT	2	6	26655	26660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110666997
584	NC_008212	TA	4	8	26699	26706	50 %	50 %	0 %	0 %	110666997
585	NC_008212	CGG	2	6	26798	26803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110666997
586	NC_008212	TGA	2	6	26821	26826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110666997
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588	NC_008212	AATT	2	8	26960	26967	50 %	50 %	0 %	0 %	110666997
589	NC_008212	CGG	2	6	27007	27012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110666997
590	NC_008212	TGA	2	6	27038	27043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110666997
591	NC_008212	CGA	2	6	27172	27177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110666997
592	NC_008212	ATT	2	6	27198	27203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110666997
593	NC_008212	AGAA	2	8	27260	27267	75 %	0 %	25 %	0 %	110666997
594	NC_008212	TCC	2	6	27297	27302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110666997
595	NC_008212	ATC	2	6	27373	27378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110666997
596	NC_008212	AC	3	6	27412	27417	50 %	0 %	0 %	50 %	110666997
597	NC_008212	CGAC	2	8	27437	27444	25 %	0 %	25 %	50 %	110666997
598	NC_008212	AT	3	6	27560	27565	50 %	50 %	0 %	0 %	110666997
599	NC_008212	ACT	2	6	27568	27573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_008212	TC	3	6	27577	27582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
601	NC_008212	AGC	2	6	27599	27604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_008212	CAA	2	6	27624	27629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_008212	TG	3	6	27635	27640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_008212	GA	3	6	27663	27668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_008212	TTC	2	6	27706	27711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_008212	TCC	2	6	27742	27747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_008212	CT	3	6	27766	27771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_008212	ATA	2	6	27891	27896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_008212	AAC	2	6	28081	28086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_008212	CTA	2	6	28168	28173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_008212	TGG	2	6	28174	28179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008212	GCC	2	6	28210	28215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_008212	CTC	2	6	28228	28233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_008212	GTGCT	2	10	28304	28313	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
615	NC_008212	CCG	2	6	28363	28368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_008212	A	6	6	28417	28422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008212	ATC	2	6	28519	28524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_008212	TGA	2	6	28543	28548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110666998
619	NC_008212	GAT	2	6	28568	28573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110666998
620	NC_008212	TAT	2	6	28712	28717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110666998
621	NC_008212	GAA	2	6	28730	28735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110666998
622	NC_008212	A	6	6	28742	28747	100 %	0 %	0 %	0 %	110666998
623	NC_008212	GA	3	6	28779	28784	50 %	0 %	50 %	0 %	110666998
624	NC_008212	TCA	2	6	28855	28860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110666998
625	NC_008212	ATG	2	6	28973	28978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110666999
626	NC_008212	ACT	2	6	29008	29013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110666999
627	NC_008212	ATG	2	6	29090	29095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110666999
628	NC_008212	TGT	2	6	29097	29102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110666999
629	NC_008212	CGG	2	6	29108	29113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110666999
630	NC_008212	AT	3	6	29148	29153	50 %	50 %	0 %	0 %	110666999
631	NC_008212	CCG	2	6	29267	29272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110666999
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647	NC_008212	TGT	2	6	30170	30175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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753	NC_008212	CAA	2	6	35546	35551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110667005
754	NC_008212	CT	3	6	35582	35587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
755	NC_008212	GA	3	6	35629	35634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
756	NC_008212	ATA	2	6	35645	35650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
757	NC_008212	TAT	2	6	35652	35657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
758	NC_008212	AGT	2	6	35673	35678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
759	NC_008212	TTCGA	2	10	35713	35722	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
760	NC_008212	TAG	2	6	35723	35728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
761	NC_008212	CTC	2	6	35789	35794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
762	NC_008212	TG	3	6	35795	35800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
763	NC_008212	GCGCT	2	10	35828	35837	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
764	NC_008212	CAC	2	6	35971	35976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
765	NC_008212	CAT	2	6	35983	35988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
766	NC_008212	AT	3	6	35990	35995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
767	NC_008212	AATAA	2	10	35998	36007	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
768	NC_008212	AT	3	6	36089	36094	50 %	50 %	0 %	0 %	110667006
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781	NC_008212	TG	3	6	36680	36685	0 %	50 %	50 %	0 %	110667006
782	NC_008212	CAT	3	9	36742	36750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
783	NC_008212	TATC	2	8	36775	36782	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
784	NC_008212	ATACC	2	10	36826	36835	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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787	NC_008212	AATA	2	8	37127	37134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
788	NC_008212	GTTA	2	8	37179	37186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
789	NC_008212	TCA	2	6	37219	37224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110667008
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799	NC_008212	CCT	2	6	37632	37637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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802	NC_008212	CCTC	2	8	37685	37692	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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