MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006397	G	6	6	6607	6612	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006397	G	6	6	8315	8320	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006397	C	6	6	8525	8530	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_006397	G	6	6	8727	8732	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006397	T	6	6	9068	9073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006397	A	6	6	11256	11261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006397	A	6	6	12828	12833	100 %	0 %	0 %	0 %	55380080
8	NC_006397	C	7	7	13630	13636	0 %	0 %	0 %	100 %	55380081
9	NC_006397	T	6	6	15178	15183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006397	A	6	6	20648	20653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006397	G	6	6	21224	21229	0 %	0 %	100 %	0 %	55380092
12	NC_006397	T	6	6	25221	25226	0 %	100 %	0 %	0 %	55380097
13	NC_006397	A	6	6	25631	25636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006397	T	6	6	26803	26808	0 %	100 %	0 %	0 %	55380099
15	NC_006397	T	7	7	29498	29504	0 %	100 %	0 %	0 %	55380101
16	NC_006397	A	6	6	35610	35615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006397	T	7	7	47413	47419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006397	C	6	6	47598	47603	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_006397	A	6	6	50028	50033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006397	C	6	6	51626	51631	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_006397	G	6	6	51833	51838	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006397	G	6	6	52119	52124	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006397	G	6	6	52175	52180	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006397	T	6	6	54295	54300	0 %	100 %	0 %	0 %	55380131
25	NC_006397	A	6	6	56271	56276	100 %	0 %	0 %	0 %	55380132
26	NC_006397	G	6	6	59059	59064	0 %	0 %	100 %	0 %	55380134
27	NC_006397	G	6	6	59501	59506	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006397	T	7	7	60314	60320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006397	C	6	6	63438	63443	0 %	0 %	0 %	100 %	55380136
30	NC_006397	T	6	6	65401	65406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006397	C	6	6	73880	73885	0 %	0 %	0 %	100 %	55380152
32	NC_006397	G	8	8	81804	81811	0 %	0 %	100 %	0 %	55380159
33	NC_006397	G	6	6	83306	83311	0 %	0 %	100 %	0 %	55380161
34	NC_006397	T	6	6	83817	83822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006397	A	6	6	84439	84444	100 %	0 %	0 %	0 %	55380162
36	NC_006397	A	6	6	87136	87141	100 %	0 %	0 %	0 %	55380165
37	NC_006397	C	6	6	91943	91948	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_006397	G	6	6	92194	92199	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006397	A	6	6	97409	97414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006397	A	6	6	97461	97466	100 %	0 %	0 %	0 %	55380174
41	NC_006397	A	6	6	97748	97753	100 %	0 %	0 %	0 %	55380174
42	NC_006397	C	6	6	100351	100356	0 %	0 %	0 %	100 %	55380177
43	NC_006397	T	6	6	101488	101493	0 %	100 %	0 %	0 %	55380179
44	NC_006397	T	6	6	102253	102258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006397	G	6	6	103052	103057	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006397	C	6	6	103644	103649	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_006397	T	6	6	105279	105284	0 %	100 %	0 %	0 %	55380186
48	NC_006397	T	6	6	105408	105413	0 %	100 %	0 %	0 %	55380186
49	NC_006397	A	6	6	108991	108996	100 %	0 %	0 %	0 %	55380189
50	NC_006397	G	6	6	112743	112748	0 %	0 %	100 %	0 %	55380194
51	NC_006397	A	6	6	117174	117179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006397	A	6	6	119778	119783	100 %	0 %	0 %	0 %	55380202
53	NC_006397	T	6	6	135398	135403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006397	A	6	6	135453	135458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006397	T	6	6	135624	135629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006397	T	6	6	136329	136334	0 %	100 %	0 %	0 %	55380218
57	NC_006397	A	6	6	137683	137688	100 %	0 %	0 %	0 %	55380219
58	NC_006397	A	6	6	138572	138577	100 %	0 %	0 %	0 %	55380220
59	NC_006397	A	6	6	139227	139232	100 %	0 %	0 %	0 %	55380220
60	NC_006397	C	6	6	145261	145266	0 %	0 %	0 %	100 %	55380223
61	NC_006397	A	6	6	150740	150745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006397	A	6	6	157625	157630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006397	T	6	6	157945	157950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006397	G	6	6	158318	158323	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006397	T	6	6	160779	160784	0 %	100 %	0 %	0 %	55380239
66	NC_006397	A	6	6	164321	164326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006397	C	6	6	165350	165355	0 %	0 %	0 %	100 %	55380242
68	NC_006397	A	6	6	197338	197343	100 %	0 %	0 %	0 %	55380268
69	NC_006397	T	6	6	198086	198091	0 %	100 %	0 %	0 %	55380270
70	NC_006397	C	6	6	198727	198732	0 %	0 %	0 %	100 %	55380271
71	NC_006397	A	7	7	205372	205378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006397	G	6	6	213112	213117	0 %	0 %	100 %	0 %	55380287
73	NC_006397	G	6	6	213359	213364	0 %	0 %	100 %	0 %	55380287
74	NC_006397	C	6	6	216401	216406	0 %	0 %	0 %	100 %	55380290
75	NC_006397	C	6	6	224289	224294	0 %	0 %	0 %	100 %	55380295
76	NC_006397	C	6	6	231704	231709	0 %	0 %	0 %	100 %	55380300
77	NC_006397	G	6	6	238462	238467	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006397	G	6	6	242645	242650	0 %	0 %	100 %	0 %	55380315
79	NC_006397	C	6	6	242979	242984	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_006397	T	6	6	245416	245421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006397	T	6	6	263056	263061	0 %	100 %	0 %	0 %	55380331
82	NC_006397	G	6	6	265850	265855	0 %	0 %	100 %	0 %	55380333
83	NC_006397	C	6	6	270963	270968	0 %	0 %	0 %	100 %	55380338
84	NC_006397	A	6	6	274366	274371	100 %	0 %	0 %	0 %	55380341
85	NC_006397	G	6	6	277414	277419	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006397	T	6	6	282620	282625	0 %	100 %	0 %	0 %	55380348
87	NC_006397	T	6	6	282737	282742	0 %	100 %	0 %	0 %	55380348
88	NC_006397	C	6	6	284906	284911	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_006397	G	6	6	286545	286550	0 %	0 %	100 %	0 %	55380354
90	NC_006397	A	6	6	287318	287323	100 %	0 %	0 %	0 %	55380354
91	NC_006397	G	6	6	287509	287514	0 %	0 %	100 %	0 %	55380355

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.