MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 5406

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006396	GC	3	6	87	92	0 %	0 %	50 %	50 %	55376943
2	NC_006396	GA	3	6	287	292	50 %	0 %	50 %	0 %	55376943
3	NC_006396	GA	3	6	870	875	50 %	0 %	50 %	0 %	55376943
4	NC_006396	GT	3	6	945	950	0 %	50 %	50 %	0 %	55376943
5	NC_006396	CA	3	6	1139	1144	50 %	0 %	0 %	50 %	55376944
6	NC_006396	GT	4	8	1518	1525	0 %	50 %	50 %	0 %	55376944
7	NC_006396	CG	4	8	2587	2594	0 %	0 %	50 %	50 %	55376944
8	NC_006396	GC	3	6	2811	2816	0 %	0 %	50 %	50 %	55376944
9	NC_006396	AT	3	6	2928	2933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006396	GC	3	6	3947	3952	0 %	0 %	50 %	50 %	55376946
11	NC_006396	CG	3	6	4467	4472	0 %	0 %	50 %	50 %	55376946
12	NC_006396	CG	3	6	4755	4760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_006396	CG	3	6	5004	5009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_006396	CG	3	6	5443	5448	0 %	0 %	50 %	50 %	55376947
15	NC_006396	TC	3	6	6633	6638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_006396	CT	4	8	6643	6650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_006396	TC	3	6	6910	6915	0 %	50 %	0 %	50 %	55376949
18	NC_006396	AT	3	6	9146	9151	50 %	50 %	0 %	0 %	55376951
19	NC_006396	CG	3	6	9990	9995	0 %	0 %	50 %	50 %	55376952
20	NC_006396	GT	3	6	10123	10128	0 %	50 %	50 %	0 %	55376952
21	NC_006396	CG	3	6	10775	10780	0 %	0 %	50 %	50 %	55376953
22	NC_006396	GC	3	6	15387	15392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_006396	TG	3	6	16078	16083	0 %	50 %	50 %	0 %	55376957
24	NC_006396	CG	3	6	18026	18031	0 %	0 %	50 %	50 %	55376960
25	NC_006396	AC	3	6	18399	18404	50 %	0 %	0 %	50 %	55376960
26	NC_006396	CA	3	6	18983	18988	50 %	0 %	0 %	50 %	55376960
27	NC_006396	TG	3	6	19015	19020	0 %	50 %	50 %	0 %	55376960
28	NC_006396	TC	3	6	19040	19045	0 %	50 %	0 %	50 %	55376960
29	NC_006396	CG	3	6	19135	19140	0 %	0 %	50 %	50 %	55376960
30	NC_006396	CG	3	6	19167	19172	0 %	0 %	50 %	50 %	55376960
31	NC_006396	GC	3	6	19610	19615	0 %	0 %	50 %	50 %	55376960
32	NC_006396	GA	3	6	19817	19822	50 %	0 %	50 %	0 %	55376960
33	NC_006396	GA	3	6	20236	20241	50 %	0 %	50 %	0 %	55376960
34	NC_006396	AT	3	6	20541	20546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006396	AG	4	8	20588	20595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006396	GC	3	6	22302	22307	0 %	0 %	50 %	50 %	55376963
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38	NC_006396	CT	3	6	23364	23369	0 %	50 %	0 %	50 %	55376963
39	NC_006396	AG	3	6	24509	24514	50 %	0 %	50 %	0 %	55376965
40	NC_006396	AT	3	6	24846	24851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006396	CT	3	6	24945	24950	0 %	50 %	0 %	50 %	55376966
42	NC_006396	CG	3	6	25726	25731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_006396	GC	3	6	26305	26310	0 %	0 %	50 %	50 %	55376967
44	NC_006396	GA	3	6	26687	26692	50 %	0 %	50 %	0 %	55376967
45	NC_006396	TC	4	8	27339	27346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_006396	GA	3	6	27767	27772	50 %	0 %	50 %	0 %	55376968
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49	NC_006396	GC	3	6	31344	31349	0 %	0 %	50 %	50 %	55376971
50	NC_006396	TC	3	6	31924	31929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_006396	CA	3	6	31956	31961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006396	CT	3	6	32634	32639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_006396	CA	3	6	33505	33510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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59	NC_006396	CA	3	6	36143	36148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_006396	CG	3	6	36220	36225	0 %	0 %	50 %	50 %	55376978
61	NC_006396	AC	3	6	36649	36654	50 %	0 %	0 %	50 %	55376979
62	NC_006396	AT	3	6	36741	36746	50 %	50 %	0 %	0 %	55376979
63	NC_006396	GC	3	6	37693	37698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_006396	AG	3	6	38960	38965	50 %	0 %	50 %	0 %	55376982
65	NC_006396	TG	3	6	39079	39084	0 %	50 %	50 %	0 %	55376982
66	NC_006396	CT	3	6	39633	39638	0 %	50 %	0 %	50 %	55376982
67	NC_006396	CG	3	6	41541	41546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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69	NC_006396	AC	3	6	42134	42139	50 %	0 %	0 %	50 %	55376986
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71	NC_006396	TC	3	6	43068	43073	0 %	50 %	0 %	50 %	55376987
72	NC_006396	GC	3	6	43291	43296	0 %	0 %	50 %	50 %	55376988
73	NC_006396	AC	4	8	44205	44212	50 %	0 %	0 %	50 %	55376989
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82	NC_006396	GC	3	6	47369	47374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_006396	CT	3	6	47578	47583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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86	NC_006396	TG	3	6	49196	49201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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91	NC_006396	CG	3	6	51694	51699	0 %	0 %	50 %	50 %	55376999
92	NC_006396	CG	3	6	51829	51834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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103	NC_006396	CG	3	6	60353	60358	0 %	0 %	50 %	50 %	55377011
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107	NC_006396	CG	3	6	65108	65113	0 %	0 %	50 %	50 %	55377015
108	NC_006396	GC	3	6	65253	65258	0 %	0 %	50 %	50 %	55377015
109	NC_006396	CA	3	6	67446	67451	50 %	0 %	0 %	50 %	55377017
110	NC_006396	GC	3	6	68740	68745	0 %	0 %	50 %	50 %	55377018
111	NC_006396	CG	3	6	68802	68807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_006396	CG	3	6	69335	69340	0 %	0 %	50 %	50 %	55377019
113	NC_006396	AC	3	6	70436	70441	50 %	0 %	0 %	50 %	55377019
114	NC_006396	GC	3	6	71670	71675	0 %	0 %	50 %	50 %	55377020
115	NC_006396	AC	3	6	75061	75066	50 %	0 %	0 %	50 %	55377023
116	NC_006396	TG	3	6	75228	75233	0 %	50 %	50 %	0 %	55377023
117	NC_006396	TG	3	6	75454	75459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006396	TC	3	6	75927	75932	0 %	50 %	0 %	50 %	55377024
119	NC_006396	AG	3	6	76673	76678	50 %	0 %	50 %	0 %	55377025
120	NC_006396	CT	3	6	77553	77558	0 %	50 %	0 %	50 %	55377025
121	NC_006396	CG	3	6	79216	79221	0 %	0 %	50 %	50 %	55377026
122	NC_006396	CG	3	6	79767	79772	0 %	0 %	50 %	50 %	55377027
123	NC_006396	AC	3	6	79980	79985	50 %	0 %	0 %	50 %	55377027
124	NC_006396	TC	3	6	80943	80948	0 %	50 %	0 %	50 %	55377029
125	NC_006396	GC	3	6	82704	82709	0 %	0 %	50 %	50 %	55377030
126	NC_006396	CA	3	6	82710	82715	50 %	0 %	0 %	50 %	55377030
127	NC_006396	GT	4	8	83281	83288	0 %	50 %	50 %	0 %	55377030
128	NC_006396	AC	3	6	83686	83691	50 %	0 %	0 %	50 %	55377031
129	NC_006396	GC	3	6	84164	84169	0 %	0 %	50 %	50 %	55377032
130	NC_006396	GC	3	6	84692	84697	0 %	0 %	50 %	50 %	55377034
131	NC_006396	GC	3	6	85319	85324	0 %	0 %	50 %	50 %	55377034
132	NC_006396	CG	3	6	85672	85677	0 %	0 %	50 %	50 %	55377034
133	NC_006396	CG	3	6	86456	86461	0 %	0 %	50 %	50 %	55377034
134	NC_006396	CG	3	6	86484	86489	0 %	0 %	50 %	50 %	55377034
135	NC_006396	GC	3	6	87211	87216	0 %	0 %	50 %	50 %	55377033
136	NC_006396	CG	3	6	87557	87562	0 %	0 %	50 %	50 %	55377033
137	NC_006396	AC	3	6	87731	87736	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_006396	CG	3	6	87789	87794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_006396	GC	3	6	89799	89804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_006396	CG	3	6	90082	90087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_006396	GC	3	6	92087	92092	0 %	0 %	50 %	50 %	55377041
142	NC_006396	GT	3	6	92187	92192	0 %	50 %	50 %	0 %	55377041
143	NC_006396	GA	3	6	93200	93205	50 %	0 %	50 %	0 %	55377043
144	NC_006396	AC	3	6	93231	93236	50 %	0 %	0 %	50 %	55377043
145	NC_006396	CG	3	6	93301	93306	0 %	0 %	50 %	50 %	55377043
146	NC_006396	CA	3	6	93377	93382	50 %	0 %	0 %	50 %	55377043
147	NC_006396	AG	3	6	93730	93735	50 %	0 %	50 %	0 %	55377043
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