MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 8853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006396	GCGT	2	8	691	698	0 %	25 %	50 %	25 %	55376943
2	NC_006396	CCGG	2	8	972	979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006396	TGGC	2	8	1292	1299	0 %	25 %	50 %	25 %	55376944
4	NC_006396	CGGT	2	8	2016	2023	0 %	25 %	50 %	25 %	55376944
5	NC_006396	GAGC	2	8	2174	2181	25 %	0 %	50 %	25 %	55376944
6	NC_006396	CTCC	2	8	2302	2309	0 %	25 %	0 %	75 %	55376944
7	NC_006396	GTCG	2	8	2459	2466	0 %	25 %	50 %	25 %	55376944
8	NC_006396	ACTC	2	8	2542	2549	25 %	25 %	0 %	50 %	55376944
9	NC_006396	CCGT	2	8	2571	2578	0 %	25 %	25 %	50 %	55376944
10	NC_006396	CGGC	2	8	3025	3032	0 %	0 %	50 %	50 %	55376945
11	NC_006396	GTCG	2	8	3045	3052	0 %	25 %	50 %	25 %	55376945
12	NC_006396	CGGT	2	8	3187	3194	0 %	25 %	50 %	25 %	55376945
13	NC_006396	CGGG	2	8	3398	3405	0 %	0 %	75 %	25 %	55376946
14	NC_006396	ACCT	2	8	5252	5259	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_006396	CCGA	2	8	5420	5427	25 %	0 %	25 %	50 %	55376947
16	NC_006396	TGGC	2	8	5473	5480	0 %	25 %	50 %	25 %	55376947
17	NC_006396	CGGC	2	8	5756	5763	0 %	0 %	50 %	50 %	55376948
18	NC_006396	ATCG	2	8	5772	5779	25 %	25 %	25 %	25 %	55376948
19	NC_006396	GTCG	2	8	5921	5928	0 %	25 %	50 %	25 %	55376948
20	NC_006396	GTCC	2	8	6487	6494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006396	GTCG	2	8	7570	7577	0 %	25 %	50 %	25 %	55376949
22	NC_006396	GTCT	2	8	7968	7975	0 %	50 %	25 %	25 %	55376950
23	NC_006396	GAAC	2	8	8436	8443	50 %	0 %	25 %	25 %	55376951
24	NC_006396	AGCC	2	8	8907	8914	25 %	0 %	25 %	50 %	55376951
25	NC_006396	ACCC	2	8	9158	9165	25 %	0 %	0 %	75 %	55376951
26	NC_006396	GTTC	2	8	9277	9284	0 %	50 %	25 %	25 %	55376951
27	NC_006396	GGCA	2	8	9678	9685	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_006396	GTTG	2	8	10926	10933	0 %	50 %	50 %	0 %	55376953
29	NC_006396	CGGC	2	8	11040	11047	0 %	0 %	50 %	50 %	55376953
30	NC_006396	CGCC	2	8	11109	11116	0 %	0 %	25 %	75 %	55376953
31	NC_006396	CGTC	2	8	11430	11437	0 %	25 %	25 %	50 %	55376953
32	NC_006396	CACG	2	8	12214	12221	25 %	0 %	25 %	50 %	55376954
33	NC_006396	GATC	2	8	12316	12323	25 %	25 %	25 %	25 %	55376954
34	NC_006396	ACAG	2	8	12506	12513	50 %	0 %	25 %	25 %	55376954
35	NC_006396	AGCA	2	8	13178	13185	50 %	0 %	25 %	25 %	55376954
36	NC_006396	TCAG	2	8	13869	13876	25 %	25 %	25 %	25 %	55376954
37	NC_006396	ATCT	2	8	14482	14489	25 %	50 %	0 %	25 %	55376955
38	NC_006396	GCCG	2	8	14971	14978	0 %	0 %	50 %	50 %	55376956
39	NC_006396	CAGA	2	8	15270	15277	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_006396	ACCG	2	8	15310	15317	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_006396	CAGT	2	8	15393	15400	25 %	25 %	25 %	25 %	55376957
42	NC_006396	CAGG	2	8	15804	15811	25 %	0 %	50 %	25 %	55376957
43	NC_006396	GACC	2	8	15894	15901	25 %	0 %	25 %	50 %	55376957
44	NC_006396	GACC	2	8	16042	16049	25 %	0 %	25 %	50 %	55376957
45	NC_006396	CGCC	2	8	16161	16168	0 %	0 %	25 %	75 %	55376957
46	NC_006396	CGGG	2	8	16683	16690	0 %	0 %	75 %	25 %	55376958
47	NC_006396	CCGC	2	8	16692	16699	0 %	0 %	25 %	75 %	55376958
48	NC_006396	GCCG	2	8	17423	17430	0 %	0 %	50 %	50 %	55376959
49	NC_006396	GCCG	2	8	17669	17676	0 %	0 %	50 %	50 %	55376959
50	NC_006396	ACCG	2	8	17786	17793	25 %	0 %	25 %	50 %	55376959
51	NC_006396	TGCT	2	8	18130	18137	0 %	50 %	25 %	25 %	55376960
52	NC_006396	TGAA	2	8	18482	18489	50 %	25 %	25 %	0 %	55376960
53	NC_006396	GGTC	2	8	19376	19383	0 %	25 %	50 %	25 %	55376960
54	NC_006396	CGGC	2	8	19747	19754	0 %	0 %	50 %	50 %	55376960
55	NC_006396	TCGT	2	8	20227	20234	0 %	50 %	25 %	25 %	55376960
56	NC_006396	TGGC	2	8	20291	20298	0 %	25 %	50 %	25 %	55376960
57	NC_006396	CCAT	2	8	20323	20330	25 %	25 %	0 %	50 %	55376960
58	NC_006396	ACCA	2	8	20494	20501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_006396	GCTG	2	8	20762	20769	0 %	25 %	50 %	25 %	55376961
60	NC_006396	AAAC	2	8	21207	21214	75 %	0 %	0 %	25 %	55376962
61	NC_006396	CGCC	2	8	22030	22037	0 %	0 %	25 %	75 %	55376963
62	NC_006396	ACTC	2	8	22108	22115	25 %	25 %	0 %	50 %	55376963
63	NC_006396	GCGG	2	8	22225	22232	0 %	0 %	75 %	25 %	55376963
64	NC_006396	ACCG	2	8	23027	23034	25 %	0 %	25 %	50 %	55376963
65	NC_006396	GCTG	2	8	23578	23585	0 %	25 %	50 %	25 %	55376964
66	NC_006396	CGCC	2	8	23671	23678	0 %	0 %	25 %	75 %	55376964
67	NC_006396	CTAC	2	8	23803	23810	25 %	25 %	0 %	50 %	55376964
68	NC_006396	TCCG	2	8	23859	23866	0 %	25 %	25 %	50 %	55376964
69	NC_006396	TGAG	2	8	24366	24373	25 %	25 %	50 %	0 %	55376964
70	NC_006396	CGCA	2	8	24389	24396	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_006396	GTCT	2	8	24412	24419	0 %	50 %	25 %	25 %	55376965
72	NC_006396	CTCA	2	8	24568	24575	25 %	25 %	0 %	50 %	55376965
73	NC_006396	CGGT	2	8	24779	24786	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_006396	ATCA	2	8	24897	24904	50 %	25 %	0 %	25 %	55376966
75	NC_006396	TCCA	2	8	25126	25133	25 %	25 %	0 %	50 %	55376966
76	NC_006396	CGAA	2	8	25234	25241	50 %	0 %	25 %	25 %	55376966
77	NC_006396	CGCT	2	8	25551	25558	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_006396	GGTC	2	8	26380	26387	0 %	25 %	50 %	25 %	55376967
79	NC_006396	GGGT	2	8	26427	26434	0 %	25 %	75 %	0 %	55376967
80	NC_006396	TGCG	2	8	26526	26533	0 %	25 %	50 %	25 %	55376967
81	NC_006396	GACG	2	8	27459	27466	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_006396	TCGC	2	8	27513	27520	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_006396	CGTG	2	8	27617	27624	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_006396	CTGG	2	8	27625	27632	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_006396	TGAC	2	8	27643	27650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_006396	ACCA	2	8	27701	27708	50 %	0 %	0 %	50 %	55376968
87	NC_006396	ACTG	2	8	27959	27966	25 %	25 %	25 %	25 %	55376968
88	NC_006396	GGCA	2	8	28048	28055	25 %	0 %	50 %	25 %	55376968
89	NC_006396	TCGT	2	8	28194	28201	0 %	50 %	25 %	25 %	55376968
90	NC_006396	CCGG	3	12	28304	28315	0 %	0 %	50 %	50 %	55376968
91	NC_006396	CCGA	2	8	28443	28450	25 %	0 %	25 %	50 %	55376968
92	NC_006396	TCCG	2	8	28998	29005	0 %	25 %	25 %	50 %	55376969
93	NC_006396	GGTC	2	8	30891	30898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_006396	GTCC	2	8	31219	31226	0 %	25 %	25 %	50 %	55376971
95	NC_006396	TGCG	2	8	31514	31521	0 %	25 %	50 %	25 %	55376971
96	NC_006396	CGAA	2	8	32280	32287	50 %	0 %	25 %	25 %	55376972
97	NC_006396	GTCG	2	8	32308	32315	0 %	25 %	50 %	25 %	55376972
98	NC_006396	GAGG	2	8	32607	32614	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006396	GGCT	2	8	32819	32826	0 %	25 %	50 %	25 %	55376973
100	NC_006396	CGTC	2	8	33226	33233	0 %	25 %	25 %	50 %	55376974
101	NC_006396	GTCG	2	8	34061	34068	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_006396	CGCT	2	8	34373	34380	0 %	25 %	25 %	50 %	55376976
103	NC_006396	GCGA	2	8	34687	34694	25 %	0 %	50 %	25 %	55376976
104	NC_006396	ACGT	2	8	34801	34808	25 %	25 %	25 %	25 %	55376976
105	NC_006396	TGCG	2	8	35215	35222	0 %	25 %	50 %	25 %	55376977
106	NC_006396	GCAA	2	8	35945	35952	50 %	0 %	25 %	25 %	55376977
107	NC_006396	AGCC	2	8	36033	36040	25 %	0 %	25 %	50 %	55376977
108	NC_006396	TTCA	2	8	36439	36446	25 %	50 %	0 %	25 %	55376978
109	NC_006396	AAAG	2	8	36846	36853	75 %	0 %	25 %	0 %	55376980
110	NC_006396	AAAC	2	8	37052	37059	75 %	0 %	0 %	25 %	55376980
111	NC_006396	CAGC	2	8	38014	38021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_006396	CTGC	2	8	38362	38369	0 %	25 %	25 %	50 %	55376981
113	NC_006396	ATAA	2	8	38836	38843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006396	CCGG	2	8	39432	39439	0 %	0 %	50 %	50 %	55376982
115	NC_006396	GTCG	2	8	39956	39963	0 %	25 %	50 %	25 %	55376982
116	NC_006396	GGCG	2	8	40055	40062	0 %	0 %	75 %	25 %	55376982
117	NC_006396	CGCT	2	8	40388	40395	0 %	25 %	25 %	50 %	55376983
118	NC_006396	CCCG	2	8	40678	40685	0 %	0 %	25 %	75 %	55376983
119	NC_006396	GAGC	2	8	41121	41128	25 %	0 %	50 %	25 %	55376984
120	NC_006396	TATT	2	8	41393	41400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006396	GTCT	2	8	41503	41510	0 %	50 %	25 %	25 %	55376985
122	NC_006396	GGTC	2	8	41692	41699	0 %	25 %	50 %	25 %	55376986
123	NC_006396	TCGC	2	8	41796	41803	0 %	25 %	25 %	50 %	55376986
124	NC_006396	CAGC	2	8	42247	42254	25 %	0 %	25 %	50 %	55376986
125	NC_006396	CGGC	2	8	42328	42335	0 %	0 %	50 %	50 %	55376986
126	NC_006396	CCGG	2	8	42352	42359	0 %	0 %	50 %	50 %	55376986
127	NC_006396	ACGG	2	8	43254	43261	25 %	0 %	50 %	25 %	55376987
128	NC_006396	ACCC	2	8	43867	43874	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
129	NC_006396	GAAC	2	8	44448	44455	50 %	0 %	25 %	25 %	55376989
130	NC_006396	GGTC	2	8	44534	44541	0 %	25 %	50 %	25 %	55376989
131	NC_006396	GACG	2	8	44600	44607	25 %	0 %	50 %	25 %	55376989
132	NC_006396	TTCG	2	8	44843	44850	0 %	50 %	25 %	25 %	55376989
133	NC_006396	CGTT	2	8	45165	45172	0 %	50 %	25 %	25 %	55376990
134	NC_006396	AGTC	2	8	45522	45529	25 %	25 %	25 %	25 %	55376990
135	NC_006396	GTCG	2	8	45638	45645	0 %	25 %	50 %	25 %	55376990
136	NC_006396	GAGC	2	8	45723	45730	25 %	0 %	50 %	25 %	55376990
137	NC_006396	GGCC	2	8	45936	45943	0 %	0 %	50 %	50 %	55376991
138	NC_006396	CGCT	2	8	46624	46631	0 %	25 %	25 %	50 %	55376992
139	NC_006396	GGCC	2	8	46720	46727	0 %	0 %	50 %	50 %	55376992
140	NC_006396	GCGG	2	8	47135	47142	0 %	0 %	75 %	25 %	55376992
141	NC_006396	CGAG	2	8	47147	47154	25 %	0 %	50 %	25 %	55376992
142	NC_006396	CGTG	2	8	47322	47329	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_006396	CAAG	2	8	47359	47366	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_006396	TTCT	2	8	47572	47579	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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282	NC_006396	CTTC	2	8	97110	97117	0 %	50 %	0 %	50 %	55377048
283	NC_006396	AGGC	2	8	99004	99011	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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