MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 74076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_006396	CGT	2	6	147830	147835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377093
3502	NC_006396	GTC	2	6	147903	147908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377093
3503	NC_006396	TCG	2	6	147976	147981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377093
3504	NC_006396	CGA	2	6	148019	148024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377093
3505	NC_006396	TCGGCG	2	12	148093	148104	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55377093
3506	NC_006396	GCG	2	6	148119	148124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377093
3507	NC_006396	CGA	2	6	148136	148141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377093
3508	NC_006396	CTG	2	6	148170	148175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377093
3509	NC_006396	GTC	2	6	148205	148210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377093
3510	NC_006396	AGC	2	6	148304	148309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377093
3511	NC_006396	CGG	2	6	148345	148350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377094
3512	NC_006396	CGT	2	6	148353	148358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377094
3513	NC_006396	CCG	2	6	148396	148401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377094
3514	NC_006396	CGA	2	6	148427	148432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377094
3515	NC_006396	TGT	2	6	148460	148465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55377094
3516	NC_006396	ACC	2	6	148495	148500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55377094
3517	NC_006396	GTC	3	9	148521	148529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377094
3518	NC_006396	CGA	2	6	148559	148564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377094
3519	NC_006396	ACG	2	6	148603	148608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377094
3520	NC_006396	CCT	2	6	148661	148666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377094
3521	NC_006396	AACC	2	8	148697	148704	50 %	0 %	0 %	50 %	55377094
3522	NC_006396	CTG	2	6	148709	148714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377094
3523	NC_006396	TCGTC	2	10	148745	148754	0 %	40 %	20 %	40 %	55377094
3524	NC_006396	TCG	2	6	148772	148777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377094
3525	NC_006396	GA	3	6	148781	148786	50 %	0 %	50 %	0 %	55377094
3526	NC_006396	GCT	2	6	148796	148801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377094
3527	NC_006396	GCAA	2	8	148810	148817	50 %	0 %	25 %	25 %	55377094
3528	NC_006396	GC	3	6	148823	148828	0 %	0 %	50 %	50 %	55377094
3529	NC_006396	TCG	2	6	148880	148885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377094
3530	NC_006396	CGG	2	6	148939	148944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377094
3531	NC_006396	GTC	2	6	148967	148972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377094
3532	NC_006396	GGTC	2	8	149040	149047	0 %	25 %	50 %	25 %	55377094
3533	NC_006396	ACC	2	6	149056	149061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55377094
3534	NC_006396	GCC	2	6	149110	149115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377094
3535	NC_006396	GT	3	6	149120	149125	0 %	50 %	50 %	0 %	55377094
3536	NC_006396	GC	3	6	149141	149146	0 %	0 %	50 %	50 %	55377094
3537	NC_006396	CG	3	6	149169	149174	0 %	0 %	50 %	50 %	55377094
3538	NC_006396	GTC	2	6	149196	149201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377094
3539	NC_006396	CCG	2	6	149267	149272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377094
3540	NC_006396	CTG	2	6	149355	149360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377094
3541	NC_006396	GC	3	6	149378	149383	0 %	0 %	50 %	50 %	55377094
3542	NC_006396	CTG	2	6	149416	149421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_006396	GCTG	2	8	149429	149436	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3544	NC_006396	CTAAT	2	10	149465	149474	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3545	NC_006396	ACAT	2	8	149478	149485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3546	NC_006396	TGG	2	6	149492	149497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_006396	CGG	2	6	149555	149560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_006396	TCG	2	6	149611	149616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3549	NC_006396	ACG	2	6	149626	149631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3550	NC_006396	TGG	2	6	149639	149644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55377095
3551	NC_006396	GTT	2	6	149658	149663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55377095
3552	NC_006396	ATT	2	6	149682	149687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55377095
3553	NC_006396	CGA	2	6	149825	149830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3554	NC_006396	AGC	2	6	149944	149949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3555	NC_006396	CGA	2	6	149999	150004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3556	NC_006396	CCGG	2	8	150021	150028	0 %	0 %	50 %	50 %	55377095
3557	NC_006396	CCG	2	6	150298	150303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377095
3558	NC_006396	AGG	2	6	150328	150333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377095
3559	NC_006396	GAT	2	6	150393	150398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377095
3560	NC_006396	TCG	2	6	150409	150414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3561	NC_006396	CGA	2	6	150422	150427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3562	NC_006396	CTG	2	6	150444	150449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3563	NC_006396	TCG	2	6	150454	150459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3564	NC_006396	ACG	4	12	150514	150525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3565	NC_006396	GCT	2	6	150563	150568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3566	NC_006396	CGG	2	6	150569	150574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377095
3567	NC_006396	TCG	2	6	150595	150600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3568	NC_006396	CTG	2	6	150603	150608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3569	NC_006396	CCG	2	6	150613	150618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377095
3570	NC_006396	GGT	2	6	150639	150644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55377095
3571	NC_006396	CGTG	2	8	150665	150672	0 %	25 %	50 %	25 %	55377095
3572	NC_006396	GAG	2	6	150705	150710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377095
3573	NC_006396	GCC	2	6	150729	150734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377095
3574	NC_006396	GCC	2	6	150765	150770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377095
3575	NC_006396	GC	3	6	150782	150787	0 %	0 %	50 %	50 %	55377095
3576	NC_006396	GTT	2	6	150792	150797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55377095
3577	NC_006396	CAG	2	6	150825	150830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3578	NC_006396	TCG	2	6	150838	150843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3579	NC_006396	TCA	2	6	150862	150867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377095
3580	NC_006396	AGG	2	6	150877	150882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377095
3581	NC_006396	CGG	2	6	150908	150913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377095
3582	NC_006396	GCC	2	6	150924	150929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377095
3583	NC_006396	TCG	2	6	150952	150957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3584	NC_006396	GCT	2	6	150965	150970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377095
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3586	NC_006396	TCG	2	6	151018	151023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3587	NC_006396	TGAAC	2	10	151076	151085	40 %	20 %	20 %	20 %	55377095
3588	NC_006396	CCG	2	6	151102	151107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377095
3589	NC_006396	ATC	2	6	151192	151197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377095
3590	NC_006396	GTC	2	6	151206	151211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3591	NC_006396	CGT	2	6	151260	151265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3592	NC_006396	CGG	2	6	151359	151364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377095
3593	NC_006396	GTT	2	6	151422	151427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55377095
3594	NC_006396	AC	3	6	151456	151461	50 %	0 %	0 %	50 %	55377095
3595	NC_006396	GTC	3	9	151473	151481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3596	NC_006396	GAA	2	6	151548	151553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55377095
3597	NC_006396	CGTCG	2	10	151623	151632	0 %	20 %	40 %	40 %	55377095
3598	NC_006396	GCC	2	6	151648	151653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377095
3599	NC_006396	CG	3	6	151670	151675	0 %	0 %	50 %	50 %	55377095
3600	NC_006396	CAG	2	6	151719	151724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3601	NC_006396	GT	3	6	151734	151739	0 %	50 %	50 %	0 %	55377095
3602	NC_006396	CGG	2	6	151842	151847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377095
3603	NC_006396	CGA	2	6	152015	152020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377095
3604	NC_006396	CGG	2	6	152045	152050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377095
3605	NC_006396	CCG	2	6	152112	152117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377095
3606	NC_006396	TCA	2	6	152134	152139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377095
3607	NC_006396	TAA	2	6	152182	152187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_006396	GT	3	6	152205	152210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_006396	GCC	2	6	152230	152235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_006396	CTGA	2	8	152253	152260	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3611	NC_006396	TGC	2	6	152261	152266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_006396	CGT	2	6	152346	152351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377096
3613	NC_006396	GGCC	2	8	152410	152417	0 %	0 %	50 %	50 %	55377096
3614	NC_006396	GTC	2	6	152422	152427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377096
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3617	NC_006396	GAA	2	6	152515	152520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55377096
3618	NC_006396	CAG	2	6	152539	152544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377096
3619	NC_006396	CGG	2	6	152592	152597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377096
3620	NC_006396	GGC	2	6	152625	152630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377096
3621	NC_006396	CGA	2	6	152631	152636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377096
3622	NC_006396	ACG	2	6	152678	152683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377096
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3991	NC_006396	CGC	2	6	167683	167688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377106
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3996	NC_006396	TCG	2	6	167826	167831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377106
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3999	NC_006396	CCT	2	6	167908	167913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377106
4000	NC_006396	ACC	2	6	168031	168036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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