MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 74076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006396	ACTC	2	8	22108	22115	25 %	25 %	0 %	50 %	55376963
502	NC_006396	GCGG	2	8	22225	22232	0 %	0 %	75 %	25 %	55376963
503	NC_006396	TCGCG	2	10	22258	22267	0 %	20 %	40 %	40 %	55376963
504	NC_006396	TCC	2	6	22272	22277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376963
505	NC_006396	GC	3	6	22302	22307	0 %	0 %	50 %	50 %	55376963
506	NC_006396	CGG	2	6	22333	22338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376963
507	NC_006396	TCA	2	6	22347	22352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376963
508	NC_006396	TCC	2	6	22371	22376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376963
509	NC_006396	TG	3	6	22448	22453	0 %	50 %	50 %	0 %	55376963
510	NC_006396	GCC	2	6	22460	22465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376963
511	NC_006396	CGG	2	6	22509	22514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376963
512	NC_006396	CAG	2	6	22556	22561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376963
513	NC_006396	GCC	2	6	22577	22582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376963
514	NC_006396	GAG	2	6	22584	22589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376963
515	NC_006396	CTC	2	6	22679	22684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376963
516	NC_006396	CAG	2	6	22694	22699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376963
517	NC_006396	GTC	2	6	22733	22738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376963
518	NC_006396	CTC	2	6	22784	22789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376963
519	NC_006396	GGA	2	6	22852	22857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376963
520	NC_006396	CGG	2	6	22873	22878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376963
521	NC_006396	CTC	3	9	23000	23008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376963
522	NC_006396	AGC	2	6	23010	23015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376963
523	NC_006396	ACCG	2	8	23027	23034	25 %	0 %	25 %	50 %	55376963
524	NC_006396	CGT	2	6	23059	23064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376963
525	NC_006396	GTG	2	6	23094	23099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376963
526	NC_006396	CGA	3	9	23110	23118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376963
527	NC_006396	ATG	2	6	23127	23132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376963
528	NC_006396	CGT	2	6	23180	23185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376963
529	NC_006396	CGGTG	2	10	23208	23217	0 %	20 %	60 %	20 %	55376963
530	NC_006396	TCG	2	6	23220	23225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376963
531	NC_006396	TCC	2	6	23226	23231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376963
532	NC_006396	CGA	2	6	23233	23238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376963
533	NC_006396	GTCGT	2	10	23244	23253	0 %	40 %	40 %	20 %	55376963
534	NC_006396	CTC	2	6	23288	23293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376963
535	NC_006396	GCC	2	6	23298	23303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376963
536	NC_006396	TCG	2	6	23304	23309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376963
537	NC_006396	CT	3	6	23364	23369	0 %	50 %	0 %	50 %	55376963
538	NC_006396	TCG	3	9	23383	23391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376963
539	NC_006396	TCG	2	6	23410	23415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376963
540	NC_006396	CGA	2	6	23449	23454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376963
541	NC_006396	CTC	2	6	23462	23467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376963
542	NC_006396	A	6	6	23512	23517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_006396	CGC	3	9	23535	23543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_006396	GCTG	2	8	23578	23585	0 %	25 %	50 %	25 %	55376964
545	NC_006396	GGT	2	6	23597	23602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376964
546	NC_006396	GTT	2	6	23604	23609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376964
547	NC_006396	TCG	2	6	23635	23640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376964
548	NC_006396	CTG	2	6	23650	23655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376964
549	NC_006396	CGCC	2	8	23671	23678	0 %	0 %	25 %	75 %	55376964
550	NC_006396	CAG	2	6	23689	23694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376964
551	NC_006396	CGC	2	6	23725	23730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376964
552	NC_006396	CCT	2	6	23765	23770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376964
553	NC_006396	CTAC	2	8	23803	23810	25 %	25 %	0 %	50 %	55376964
554	NC_006396	CAG	2	6	23852	23857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376964
555	NC_006396	TCCG	2	8	23859	23866	0 %	25 %	25 %	50 %	55376964
556	NC_006396	CGA	2	6	23909	23914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376964
557	NC_006396	GAC	2	6	23927	23932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376964
558	NC_006396	GCG	2	6	24031	24036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376964
559	NC_006396	CGG	2	6	24137	24142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376964
560	NC_006396	CGG	2	6	24167	24172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376964
561	NC_006396	AGA	2	6	24197	24202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376964
562	NC_006396	CTG	2	6	24216	24221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376964
563	NC_006396	GTACC	2	10	24260	24269	20 %	20 %	20 %	40 %	55376964
564	NC_006396	TCG	2	6	24280	24285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376964
565	NC_006396	AGCGG	2	10	24323	24332	20 %	0 %	60 %	20 %	55376964
566	NC_006396	TGAG	2	8	24366	24373	25 %	25 %	50 %	0 %	55376964
567	NC_006396	CGCA	2	8	24389	24396	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
568	NC_006396	GTCT	2	8	24412	24419	0 %	50 %	25 %	25 %	55376965
569	NC_006396	GTC	2	6	24460	24465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376965
570	NC_006396	GTA	2	6	24466	24471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376965
571	NC_006396	GTC	3	9	24487	24495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376965
572	NC_006396	AG	3	6	24509	24514	50 %	0 %	50 %	0 %	55376965
573	NC_006396	CTCA	2	8	24568	24575	25 %	25 %	0 %	50 %	55376965
574	NC_006396	GAC	2	6	24628	24633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376965
575	NC_006396	ACA	2	6	24704	24709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_006396	A	6	6	24727	24732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_006396	TAT	2	6	24733	24738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_006396	CGGT	2	8	24779	24786	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
579	NC_006396	CTA	2	6	24797	24802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_006396	AT	3	6	24846	24851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_006396	GAC	2	6	24882	24887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376966
582	NC_006396	ATCA	2	8	24897	24904	50 %	25 %	0 %	25 %	55376966
583	NC_006396	CGG	2	6	24913	24918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376966
584	NC_006396	CT	3	6	24945	24950	0 %	50 %	0 %	50 %	55376966
585	NC_006396	AAC	2	6	24994	24999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376966
586	NC_006396	TCG	2	6	25036	25041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376966
587	NC_006396	GAG	2	6	25050	25055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376966
588	NC_006396	CGT	2	6	25058	25063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376966
589	NC_006396	TCCA	2	8	25126	25133	25 %	25 %	0 %	50 %	55376966
590	NC_006396	CGAA	2	8	25234	25241	50 %	0 %	25 %	25 %	55376966
591	NC_006396	GATTCG	2	12	25264	25275	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55376966
592	NC_006396	CGA	2	6	25283	25288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376966
593	NC_006396	CGG	2	6	25304	25309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376966
594	NC_006396	GGC	2	6	25402	25407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_006396	CAG	2	6	25445	25450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_006396	GGGACC	2	12	25496	25507	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_006396	CGCT	2	8	25551	25558	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
598	NC_006396	CGT	2	6	25581	25586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_006396	GCG	2	6	25590	25595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_006396	CGCTC	2	10	25629	25638	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
601	NC_006396	CG	3	6	25726	25731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
602	NC_006396	CTC	2	6	25742	25747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376967
603	NC_006396	TCT	2	6	25771	25776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376967
604	NC_006396	CGT	2	6	25789	25794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376967
605	NC_006396	TCG	2	6	25806	25811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376967
606	NC_006396	TCA	2	6	25851	25856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376967
607	NC_006396	CTT	2	6	25865	25870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376967
608	NC_006396	TGCTC	2	10	25930	25939	0 %	40 %	20 %	40 %	55376967
609	NC_006396	CGA	2	6	25981	25986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376967
610	NC_006396	GCT	2	6	26006	26011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376967
611	NC_006396	CGG	2	6	26107	26112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376967
612	NC_006396	CGT	2	6	26113	26118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376967
613	NC_006396	CGA	2	6	26122	26127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376967
614	NC_006396	GAG	2	6	26190	26195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376967
615	NC_006396	GC	3	6	26305	26310	0 %	0 %	50 %	50 %	55376967
616	NC_006396	CGT	2	6	26329	26334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376967
617	NC_006396	GGC	2	6	26336	26341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376967
618	NC_006396	GGTC	2	8	26380	26387	0 %	25 %	50 %	25 %	55376967
619	NC_006396	GGGT	2	8	26427	26434	0 %	25 %	75 %	0 %	55376967
620	NC_006396	TGCG	2	8	26526	26533	0 %	25 %	50 %	25 %	55376967
621	NC_006396	GCGTC	2	10	26566	26575	0 %	20 %	40 %	40 %	55376967
622	NC_006396	GAC	2	6	26600	26605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376967
623	NC_006396	TCT	2	6	26619	26624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376967
624	NC_006396	TCA	2	6	26637	26642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376967
625	NC_006396	GA	3	6	26687	26692	50 %	0 %	50 %	0 %	55376967
626	NC_006396	CGT	2	6	26719	26724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376967
627	NC_006396	CCG	2	6	26784	26789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376967
628	NC_006396	CGA	2	6	26837	26842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376967
629	NC_006396	GTC	2	6	26882	26887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376967
630	NC_006396	TCG	2	6	26907	26912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376967
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744	NC_006396	CAG	2	6	31354	31359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376971
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752	NC_006396	TCG	2	6	31619	31624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376971
753	NC_006396	CCT	2	6	31725	31730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376971
754	NC_006396	TGG	2	6	31740	31745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376971
755	NC_006396	CGT	3	9	31774	31782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376971
756	NC_006396	CGA	2	6	31818	31823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376971
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758	NC_006396	TC	3	6	31924	31929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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