MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG700

Total Repeats: 6291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006395	AGG	2	6	212	217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006395	ACC	2	6	223	228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_006395	CCA	2	6	338	343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_006395	TGA	2	6	354	359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376580
5	NC_006395	GAA	2	6	395	400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376580
6	NC_006395	CGC	2	6	496	501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376580
7	NC_006395	CAG	2	6	542	547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376580
8	NC_006395	GAC	2	6	625	630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376581
9	NC_006395	CGG	2	6	696	701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376581
10	NC_006395	CGG	2	6	768	773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376581
11	NC_006395	CTA	2	6	879	884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376581
12	NC_006395	CGA	2	6	885	890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376581
13	NC_006395	TGG	2	6	972	977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376581
14	NC_006395	ATT	2	6	1130	1135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376581
15	NC_006395	GCG	2	6	1139	1144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376581
16	NC_006395	CCA	2	6	1155	1160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376581
17	NC_006395	ATC	2	6	1352	1357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376581
18	NC_006395	CGA	2	6	1389	1394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376581
19	NC_006395	TCA	2	6	1427	1432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376581
20	NC_006395	TGG	2	6	1452	1457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376581
21	NC_006395	TGA	2	6	1587	1592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376581
22	NC_006395	CGG	2	6	1728	1733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376581
23	NC_006395	GTT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376581
24	NC_006395	ACA	2	6	2218	2223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376581
25	NC_006395	GAC	2	6	2475	2480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376581
26	NC_006395	GAG	2	6	2569	2574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376581
27	NC_006395	ACG	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376581
28	NC_006395	CTG	2	6	2729	2734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376581
29	NC_006395	TGA	2	6	2832	2837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376581
30	NC_006395	GTC	2	6	2896	2901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376581
31	NC_006395	ACG	2	6	2902	2907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376581
32	NC_006395	CTC	2	6	2908	2913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376581
33	NC_006395	GTG	2	6	2926	2931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376581
34	NC_006395	CGA	2	6	3003	3008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376581
35	NC_006395	AGC	2	6	3202	3207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376582
36	NC_006395	GTC	2	6	3238	3243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376582
37	NC_006395	TGA	2	6	3357	3362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376582
38	NC_006395	CCG	2	6	3392	3397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376582
39	NC_006395	TCG	2	6	3516	3521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376582
40	NC_006395	CCA	2	6	3560	3565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376582
41	NC_006395	ATC	3	9	3584	3592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376582
42	NC_006395	CTC	2	6	3694	3699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376582
43	NC_006395	CAC	2	6	3765	3770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376582
44	NC_006395	CGG	2	6	3804	3809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376582
45	NC_006395	GTT	2	6	3819	3824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376582
46	NC_006395	TAC	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376582
47	NC_006395	ATA	2	6	4168	4173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55376582
48	NC_006395	TCC	2	6	4570	4575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_006395	AAC	2	6	4611	4616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006395	AAT	2	6	4626	4631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006395	ATA	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006395	CTC	2	6	4703	4708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_006395	GTT	2	6	4767	4772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376583
54	NC_006395	ACT	2	6	4970	4975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376583
55	NC_006395	GTG	2	6	4992	4997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376583
56	NC_006395	CGG	2	6	5012	5017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376583
57	NC_006395	TCG	2	6	5025	5030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376583
58	NC_006395	GTG	2	6	5066	5071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376583
59	NC_006395	CAC	2	6	5240	5245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376583
60	NC_006395	ACA	2	6	5317	5322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376583
61	NC_006395	GAT	2	6	5336	5341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376583
62	NC_006395	ATA	2	6	5404	5409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55376583
63	NC_006395	ACC	2	6	5430	5435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376583
64	NC_006395	GGA	2	6	5569	5574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376583
65	NC_006395	CGA	2	6	5591	5596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376583
66	NC_006395	TGC	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376583
67	NC_006395	GTC	2	6	6031	6036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376583
68	NC_006395	GTA	2	6	6077	6082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376583
69	NC_006395	CAG	2	6	6083	6088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376583
70	NC_006395	CGT	2	6	6119	6124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376583
71	NC_006395	CGG	2	6	6173	6178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376583
72	NC_006395	GAC	2	6	6206	6211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376583
73	NC_006395	CGT	2	6	6338	6343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376583
74	NC_006395	CAA	2	6	6400	6405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376583
75	NC_006395	ACG	2	6	6421	6426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376583
76	NC_006395	AGC	2	6	6501	6506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376583
77	NC_006395	TCG	2	6	6591	6596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_006395	GAT	2	6	6629	6634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006395	GCC	2	6	6716	6721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_006395	GAA	2	6	6723	6728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006395	TGA	2	6	6778	6783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006395	AGG	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006395	CCG	2	6	6856	6861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_006395	CGA	2	6	7003	7008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_006395	GAC	2	6	7031	7036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_006395	TCC	2	6	7064	7069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_006395	AGC	2	6	7184	7189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_006395	CTG	2	6	7296	7301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376584
89	NC_006395	ATA	2	6	7397	7402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55376584
90	NC_006395	GTA	2	6	7491	7496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376584
91	NC_006395	CCG	2	6	7508	7513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376584
92	NC_006395	TGC	2	6	7583	7588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376584
93	NC_006395	GAA	2	6	7659	7664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376584
94	NC_006395	TCG	2	6	7696	7701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376584
95	NC_006395	TGT	2	6	7725	7730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376584
96	NC_006395	TGT	2	6	7818	7823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376584
97	NC_006395	ACA	2	6	7858	7863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376584
98	NC_006395	GTC	2	6	7929	7934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376584
99	NC_006395	AGC	2	6	7989	7994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376584
100	NC_006395	CGA	3	9	8099	8107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376584
101	NC_006395	TGT	2	6	8117	8122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376584
102	NC_006395	GGT	2	6	8258	8263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006395	CTA	2	6	8293	8298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_006395	CTG	2	6	8360	8365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_006395	TGA	2	6	8472	8477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006395	CAT	2	6	8491	8496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_006395	AAG	2	6	8515	8520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006395	TGA	2	6	8633	8638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376585
109	NC_006395	CCT	2	6	8681	8686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376585
110	NC_006395	GTC	2	6	8712	8717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376585
111	NC_006395	GAG	2	6	8754	8759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376585
112	NC_006395	GCT	3	9	8913	8921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376585
113	NC_006395	GAT	2	6	9141	9146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376585
114	NC_006395	TTA	2	6	9166	9171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376585
115	NC_006395	ATT	2	6	9382	9387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376585
116	NC_006395	CAC	2	6	9408	9413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376585
117	NC_006395	CAC	2	6	9416	9421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376585
118	NC_006395	CCG	2	6	9593	9598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376585
119	NC_006395	ACC	2	6	9604	9609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376585
120	NC_006395	TGA	2	6	9641	9646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376585
121	NC_006395	ATG	2	6	9730	9735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376585
122	NC_006395	ACA	2	6	9741	9746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376585
123	NC_006395	GGA	2	6	9833	9838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376585
124	NC_006395	TTA	2	6	9847	9852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376585
125	NC_006395	TCA	2	6	9939	9944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376585
126	NC_006395	AAT	2	6	9975	9980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55376585
127	NC_006395	GGA	2	6	9984	9989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376585
128	NC_006395	ACA	2	6	10179	10184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_006395	CCG	2	6	10261	10266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376586
130	NC_006395	CTG	2	6	10271	10276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376586
131	NC_006395	TGG	2	6	10316	10321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376586
132	NC_006395	ACG	2	6	10331	10336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376586
133	NC_006395	CTA	2	6	10345	10350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376586
134	NC_006395	GAT	2	6	10503	10508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376586
135	NC_006395	TCT	2	6	10599	10604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_006395	GAA	2	6	10617	10622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_006395	GAG	2	6	20180	20185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
262	NC_006395	CTG	2	6	20391	20396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_006395	GTG	2	6	20584	20589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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