MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG500

Total Repeats: 235

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006393	GC	3	6	893	898	0 %	0 %	50 %	50 %	55376281
2	NC_006393	CG	3	6	1013	1018	0 %	0 %	50 %	50 %	55376281
3	NC_006393	CT	3	6	1318	1323	0 %	50 %	0 %	50 %	55376282
4	NC_006393	GC	3	6	1522	1527	0 %	0 %	50 %	50 %	55376282
5	NC_006393	GC	3	6	2690	2695	0 %	0 %	50 %	50 %	55376283
6	NC_006393	GA	3	6	2888	2893	50 %	0 %	50 %	0 %	55376283
7	NC_006393	TG	3	6	3769	3774	0 %	50 %	50 %	0 %	55376284
8	NC_006393	CG	3	6	5709	5714	0 %	0 %	50 %	50 %	55376286
9	NC_006393	GT	3	6	6370	6375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006393	TC	3	6	7389	7394	0 %	50 %	0 %	50 %	55376287
11	NC_006393	CT	3	6	7814	7819	0 %	50 %	0 %	50 %	55376287
12	NC_006393	AC	3	6	10602	10607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_006393	GA	3	6	11533	11538	50 %	0 %	50 %	0 %	55376289
14	NC_006393	AC	3	6	11682	11687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_006393	AG	3	6	11881	11886	50 %	0 %	50 %	0 %	55376290
16	NC_006393	GT	3	6	11994	11999	0 %	50 %	50 %	0 %	55376290
17	NC_006393	CT	4	8	13215	13222	0 %	50 %	0 %	50 %	55376291
18	NC_006393	TC	3	6	14365	14370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_006393	GC	3	6	14986	14991	0 %	0 %	50 %	50 %	55376293
20	NC_006393	CT	3	6	15630	15635	0 %	50 %	0 %	50 %	55376293
21	NC_006393	AT	4	8	15672	15679	50 %	50 %	0 %	0 %	55376293
22	NC_006393	AT	3	6	16241	16246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006393	TG	3	6	16465	16470	0 %	50 %	50 %	0 %	55376294
24	NC_006393	CG	4	8	16966	16973	0 %	0 %	50 %	50 %	55376294
25	NC_006393	GT	3	6	17272	17277	0 %	50 %	50 %	0 %	55376294
26	NC_006393	AC	3	6	17577	17582	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_006393	TC	3	6	17734	17739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_006393	GA	3	6	17818	17823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006393	GC	3	6	18357	18362	0 %	0 %	50 %	50 %	55376295
30	NC_006393	CG	3	6	18386	18391	0 %	0 %	50 %	50 %	55376295
31	NC_006393	GA	3	6	18426	18431	50 %	0 %	50 %	0 %	55376295
32	NC_006393	GA	3	6	18848	18853	50 %	0 %	50 %	0 %	55376295
33	NC_006393	GC	3	6	19159	19164	0 %	0 %	50 %	50 %	55376295
34	NC_006393	AG	3	6	21326	21331	50 %	0 %	50 %	0 %	55376298
35	NC_006393	AC	3	6	21364	21369	50 %	0 %	0 %	50 %	55376298
36	NC_006393	GA	3	6	22399	22404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006393	GA	3	6	22769	22774	50 %	0 %	50 %	0 %	55376300
38	NC_006393	AC	3	6	24035	24040	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_006393	GC	3	6	25231	25236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_006393	AC	3	6	25884	25889	50 %	0 %	0 %	50 %	55376302
41	NC_006393	AC	3	6	25920	25925	50 %	0 %	0 %	50 %	55376302
42	NC_006393	AC	3	6	26626	26631	50 %	0 %	0 %	50 %	55376304
43	NC_006393	GT	3	6	26737	26742	0 %	50 %	50 %	0 %	55376304
44	NC_006393	GA	3	6	27072	27077	50 %	0 %	50 %	0 %	55376304
45	NC_006393	AT	3	6	27350	27355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006393	CA	4	8	27392	27399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_006393	TC	3	6	27617	27622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_006393	GC	4	8	29427	29434	0 %	0 %	50 %	50 %	55376306
49	NC_006393	GC	3	6	29449	29454	0 %	0 %	50 %	50 %	55376306
50	NC_006393	AC	3	6	30268	30273	50 %	0 %	0 %	50 %	55376308
51	NC_006393	AG	3	6	30473	30478	50 %	0 %	50 %	0 %	55376308
52	NC_006393	AT	3	6	30769	30774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006393	CA	3	6	31917	31922	50 %	0 %	0 %	50 %	55376311
54	NC_006393	AC	3	6	32042	32047	50 %	0 %	0 %	50 %	55376311
55	NC_006393	GA	3	6	33029	33034	50 %	0 %	50 %	0 %	55376314
56	NC_006393	CT	3	6	34055	34060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_006393	GA	3	6	34436	34441	50 %	0 %	50 %	0 %	55376315
58	NC_006393	GA	3	6	35285	35290	50 %	0 %	50 %	0 %	55376316
59	NC_006393	CT	3	6	35393	35398	0 %	50 %	0 %	50 %	55376316
60	NC_006393	TG	3	6	35458	35463	0 %	50 %	50 %	0 %	55376316
61	NC_006393	TC	3	6	36116	36121	0 %	50 %	0 %	50 %	55376317
62	NC_006393	GA	3	6	36269	36274	50 %	0 %	50 %	0 %	55376317
63	NC_006393	GC	3	6	36489	36494	0 %	0 %	50 %	50 %	55376317
64	NC_006393	CG	3	6	37513	37518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_006393	AC	3	6	37680	37685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_006393	CA	3	6	37774	37779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_006393	CG	3	6	37812	37817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_006393	AT	3	6	38652	38657	50 %	50 %	0 %	0 %	55376319
69	NC_006393	AG	3	6	38989	38994	50 %	0 %	50 %	0 %	55376320
70	NC_006393	CA	3	6	40044	40049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_006393	AT	3	6	40115	40120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006393	AG	4	8	40385	40392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006393	CT	3	6	41470	41475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_006393	AC	3	6	41871	41876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_006393	GA	3	6	42023	42028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006393	CA	3	6	42117	42122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_006393	TC	3	6	42595	42600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_006393	CT	3	6	42638	42643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_006393	GT	3	6	43822	43827	0 %	50 %	50 %	0 %	55376326
80	NC_006393	AG	3	6	44562	44567	50 %	0 %	50 %	0 %	55376326
81	NC_006393	AT	3	6	44793	44798	50 %	50 %	0 %	0 %	55376326
82	NC_006393	TC	3	6	45109	45114	0 %	50 %	0 %	50 %	55376327
83	NC_006393	CA	3	6	45945	45950	50 %	0 %	0 %	50 %	55376329
84	NC_006393	AG	3	6	46213	46218	50 %	0 %	50 %	0 %	55376329
85	NC_006393	CT	3	6	46435	46440	0 %	50 %	0 %	50 %	55376329
86	NC_006393	AG	3	6	46751	46756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006393	TC	4	8	47043	47050	0 %	50 %	0 %	50 %	55376331
88	NC_006393	CT	3	6	47216	47221	0 %	50 %	0 %	50 %	55376331
89	NC_006393	GA	3	6	47897	47902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006393	AG	3	6	48608	48613	50 %	0 %	50 %	0 %	55376333
91	NC_006393	TC	4	8	50248	50255	0 %	50 %	0 %	50 %	55376335
92	NC_006393	TC	3	6	50648	50653	0 %	50 %	0 %	50 %	55376335
93	NC_006393	CG	3	6	50963	50968	0 %	0 %	50 %	50 %	55376335
94	NC_006393	GA	3	6	51183	51188	50 %	0 %	50 %	0 %	55376335
95	NC_006393	GT	3	6	51959	51964	0 %	50 %	50 %	0 %	55376336
96	NC_006393	AG	3	6	52613	52618	50 %	0 %	50 %	0 %	55376336
97	NC_006393	AG	3	6	52921	52926	50 %	0 %	50 %	0 %	55376336
98	NC_006393	TA	3	6	53072	53077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006393	CA	3	6	53318	53323	50 %	0 %	0 %	50 %	55376337
100	NC_006393	GT	3	6	57396	57401	0 %	50 %	50 %	0 %	55376338
101	NC_006393	AG	3	6	57505	57510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006393	AT	3	6	58234	58239	50 %	50 %	0 %	0 %	55376339
103	NC_006393	CA	3	6	59061	59066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_006393	GA	3	6	59151	59156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006393	AT	3	6	59290	59295	50 %	50 %	0 %	0 %	55376340
106	NC_006393	GA	3	6	59688	59693	50 %	0 %	50 %	0 %	55376341
107	NC_006393	AG	3	6	59730	59735	50 %	0 %	50 %	0 %	55376341
108	NC_006393	AG	3	6	60713	60718	50 %	0 %	50 %	0 %	55376341
109	NC_006393	AT	3	6	63166	63171	50 %	50 %	0 %	0 %	55376342
110	NC_006393	TC	3	6	64003	64008	0 %	50 %	0 %	50 %	55376343
111	NC_006393	AC	3	6	64144	64149	50 %	0 %	0 %	50 %	55376344
112	NC_006393	CA	3	6	64238	64243	50 %	0 %	0 %	50 %	55376344
113	NC_006393	CG	3	6	64276	64281	0 %	0 %	50 %	50 %	55376344
114	NC_006393	TG	3	6	64441	64446	0 %	50 %	50 %	0 %	55376344
115	NC_006393	GC	3	6	65583	65588	0 %	0 %	50 %	50 %	55376346
116	NC_006393	GT	3	6	68265	68270	0 %	50 %	50 %	0 %	55376350
117	NC_006393	CT	3	6	68819	68824	0 %	50 %	0 %	50 %	55376350
118	NC_006393	AT	3	6	69189	69194	50 %	50 %	0 %	0 %	55376350
119	NC_006393	TC	3	6	69543	69548	0 %	50 %	0 %	50 %	55376350
120	NC_006393	AT	3	6	69665	69670	50 %	50 %	0 %	0 %	55376350
121	NC_006393	CG	3	6	70157	70162	0 %	0 %	50 %	50 %	55376351
122	NC_006393	TC	3	6	71281	71286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_006393	TC	3	6	71371	71376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_006393	AT	4	8	72174	72181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006393	AC	3	6	72454	72459	50 %	0 %	0 %	50 %	55376353
126	NC_006393	TC	3	6	73977	73982	0 %	50 %	0 %	50 %	55376354
127	NC_006393	AC	3	6	74955	74960	50 %	0 %	0 %	50 %	55376354
128	NC_006393	CA	3	6	75327	75332	50 %	0 %	0 %	50 %	55376355
129	NC_006393	GA	3	6	75841	75846	50 %	0 %	50 %	0 %	55376356
130	NC_006393	AT	3	6	77391	77396	50 %	50 %	0 %	0 %	55376356
131	NC_006393	GC	3	6	81004	81009	0 %	0 %	50 %	50 %	55376358
132	NC_006393	GA	3	6	81088	81093	50 %	0 %	50 %	0 %	55376359
133	NC_006393	GA	3	6	81224	81229	50 %	0 %	50 %	0 %	55376359
134	NC_006393	GA	3	6	81459	81464	50 %	0 %	50 %	0 %	55376359
135	NC_006393	GA	3	6	82212	82217	50 %	0 %	50 %	0 %	55376360
136	NC_006393	TC	3	6	82785	82790	0 %	50 %	0 %	50 %	55376361
137	NC_006393	TC	3	6	83922	83927	0 %	50 %	0 %	50 %	55376361
138	NC_006393	AG	4	8	84137	84144	50 %	0 %	50 %	0 %	55376361
139	NC_006393	TC	3	6	84589	84594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_006393	AT	3	6	84968	84973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006393	GC	3	6	85363	85368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_006393	CG	3	6	85458	85463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_006393	CA	3	6	86214	86219	50 %	0 %	0 %	50 %	55376363
144	NC_006393	CT	4	8	86429	86436	0 %	50 %	0 %	50 %	55376364
145	NC_006393	CA	3	6	86505	86510	50 %	0 %	0 %	50 %	55376364
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147	NC_006393	CG	3	6	86758	86763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_006393	CT	3	6	86843	86848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_006393	GC	3	6	86908	86913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.