MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG300

Total Repeats: 607

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006391	GCG	2	6	20	25	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_006391	GAA	2	6	66	71	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006391	TGA	2	6	160	165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376188
4	NC_006391	AAC	2	6	183	188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
5	NC_006391	GTC	2	6	215	220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
6	NC_006391	CGC	2	6	232	237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376188
7	NC_006391	CGA	2	6	313	318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
8	NC_006391	CGA	2	6	370	375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
9	NC_006391	CGG	2	6	471	476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
10	NC_006391	CGA	2	6	538	543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
11	NC_006391	CGT	2	6	616	621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
12	NC_006391	AAG	2	6	654	659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376188
13	NC_006391	CGA	2	6	708	713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
14	NC_006391	CGG	2	6	727	732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
15	NC_006391	CGA	2	6	759	764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
16	NC_006391	ACG	2	6	770	775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
17	NC_006391	ACG	2	6	968	973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
18	NC_006391	CAA	2	6	1080	1085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
19	NC_006391	CGA	2	6	1128	1133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
20	NC_006391	AAC	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
21	NC_006391	GTC	2	6	1204	1209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
22	NC_006391	CAA	2	6	1294	1299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
23	NC_006391	GTG	2	6	1389	1394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376188
24	NC_006391	TCA	2	6	1544	1549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376188
25	NC_006391	CTG	2	6	1599	1604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
26	NC_006391	ACG	2	6	1737	1742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
27	NC_006391	GCA	2	6	1745	1750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
28	NC_006391	CAG	2	6	1809	1814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
29	NC_006391	CAA	2	6	2104	2109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
30	NC_006391	GCG	2	6	2136	2141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
31	NC_006391	GAC	2	6	2254	2259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
32	NC_006391	ACG	2	6	2292	2297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
33	NC_006391	TCG	2	6	2391	2396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
34	NC_006391	TCA	3	9	2466	2474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376188
35	NC_006391	GAC	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
36	NC_006391	AGC	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
37	NC_006391	AAC	2	6	2564	2569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
38	NC_006391	CGT	2	6	2575	2580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
39	NC_006391	ACC	2	6	2637	2642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376188
40	NC_006391	GAC	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
41	NC_006391	CAT	2	6	2767	2772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376188
42	NC_006391	CGG	2	6	2809	2814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
43	NC_006391	CGG	2	6	2887	2892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
44	NC_006391	CGG	2	6	3105	3110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
45	NC_006391	CCA	2	6	3267	3272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376188
46	NC_006391	ACA	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
47	NC_006391	GGT	2	6	3445	3450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376188
48	NC_006391	CGG	2	6	3487	3492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
49	NC_006391	CGA	2	6	3498	3503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
50	NC_006391	TCG	2	6	3531	3536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
51	NC_006391	GCC	2	6	3582	3587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376188
52	NC_006391	GCC	2	6	3641	3646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376188
53	NC_006391	CGG	2	6	3664	3669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
54	NC_006391	TCG	2	6	3672	3677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
55	NC_006391	GTC	2	6	3686	3691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
56	NC_006391	TGG	2	6	3774	3779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376188
57	NC_006391	ACG	2	6	3890	3895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
58	NC_006391	CTG	2	6	3962	3967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
59	NC_006391	AAC	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
60	NC_006391	GAC	2	6	4070	4075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
61	NC_006391	ATC	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376188
62	NC_006391	GGC	2	6	4109	4114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
63	NC_006391	GAC	2	6	4127	4132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
64	NC_006391	CAG	2	6	4170	4175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_006391	GGT	3	9	4233	4241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006391	ACG	3	9	4247	4255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_006391	GTC	2	6	4321	4326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_006391	CGT	2	6	4499	4504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376189
69	NC_006391	CGG	2	6	4508	4513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376189
70	NC_006391	ATC	2	6	4539	4544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376189
71	NC_006391	TGG	2	6	4552	4557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376189
72	NC_006391	GAT	2	6	4652	4657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376189
73	NC_006391	GAC	2	6	4766	4771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376190
74	NC_006391	GGC	2	6	4780	4785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376190
75	NC_006391	TGG	2	6	4824	4829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376190
76	NC_006391	ACG	2	6	4839	4844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376190
77	NC_006391	AGG	2	6	4881	4886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376190
78	NC_006391	CGA	2	6	4973	4978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376190
79	NC_006391	GGA	2	6	5053	5058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376190
80	NC_006391	GTC	2	6	5128	5133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_006391	CGG	2	6	5154	5159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_006391	TGG	2	6	5170	5175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006391	CAG	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376191
84	NC_006391	CTG	2	6	5321	5326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376191
85	NC_006391	AGC	2	6	5361	5366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376191
86	NC_006391	CAC	2	6	5415	5420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376191
87	NC_006391	GTC	2	6	5464	5469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376191
88	NC_006391	CCT	2	6	5556	5561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376191
89	NC_006391	GAT	2	6	5632	5637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376191
90	NC_006391	ATC	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376191
91	NC_006391	CAG	3	9	5735	5743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376191
92	NC_006391	CTG	2	6	5746	5751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376191
93	NC_006391	GTA	2	6	5767	5772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376191
94	NC_006391	GAC	2	6	5800	5805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376191
95	NC_006391	CGA	2	6	6004	6009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376193
96	NC_006391	TCG	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376193
97	NC_006391	CTG	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376193
98	NC_006391	CGA	2	6	6253	6258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006391	TGT	2	6	6291	6296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006391	CAC	2	6	6374	6379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_006391	CCT	2	6	6425	6430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_006391	TGG	2	6	6440	6445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006391	GTC	2	6	6457	6462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_006391	CGA	2	6	6511	6516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_006391	CGG	2	6	6547	6552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_006391	CAA	2	6	6727	6732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_006391	TGT	2	6	6799	6804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006391	ATT	2	6	6806	6811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006391	TTG	2	6	6992	6997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006391	GAT	2	6	7024	7029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006391	TGT	2	6	7074	7079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006391	GAT	2	6	7105	7110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006391	TGC	2	6	7380	7385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376194
114	NC_006391	GTC	2	6	7390	7395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376194
115	NC_006391	TGT	2	6	7440	7445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376194
116	NC_006391	AGT	2	6	7564	7569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006391	TCG	2	6	7574	7579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_006391	TCA	2	6	7616	7621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_006391	ACT	2	6	7622	7627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_006391	CCT	2	6	7725	7730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_006391	CGA	2	6	7775	7780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_006391	CAC	2	6	7803	7808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_006391	CTG	2	6	7897	7902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376195
124	NC_006391	TTG	2	6	8024	8029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376195
125	NC_006391	ACA	2	6	8080	8085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376195
126	NC_006391	TCA	2	6	8107	8112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376195
127	NC_006391	GAT	2	6	8116	8121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376195
128	NC_006391	AAC	2	6	8172	8177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376195
129	NC_006391	CGA	2	6	8475	8480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376195
130	NC_006391	ACA	2	6	8581	8586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376195
131	NC_006391	AAT	2	6	8622	8627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55376195
132	NC_006391	CCA	2	6	8668	8673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376195
133	NC_006391	CAA	2	6	8738	8743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376195
134	NC_006391	ACT	2	6	8783	8788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376195
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261	NC_006391	ACG	2	6	18626	18631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376209
262	NC_006391	CTC	2	6	18760	18765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376209
263	NC_006391	CGA	2	6	18783	18788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376209
264	NC_006391	GCT	2	6	18834	18839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376209
265	NC_006391	ACG	2	6	18860	18865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376209
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289	NC_006391	TGA	2	6	20055	20060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376209
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291	NC_006391	AGG	2	6	20194	20199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
292	NC_006391	GTG	2	6	20304	20309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
293	NC_006391	CGG	2	6	20313	20318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_006391	CGA	2	6	20383	20388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_006391	CAT	2	6	20392	20397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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297	NC_006391	TTG	2	6	20528	20533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_006391	CGC	2	6	20771	20776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
300	NC_006391	TTG	2	6	20917	20922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
301	NC_006391	GTT	2	6	21097	21102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
302	NC_006391	AGG	2	6	21294	21299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
303	NC_006391	GCC	2	6	21314	21319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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312	NC_006391	CAG	2	6	22555	22560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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321	NC_006391	ATG	2	6	23570	23575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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370	NC_006391	CGT	2	6	26832	26837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
371	NC_006391	GCG	2	6	26872	26877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
372	NC_006391	TGG	2	6	26891	26896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
373	NC_006391	TTA	2	6	26900	26905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
374	NC_006391	CCG	2	6	27015	27020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
375	NC_006391	AAC	2	6	27079	27084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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383	NC_006391	ACC	2	6	27305	27310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376213
384	NC_006391	TCT	2	6	27362	27367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376213
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386	NC_006391	CCT	2	6	27389	27394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376213
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389	NC_006391	CGA	2	6	27527	27532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376213
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392	NC_006391	CGT	2	6	27665	27670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376213
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498	NC_006391	GCC	2	6	33074	33079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
499	NC_006391	CGC	2	6	33082	33087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
500	NC_006391	GTC	2	6	33101	33106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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