MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG200

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006390	CA	3	6	79	84	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_006390	CT	3	6	251	256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006390	GT	3	6	1650	1655	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006390	GT	3	6	1867	1872	0 %	50 %	50 %	0 %	55376147
5	NC_006390	CG	3	6	2068	2073	0 %	0 %	50 %	50 %	55376147
6	NC_006390	GC	3	6	2333	2338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_006390	TG	3	6	2958	2963	0 %	50 %	50 %	0 %	55376149
8	NC_006390	TG	3	6	3286	3291	0 %	50 %	50 %	0 %	55376150
9	NC_006390	TC	3	6	3320	3325	0 %	50 %	0 %	50 %	55376150
10	NC_006390	GA	3	6	3564	3569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006390	TG	3	6	3599	3604	0 %	50 %	50 %	0 %	55376151
12	NC_006390	AG	3	6	5820	5825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006390	TG	3	6	5999	6004	0 %	50 %	50 %	0 %	55376154
14	NC_006390	AT	3	6	6859	6864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006390	AT	3	6	6881	6886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006390	TG	3	6	8169	8174	0 %	50 %	50 %	0 %	55376157
17	NC_006390	TC	3	6	9000	9005	0 %	50 %	0 %	50 %	55376158
18	NC_006390	TA	3	6	9208	9213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006390	GA	3	6	9258	9263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006390	CT	3	6	10447	10452	0 %	50 %	0 %	50 %	55376160
21	NC_006390	TC	3	6	10455	10460	0 %	50 %	0 %	50 %	55376160
22	NC_006390	CT	3	6	10576	10581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_006390	CT	3	6	10629	10634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_006390	TC	3	6	10749	10754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_006390	GA	3	6	10782	10787	50 %	0 %	50 %	0 %	55376161
26	NC_006390	GA	3	6	10834	10839	50 %	0 %	50 %	0 %	55376161
27	NC_006390	TC	3	6	11571	11576	0 %	50 %	0 %	50 %	55376161
28	NC_006390	AT	3	6	12361	12366	50 %	50 %	0 %	0 %	55376162
29	NC_006390	CA	3	6	12693	12698	50 %	0 %	0 %	50 %	55376162
30	NC_006390	AG	3	6	12809	12814	50 %	0 %	50 %	0 %	55376162
31	NC_006390	GA	4	8	13013	13020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006390	TC	3	6	15418	15423	0 %	50 %	0 %	50 %	55376165
33	NC_006390	TC	4	8	16437	16444	0 %	50 %	0 %	50 %	55376165
34	NC_006390	CG	3	6	16706	16711	0 %	0 %	50 %	50 %	55376165
35	NC_006390	CT	3	6	16775	16780	0 %	50 %	0 %	50 %	55376165
36	NC_006390	CG	3	6	16978	16983	0 %	0 %	50 %	50 %	55376165
37	NC_006390	GA	3	6	17062	17067	50 %	0 %	50 %	0 %	55376165
38	NC_006390	AG	3	6	17422	17427	50 %	0 %	50 %	0 %	55376165
39	NC_006390	CT	3	6	17554	17559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_006390	TG	3	6	17770	17775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006390	CA	3	6	18281	18286	50 %	0 %	0 %	50 %	55376167
42	NC_006390	TG	3	6	18489	18494	0 %	50 %	50 %	0 %	55376168
43	NC_006390	TG	3	6	18604	18609	0 %	50 %	50 %	0 %	55376168
44	NC_006390	AC	3	6	19084	19089	50 %	0 %	0 %	50 %	55376169
45	NC_006390	CA	3	6	19414	19419	50 %	0 %	0 %	50 %	55376170
46	NC_006390	CG	3	6	19795	19800	0 %	0 %	50 %	50 %	55376171
47	NC_006390	GT	4	8	20015	20022	0 %	50 %	50 %	0 %	55376171
48	NC_006390	GA	3	6	21107	21112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006390	CA	3	6	21658	21663	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_006390	GA	3	6	21962	21967	50 %	0 %	50 %	0 %	55376174
51	NC_006390	GT	3	6	22917	22922	0 %	50 %	50 %	0 %	55376175
52	NC_006390	AT	3	6	23244	23249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006390	GA	3	6	23356	23361	50 %	0 %	50 %	0 %	55376176
54	NC_006390	TC	3	6	23834	23839	0 %	50 %	0 %	50 %	55376176
55	NC_006390	CT	3	6	24276	24281	0 %	50 %	0 %	50 %	55376176
56	NC_006390	TG	3	6	24782	24787	0 %	50 %	50 %	0 %	55376176
57	NC_006390	TG	3	6	25495	25500	0 %	50 %	50 %	0 %	55376176
58	NC_006390	TC	3	6	25531	25536	0 %	50 %	0 %	50 %	55376176
59	NC_006390	AC	3	6	26789	26794	50 %	0 %	0 %	50 %	55376178
60	NC_006390	AC	3	6	27201	27206	50 %	0 %	0 %	50 %	55376178
61	NC_006390	AC	3	6	27494	27499	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_006390	TC	3	6	27705	27710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_006390	TG	3	6	27879	27884	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006390	TC	3	6	27954	27959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_006390	AT	3	6	28120	28125	50 %	50 %	0 %	0 %	55376179
66	NC_006390	GT	3	6	28916	28921	0 %	50 %	50 %	0 %	55376180
67	NC_006390	GA	3	6	29302	29307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006390	AC	3	6	29527	29532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_006390	AC	3	6	30391	30396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_006390	CG	4	8	31596	31603	0 %	0 %	50 %	50 %	55376185
71	NC_006390	AC	3	6	32427	32432	50 %	0 %	0 %	50 %	55376186

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.