MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG100

Total Repeats: 471

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006389	GCC	2	6	35	40	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_006389	CAA	2	6	109	114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006389	ACT	2	6	166	171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376108
4	NC_006389	TAG	2	6	228	233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376108
5	NC_006389	ATT	2	6	246	251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376108
6	NC_006389	GAT	2	6	299	304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376108
7	NC_006389	GAA	2	6	321	326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376108
8	NC_006389	GTT	2	6	398	403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376108
9	NC_006389	TTC	2	6	426	431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376108
10	NC_006389	GAA	2	6	581	586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376108
11	NC_006389	CTG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376108
12	NC_006389	AGC	2	6	686	691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376108
13	NC_006389	TCG	2	6	786	791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376108
14	NC_006389	GAA	2	6	798	803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376108
15	NC_006389	TCT	2	6	855	860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376109
16	NC_006389	AAC	2	6	954	959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376109
17	NC_006389	CCA	2	6	981	986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376109
18	NC_006389	CGC	2	6	1011	1016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376109
19	NC_006389	CGA	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376109
20	NC_006389	CGC	2	6	1215	1220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376109
21	NC_006389	TGG	2	6	1295	1300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376109
22	NC_006389	GGA	2	6	1531	1536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006389	CGT	2	6	1540	1545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_006389	CGT	2	6	1630	1635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006389	CGA	2	6	1726	1731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_006389	CGA	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_006389	CAA	2	6	1879	1884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_006389	TCG	2	6	1887	1892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_006389	CTC	2	6	1978	1983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376110
30	NC_006389	CTT	2	6	2268	2273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_006389	CTT	2	6	2344	2349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_006389	GGA	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006389	CTG	2	6	2503	2508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_006389	CTT	2	6	2514	2519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_006389	GTC	2	6	2626	2631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_006389	GCT	2	6	2649	2654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_006389	TCA	2	6	2660	2665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_006389	CCG	2	6	2857	2862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_006389	GTC	2	6	2893	2898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_006389	TCC	2	6	2990	2995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_006389	GTA	2	6	3188	3193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006389	AGT	2	6	3234	3239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006389	TGG	2	6	3272	3277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006389	GGC	2	6	3366	3371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_006389	GTC	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_006389	CCT	2	6	3385	3390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_006389	CAG	2	6	3428	3433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_006389	GAA	2	6	3595	3600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006389	GTC	2	6	3605	3610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006389	AAT	2	6	3735	3740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006389	CGT	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376111
52	NC_006389	GTA	2	6	3878	3883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376111
53	NC_006389	TCA	2	6	3954	3959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376111
54	NC_006389	CGA	2	6	3973	3978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376111
55	NC_006389	TCT	2	6	4038	4043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376111
56	NC_006389	TCA	2	6	4062	4067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_006389	ACA	2	6	4260	4265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376112
58	NC_006389	TCA	3	9	4311	4319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376112
59	NC_006389	TCG	2	6	4446	4451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376112
60	NC_006389	TCG	2	6	4506	4511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376112
61	NC_006389	GAA	2	6	4573	4578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376112
62	NC_006389	GCA	2	6	4665	4670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376112
63	NC_006389	GTT	2	6	4814	4819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376112
64	NC_006389	ATC	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376112
65	NC_006389	AAT	2	6	4873	4878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006389	GAT	2	6	5072	5077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006389	GGA	2	6	5166	5171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376113
68	NC_006389	TAC	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376113
69	NC_006389	TGA	2	6	5346	5351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376113
70	NC_006389	AGA	2	6	5466	5471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376113
71	NC_006389	CAT	2	6	5491	5496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376113
72	NC_006389	AGC	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376113
73	NC_006389	GTC	2	6	5583	5588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376113
74	NC_006389	GGA	2	6	5625	5630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376113
75	NC_006389	CTG	2	6	5689	5694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006389	CGG	2	6	5748	5753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_006389	TGC	2	6	5757	5762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_006389	AGT	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006389	AGC	2	6	5839	5844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_006389	TTG	2	6	5874	5879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006389	TAA	2	6	5892	5897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006389	GAT	2	6	5970	5975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006389	GGC	2	6	5984	5989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_006389	AAC	2	6	6013	6018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376114
85	NC_006389	GAA	2	6	6042	6047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376114
86	NC_006389	TCC	2	6	6089	6094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376114
87	NC_006389	TCG	2	6	6181	6186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376114
88	NC_006389	CGC	2	6	6232	6237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376114
89	NC_006389	GAA	2	6	6324	6329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376114
90	NC_006389	GAA	2	6	6402	6407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006389	GTT	2	6	6424	6429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006389	CGC	2	6	6509	6514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_006389	ACG	2	6	6603	6608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_006389	GCC	2	6	6612	6617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_006389	CGT	2	6	6674	6679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_006389	CAG	2	6	6758	6763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_006389	CCG	2	6	6772	6777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_006389	GTC	2	6	6935	6940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006389	GAC	2	6	6978	6983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_006389	AAT	2	6	6985	6990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006389	GTC	2	6	7045	7050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376115
102	NC_006389	GCT	2	6	7100	7105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376115
103	NC_006389	TCG	2	6	7124	7129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376115
104	NC_006389	TCG	2	6	7199	7204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376115
105	NC_006389	AAT	2	6	7231	7236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55376115
106	NC_006389	CTG	2	6	7362	7367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376115
107	NC_006389	CAG	2	6	7401	7406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_006389	CAC	2	6	7468	7473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_006389	AAC	2	6	7702	7707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376116
110	NC_006389	CCG	2	6	7736	7741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376116
111	NC_006389	TCA	2	6	7754	7759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376116
112	NC_006389	ATT	2	6	7816	7821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376116
113	NC_006389	GTT	2	6	7928	7933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376116
114	NC_006389	CGT	2	6	8106	8111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376116
115	NC_006389	CGT	2	6	8152	8157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376116
116	NC_006389	TTG	2	6	8222	8227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376116
117	NC_006389	AGG	2	6	8371	8376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376116
118	NC_006389	TTG	2	6	8377	8382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376116
119	NC_006389	CCA	2	6	8498	8503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376116
120	NC_006389	ATT	2	6	8582	8587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006389	TGC	2	6	8646	8651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_006389	CAA	2	6	8718	8723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_006389	TAC	2	6	8726	8731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_006389	CGG	2	6	8867	8872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_006389	CTT	2	6	8949	8954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_006389	CGA	2	6	8963	8968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_006389	CGA	2	6	8975	8980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_006389	CGA	2	6	9105	9110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_006389	ACG	2	6	9129	9134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376117
130	NC_006389	TGA	2	6	9289	9294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376117
131	NC_006389	CGG	2	6	9461	9466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376117
132	NC_006389	CCG	2	6	9518	9523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_006389	CTT	2	6	9655	9660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_006389	TCG	2	6	9810	9815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_006389	TTC	2	6	9940	9945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_006389	TTA	2	6	10025	10030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006389	CAG	2	6	10086	10091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_006389	TAT	2	6	10106	10111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006389	ATA	2	6	10212	10217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006389	AAG	2	6	10242	10247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_006389	GAT	2	6	19224	19229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_006389	AGA	2	6	19316	19321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_006389	CTA	2	6	19434	19439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_006389	TCC	2	6	19466	19471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
265	NC_006389	GCT	2	6	19577	19582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_006389	TGT	2	6	19654	19659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
267	NC_006389	AGG	2	6	19728	19733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376130
268	NC_006389	AGC	2	6	19745	19750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376130
269	NC_006389	TCC	2	6	19757	19762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376130
270	NC_006389	CGA	2	6	19803	19808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376130
271	NC_006389	TTG	3	9	19844	19852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376130
272	NC_006389	ATC	3	9	19870	19878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376130
273	NC_006389	TCG	2	6	19907	19912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376130
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279	NC_006389	TGA	2	6	20400	20405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376130
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281	NC_006389	TCT	2	6	20472	20477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376130
282	NC_006389	CAG	2	6	20555	20560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376130
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285	NC_006389	CCG	2	6	20939	20944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_006389	TAG	2	6	21008	21013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_006389	TGA	2	6	21046	21051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376131
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290	NC_006389	CCG	2	6	21485	21490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376131
291	NC_006389	CGA	2	6	21545	21550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376131
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296	NC_006389	TAG	2	6	21855	21860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
297	NC_006389	GTG	2	6	21894	21899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_006389	TTC	2	6	21999	22004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
300	NC_006389	CAT	2	6	22031	22036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376132
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303	NC_006389	TGG	2	6	22409	22414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376132
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