MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haemophilus ducreyi 35000HP chromosome

Total Repeats: 1948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002940	AT	3	6	271	276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002940	AC	3	6	1046	1051	50 %	0 %	0 %	50 %	33151283
3	NC_002940	GT	3	6	2786	2791	0 %	50 %	50 %	0 %	33151284
4	NC_002940	AT	3	6	3111	3116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002940	AT	3	6	3649	3654	50 %	50 %	0 %	0 %	33151286
6	NC_002940	CG	3	6	3762	3767	0 %	0 %	50 %	50 %	33151286
7	NC_002940	AT	3	6	5467	5472	50 %	50 %	0 %	0 %	33151289
8	NC_002940	GA	4	8	7431	7438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002940	GC	3	6	8629	8634	0 %	0 %	50 %	50 %	33151292
10	NC_002940	AC	4	8	10312	10319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_002940	CA	3	6	10388	10393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_002940	TG	3	6	10475	10480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002940	AC	3	6	11865	11870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_002940	AC	3	6	12034	12039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_002940	CA	3	6	12208	12213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_002940	GA	3	6	12615	12620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002940	AC	3	6	13688	13693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_002940	GA	3	6	14393	14398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002940	GC	3	6	17121	17126	0 %	0 %	50 %	50 %	33151294
20	NC_002940	TG	3	6	17510	17515	0 %	50 %	50 %	0 %	33151295
21	NC_002940	TG	3	6	18628	18633	0 %	50 %	50 %	0 %	33151295
22	NC_002940	CA	3	6	18789	18794	50 %	0 %	0 %	50 %	33151296
23	NC_002940	AT	3	6	20272	20277	50 %	50 %	0 %	0 %	33151297
24	NC_002940	TG	3	6	23051	23056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002940	CT	3	6	23421	23426	0 %	50 %	0 %	50 %	33151299
26	NC_002940	AT	3	6	24934	24939	50 %	50 %	0 %	0 %	33151301
27	NC_002940	GT	3	6	25366	25371	0 %	50 %	50 %	0 %	33151301
28	NC_002940	AT	3	6	25655	25660	50 %	50 %	0 %	0 %	33151301
29	NC_002940	AG	3	6	26052	26057	50 %	0 %	50 %	0 %	33151301
30	NC_002940	AG	3	6	26229	26234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002940	GC	3	6	26574	26579	0 %	0 %	50 %	50 %	33151302
32	NC_002940	TG	3	6	26825	26830	0 %	50 %	50 %	0 %	33151302
33	NC_002940	GA	3	6	28038	28043	50 %	0 %	50 %	0 %	33151303
34	NC_002940	TG	3	6	28813	28818	0 %	50 %	50 %	0 %	33151304
35	NC_002940	AT	3	6	29426	29431	50 %	50 %	0 %	0 %	33151304
36	NC_002940	GC	3	6	29820	29825	0 %	0 %	50 %	50 %	33151304
37	NC_002940	CA	3	6	29990	29995	50 %	0 %	0 %	50 %	33151304
38	NC_002940	GT	3	6	30076	30081	0 %	50 %	50 %	0 %	33151304
39	NC_002940	GC	3	6	30785	30790	0 %	0 %	50 %	50 %	33151305
40	NC_002940	GT	3	6	31032	31037	0 %	50 %	50 %	0 %	33151305
41	NC_002940	AT	3	6	32317	32322	50 %	50 %	0 %	0 %	33151309
42	NC_002940	GC	3	6	32353	32358	0 %	0 %	50 %	50 %	33151309
43	NC_002940	AC	3	6	34874	34879	50 %	0 %	0 %	50 %	33151310
44	NC_002940	AC	3	6	35281	35286	50 %	0 %	0 %	50 %	33151310
45	NC_002940	TA	3	6	38011	38016	50 %	50 %	0 %	0 %	33151313
46	NC_002940	GT	3	6	40096	40101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002940	CA	3	6	40376	40381	50 %	0 %	0 %	50 %	33151318
48	NC_002940	AC	4	8	40832	40839	50 %	0 %	0 %	50 %	33151318
49	NC_002940	TA	3	6	40939	40944	50 %	50 %	0 %	0 %	33151318
50	NC_002940	GT	3	6	41975	41980	0 %	50 %	50 %	0 %	33151319
51	NC_002940	GC	3	6	42536	42541	0 %	0 %	50 %	50 %	33151319
52	NC_002940	GC	3	6	46006	46011	0 %	0 %	50 %	50 %	33151324
53	NC_002940	CA	3	6	46310	46315	50 %	0 %	0 %	50 %	33151324
54	NC_002940	GT	3	6	48197	48202	0 %	50 %	50 %	0 %	33151327
55	NC_002940	CG	3	6	48927	48932	0 %	0 %	50 %	50 %	33151327
56	NC_002940	TG	3	6	51111	51116	0 %	50 %	50 %	0 %	33151330
57	NC_002940	GC	4	8	54614	54621	0 %	0 %	50 %	50 %	33151334
58	NC_002940	CT	3	6	55798	55803	0 %	50 %	0 %	50 %	33151336
59	NC_002940	AT	3	6	56168	56173	50 %	50 %	0 %	0 %	33151336
60	NC_002940	CG	3	6	56267	56272	0 %	0 %	50 %	50 %	33151336
61	NC_002940	GC	4	8	56726	56733	0 %	0 %	50 %	50 %	33151336
62	NC_002940	AC	3	6	56900	56905	50 %	0 %	0 %	50 %	33151336
63	NC_002940	TA	3	6	57058	57063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002940	TA	3	6	57136	57141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002940	TG	3	6	57628	57633	0 %	50 %	50 %	0 %	33151337
66	NC_002940	TG	3	6	57738	57743	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002940	GT	3	6	58288	58293	0 %	50 %	50 %	0 %	33151338
68	NC_002940	AT	3	6	58545	58550	50 %	50 %	0 %	0 %	33151338
69	NC_002940	AT	3	6	60599	60604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002940	GT	3	6	60841	60846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002940	TG	3	6	61109	61114	0 %	50 %	50 %	0 %	33151340
72	NC_002940	AG	3	6	61575	61580	50 %	0 %	50 %	0 %	33151341
73	NC_002940	AC	3	6	64047	64052	50 %	0 %	0 %	50 %	33151342
74	NC_002940	TG	3	6	64383	64388	0 %	50 %	50 %	0 %	33151343
75	NC_002940	TG	3	6	64508	64513	0 %	50 %	50 %	0 %	33151343
76	NC_002940	TG	3	6	64611	64616	0 %	50 %	50 %	0 %	33151343
77	NC_002940	GT	4	8	64764	64771	0 %	50 %	50 %	0 %	33151343
78	NC_002940	TG	3	6	64895	64900	0 %	50 %	50 %	0 %	33151343
79	NC_002940	TG	3	6	65376	65381	0 %	50 %	50 %	0 %	33151344
80	NC_002940	GA	3	6	66606	66611	50 %	0 %	50 %	0 %	33151345
81	NC_002940	CA	3	6	67179	67184	50 %	0 %	0 %	50 %	33151346
82	NC_002940	GT	3	6	67882	67887	0 %	50 %	50 %	0 %	33151347
83	NC_002940	CG	3	6	69098	69103	0 %	0 %	50 %	50 %	33151348
84	NC_002940	TG	3	6	69296	69301	0 %	50 %	50 %	0 %	33151349
85	NC_002940	GT	3	6	69844	69849	0 %	50 %	50 %	0 %	33151350
86	NC_002940	TA	3	6	72286	72291	50 %	50 %	0 %	0 %	33151353
87	NC_002940	AT	3	6	72949	72954	50 %	50 %	0 %	0 %	33151354
88	NC_002940	CT	3	6	73088	73093	0 %	50 %	0 %	50 %	33151354
89	NC_002940	TA	3	6	73282	73287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002940	AC	3	6	73730	73735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_002940	AG	3	6	74459	74464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002940	AG	3	6	75776	75781	50 %	0 %	50 %	0 %	33151356
93	NC_002940	GC	3	6	76025	76030	0 %	0 %	50 %	50 %	33151356
94	NC_002940	GC	3	6	76570	76575	0 %	0 %	50 %	50 %	33151356
95	NC_002940	GC	3	6	77144	77149	0 %	0 %	50 %	50 %	33151358
96	NC_002940	GC	3	6	77421	77426	0 %	0 %	50 %	50 %	33151358
97	NC_002940	CG	3	6	77696	77701	0 %	0 %	50 %	50 %	33151359
98	NC_002940	GC	3	6	77955	77960	0 %	0 %	50 %	50 %	33151360
99	NC_002940	AT	3	6	78555	78560	50 %	50 %	0 %	0 %	33151363
100	NC_002940	GC	3	6	81073	81078	0 %	0 %	50 %	50 %	33151369
101	NC_002940	CG	3	6	81737	81742	0 %	0 %	50 %	50 %	33151372
102	NC_002940	GC	3	6	82237	82242	0 %	0 %	50 %	50 %	33151373
103	NC_002940	AG	3	6	82996	83001	50 %	0 %	50 %	0 %	33151375
104	NC_002940	GC	3	6	83091	83096	0 %	0 %	50 %	50 %	33151376
105	NC_002940	GC	3	6	83578	83583	0 %	0 %	50 %	50 %	33151377
106	NC_002940	GC	3	6	85087	85092	0 %	0 %	50 %	50 %	33151382
107	NC_002940	CT	3	6	85234	85239	0 %	50 %	0 %	50 %	33151382
108	NC_002940	CG	3	6	85657	85662	0 %	0 %	50 %	50 %	33151382
109	NC_002940	GT	3	6	85847	85852	0 %	50 %	50 %	0 %	33151382
110	NC_002940	AC	3	6	86346	86351	50 %	0 %	0 %	50 %	33151382
111	NC_002940	CG	3	6	86587	86592	0 %	0 %	50 %	50 %	33151383
112	NC_002940	GC	3	6	87103	87108	0 %	0 %	50 %	50 %	33151383
113	NC_002940	CG	3	6	87245	87250	0 %	0 %	50 %	50 %	33151383
114	NC_002940	CG	3	6	87522	87527	0 %	0 %	50 %	50 %	33151383
115	NC_002940	CG	3	6	87691	87696	0 %	0 %	50 %	50 %	33151383
116	NC_002940	CG	3	6	88157	88162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_002940	GC	3	6	88591	88596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_002940	GA	3	6	88604	88609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002940	AC	3	6	88706	88711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_002940	AT	3	6	89117	89122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002940	CG	3	6	89926	89931	0 %	0 %	50 %	50 %	33151384
122	NC_002940	GC	3	6	90469	90474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_002940	GC	3	6	90767	90772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_002940	GC	4	8	90943	90950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_002940	TA	3	6	91478	91483	50 %	50 %	0 %	0 %	33151386
126	NC_002940	GC	3	6	91911	91916	0 %	0 %	50 %	50 %	33151386
127	NC_002940	GC	3	6	92234	92239	0 %	0 %	50 %	50 %	33151387
128	NC_002940	GC	3	6	92804	92809	0 %	0 %	50 %	50 %	33151388
129	NC_002940	GC	3	6	93166	93171	0 %	0 %	50 %	50 %	33151389
130	NC_002940	CG	3	6	93661	93666	0 %	0 %	50 %	50 %	33151390
131	NC_002940	GC	3	6	94549	94554	0 %	0 %	50 %	50 %	33151391
132	NC_002940	CG	4	8	94687	94694	0 %	0 %	50 %	50 %	33151391
133	NC_002940	GC	3	6	95255	95260	0 %	0 %	50 %	50 %	33151393
134	NC_002940	CG	4	8	95729	95736	0 %	0 %	50 %	50 %	33151393
135	NC_002940	GC	3	6	96097	96102	0 %	0 %	50 %	50 %	33151393
136	NC_002940	GC	3	6	96182	96187	0 %	0 %	50 %	50 %	33151393
137	NC_002940	CA	3	6	97122	97127	50 %	0 %	0 %	50 %	33151393
138	NC_002940	CG	3	6	98250	98255	0 %	0 %	50 %	50 %	33151397
139	NC_002940	GC	3	6	98826	98831	0 %	0 %	50 %	50 %	33151398
140	NC_002940	AT	3	6	99743	99748	50 %	50 %	0 %	0 %	33151399
141	NC_002940	AT	4	8	99929	99936	50 %	50 %	0 %	0 %	33151399
142	NC_002940	GC	3	6	99947	99952	0 %	0 %	50 %	50 %	33151399
143	NC_002940	CA	3	6	100045	100050	50 %	0 %	0 %	50 %	33151399
144	NC_002940	CG	3	6	100199	100204	0 %	0 %	50 %	50 %	33151399
145	NC_002940	AT	3	6	100214	100219	50 %	50 %	0 %	0 %	33151399
146	NC_002940	GC	3	6	100326	100331	0 %	0 %	50 %	50 %	33151400
147	NC_002940	CG	3	6	100474	100479	0 %	0 %	50 %	50 %	33151400
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