MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haemophilus ducreyi 35000HP chromosome

Total Repeats: 22489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002940	ATA	2	6	128	133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002940	TAT	2	6	156	161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002940	CAA	2	6	287	292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_002940	GCG	2	6	356	361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33151283
5	NC_002940	ATT	2	6	391	396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151283
6	NC_002940	TGG	2	6	448	453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151283
7	NC_002940	GGT	2	6	494	499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151283
8	NC_002940	AAG	2	6	663	668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151283
9	NC_002940	ATC	2	6	690	695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151283
10	NC_002940	GTG	2	6	702	707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151283
11	NC_002940	GCG	2	6	830	835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33151283
12	NC_002940	ACC	2	6	898	903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33151283
13	NC_002940	AAC	2	6	945	950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151283
14	NC_002940	ATC	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151283
15	NC_002940	ATT	2	6	1055	1060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151283
16	NC_002940	ATT	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151283
17	NC_002940	ATT	2	6	1301	1306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151283
18	NC_002940	GAA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151283
19	NC_002940	TTA	2	6	1448	1453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151283
20	NC_002940	GAC	2	6	1538	1543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151283
21	NC_002940	GCT	2	6	1874	1879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151283
22	NC_002940	TAA	2	6	2023	2028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151283
23	NC_002940	AAC	2	6	2357	2362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151284
24	NC_002940	AGA	2	6	2430	2435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151284
25	NC_002940	GTC	2	6	2467	2472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151284
26	NC_002940	GAT	2	6	2722	2727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151284
27	NC_002940	TTG	2	6	2990	2995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002940	AAT	2	6	2996	3001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002940	AAG	2	6	3207	3212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002940	ATT	2	6	3251	3256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151285
31	NC_002940	AGG	2	6	3345	3350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33151285
32	NC_002940	GTG	2	6	3446	3451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151285
33	NC_002940	TTA	2	6	3478	3483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151285
34	NC_002940	AGC	2	6	3489	3494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151285
35	NC_002940	GTT	2	6	3552	3557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151285
36	NC_002940	CAA	2	6	3561	3566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151285
37	NC_002940	CAC	2	6	3659	3664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33151286
38	NC_002940	TTG	2	6	3729	3734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151286
39	NC_002940	TGG	2	6	3822	3827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151286
40	NC_002940	TAT	2	6	3919	3924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151286
41	NC_002940	ATG	2	6	4364	4369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151286
42	NC_002940	TAA	2	6	4399	4404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151286
43	NC_002940	GTT	2	6	4434	4439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002940	AAC	2	6	4491	4496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_002940	CAA	2	6	4557	4562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151287
46	NC_002940	TAT	2	6	4578	4583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151287
47	NC_002940	TGC	2	6	4591	4596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151287
48	NC_002940	GGT	2	6	4628	4633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151287
49	NC_002940	ATC	3	9	4645	4653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151287
50	NC_002940	TAG	2	6	4672	4677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151287
51	NC_002940	AGG	2	6	4835	4840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002940	TTG	2	6	4895	4900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151288
53	NC_002940	TTA	2	6	4931	4936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151288
54	NC_002940	ATC	2	6	4977	4982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151288
55	NC_002940	AGA	2	6	5052	5057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151288
56	NC_002940	CAA	2	6	5081	5086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151288
57	NC_002940	CGT	2	6	5089	5094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151288
58	NC_002940	AAG	2	6	5195	5200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151288
59	NC_002940	GCA	2	6	5218	5223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151288
60	NC_002940	TTG	2	6	5249	5254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151288
61	NC_002940	GCA	2	6	5272	5277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151288
62	NC_002940	AAT	2	6	5278	5283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151288
63	NC_002940	AGC	2	6	5368	5373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151289
64	NC_002940	AGT	2	6	5458	5463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151289
65	NC_002940	TTC	2	6	5511	5516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33151289
66	NC_002940	TGA	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151289
67	NC_002940	AAG	2	6	5691	5696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151289
68	NC_002940	AAC	2	6	5746	5751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151289
69	NC_002940	TAT	3	9	5779	5787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151289
70	NC_002940	ATG	2	6	5793	5798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151289
71	NC_002940	TAT	2	6	5986	5991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151290
72	NC_002940	TTA	2	6	6182	6187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151290
73	NC_002940	ATG	2	6	6243	6248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151290
74	NC_002940	CAT	2	6	6402	6407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151290
75	NC_002940	AGA	2	6	6511	6516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151290
76	NC_002940	GTG	2	6	6630	6635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151290
77	NC_002940	ATG	2	6	6654	6659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151290
78	NC_002940	ATT	2	6	6860	6865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151290
79	NC_002940	CAA	2	6	6900	6905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151290
80	NC_002940	GCA	2	6	7013	7018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151290
81	NC_002940	GGT	2	6	7046	7051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151290
82	NC_002940	TGA	2	6	7114	7119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151290
83	NC_002940	TGG	2	6	7517	7522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151291
84	NC_002940	GCA	2	6	7558	7563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151291
85	NC_002940	GTC	2	6	7565	7570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151291
86	NC_002940	TAG	2	6	7790	7795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151291
87	NC_002940	TTG	2	6	7886	7891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151291
88	NC_002940	TAC	2	6	8003	8008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151291
89	NC_002940	ATG	2	6	8027	8032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151291
90	NC_002940	TAT	2	6	8084	8089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151291
91	NC_002940	TGA	2	6	8217	8222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151291
92	NC_002940	TTG	2	6	8282	8287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151291
93	NC_002940	TGC	3	9	8292	8300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151291
94	NC_002940	ATG	2	6	8402	8407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151292
95	NC_002940	CAA	3	9	8443	8451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151292
96	NC_002940	GGT	3	9	8455	8463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151292
97	NC_002940	TAT	2	6	8574	8579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151292
98	NC_002940	TGA	2	6	8601	8606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151292
99	NC_002940	GAA	2	6	8623	8628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151292
100	NC_002940	GAA	2	6	8665	8670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151292
101	NC_002940	GGT	2	6	8740	8745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151292
102	NC_002940	TGG	2	6	8760	8765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151292
103	NC_002940	ATG	2	6	8791	8796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151292
104	NC_002940	ACC	2	6	8949	8954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33151292
105	NC_002940	TGA	2	6	9009	9014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151292
106	NC_002940	TAT	2	6	9026	9031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151292
107	NC_002940	ATA	2	6	9041	9046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151292
108	NC_002940	TTA	2	6	9085	9090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151292
109	NC_002940	AGA	2	6	9132	9137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151292
110	NC_002940	GAA	2	6	9367	9372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151292
111	NC_002940	GTG	2	6	9389	9394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151292
112	NC_002940	ATT	2	6	9433	9438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151292
113	NC_002940	GAT	2	6	9469	9474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151292
114	NC_002940	TTG	2	6	9530	9535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151292
115	NC_002940	CGA	2	6	9663	9668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151292
116	NC_002940	GTG	2	6	9815	9820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151293
117	NC_002940	TTA	2	6	9859	9864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151293
118	NC_002940	ATA	2	6	9905	9910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151293
119	NC_002940	AAG	2	6	9911	9916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151293
120	NC_002940	GGT	2	6	9934	9939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151293
121	NC_002940	GTG	2	6	9992	9997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151293
122	NC_002940	CAA	2	6	10009	10014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151293
123	NC_002940	TAT	2	6	10017	10022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151293
124	NC_002940	TGC	2	6	10023	10028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151293
125	NC_002940	TAA	2	6	10162	10167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002940	ATC	2	6	10268	10273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_002940	TTA	2	6	10287	10292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002940	ACG	2	6	10394	10399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_002940	CGT	2	6	10435	10440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_002940	AAC	2	6	10456	10461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_002940	TTG	2	6	10486	10491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002940	GGC	2	6	10679	10684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_002940	CGA	2	6	10918	10923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_002940	GCA	2	6	10992	10997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_002940	TGA	2	6	11084	11089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_002940	GGA	2	6	11351	11356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_002940	AAT	2	6	21824	21829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_002940	CAG	2	6	21844	21849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_002940	TTG	2	6	21934	21939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
270	NC_002940	TCT	2	6	22016	22021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_002940	TGT	2	6	22124	22129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
272	NC_002940	TCA	2	6	22131	22136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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280	NC_002940	TCT	2	6	22474	22479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_002940	TAA	2	6	22584	22589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_002940	CGG	2	6	22718	22723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_002940	TGA	2	6	22742	22747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NC_002940	ACC	2	6	22811	22816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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396	NC_002940	ATG	2	6	30597	30602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151305
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400	NC_002940	TGG	2	6	31288	31293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151306
401	NC_002940	TTA	2	6	31311	31316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151306
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470	NC_002940	TCA	2	6	36930	36935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151312
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480	NC_002940	ATA	2	6	37853	37858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151313
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498	NC_002940	TTA	2	6	40104	40109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_002940	TTA	2	6	40219	40224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_002940	TAT	2	6	40297	40302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151318

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