MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus ducreyi 35000HP chromosome

Total Repeats: 35960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_002940	AAT	2	6	217508	217513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151520
4502	NC_002940	TAAC	2	8	217557	217564	50 %	25 %	0 %	25 %	33151520
4503	NC_002940	CCT	2	6	217667	217672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33151520
4504	NC_002940	ATG	2	6	217803	217808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151520
4505	NC_002940	GAA	3	9	217838	217846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151520
4506	NC_002940	AGGCC	2	10	217901	217910	20 %	0 %	40 %	40 %	33151520
4507	NC_002940	TGG	2	6	217996	218001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151520
4508	NC_002940	TAA	2	6	218041	218046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151520
4509	NC_002940	TTA	2	6	218081	218086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151520
4510	NC_002940	A	6	6	218147	218152	100 %	0 %	0 %	0 %	33151520
4511	NC_002940	GTA	3	9	218301	218309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151520
4512	NC_002940	TGT	2	6	218320	218325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151520
4513	NC_002940	A	6	6	218458	218463	100 %	0 %	0 %	0 %	33151520
4514	NC_002940	AAT	2	6	218501	218506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151520
4515	NC_002940	ATA	2	6	218514	218519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151520
4516	NC_002940	TATT	2	8	218521	218528	25 %	75 %	0 %	0 %	33151520
4517	NC_002940	CAT	2	6	218535	218540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151520
4518	NC_002940	TGG	2	6	218554	218559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151520
4519	NC_002940	TGA	2	6	218629	218634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151520
4520	NC_002940	CGA	2	6	218727	218732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151520
4521	NC_002940	AAT	2	6	218747	218752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151520
4522	NC_002940	TTCA	2	8	218758	218765	25 %	50 %	0 %	25 %	33151520
4523	NC_002940	GCA	2	6	218771	218776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151520
4524	NC_002940	AGG	2	6	218779	218784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33151520
4525	NC_002940	AAC	2	6	218794	218799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151520
4526	NC_002940	GGT	2	6	218834	218839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151520
4527	NC_002940	TTA	3	9	218846	218854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151520
4528	NC_002940	ATTT	2	8	218913	218920	25 %	75 %	0 %	0 %	33151520
4529	NC_002940	TGT	2	6	218929	218934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151520
4530	NC_002940	AGT	2	6	218945	218950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151520
4531	NC_002940	TAT	2	6	218951	218956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151520
4532	NC_002940	TGA	2	6	218992	218997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151520
4533	NC_002940	GTT	2	6	219068	219073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151520
4534	NC_002940	TGA	2	6	219087	219092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151520
4535	NC_002940	TAA	2	6	219145	219150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151520
4536	NC_002940	TTG	2	6	219171	219176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151520
4537	NC_002940	AAT	2	6	219220	219225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151520
4538	NC_002940	CTT	2	6	219294	219299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33151520
4539	NC_002940	TTG	2	6	219302	219307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151520
4540	NC_002940	AAC	2	6	219337	219342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_002940	AT	3	6	219344	219349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_002940	TAA	2	6	219367	219372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_002940	TAAA	2	8	219393	219400	75 %	25 %	0 %	0 %	33151521
4544	NC_002940	CAG	2	6	219408	219413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151521
4545	NC_002940	GTT	2	6	219485	219490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151521
4546	NC_002940	A	6	6	219503	219508	100 %	0 %	0 %	0 %	33151521
4547	NC_002940	TAA	2	6	219529	219534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151521
4548	NC_002940	CAA	2	6	219535	219540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151521
4549	NC_002940	A	7	7	219587	219593	100 %	0 %	0 %	0 %	33151521
4550	NC_002940	TGT	2	6	219607	219612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151521
4551	NC_002940	GCC	2	6	219616	219621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33151521
4552	NC_002940	ATT	2	6	219709	219714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151521
4553	NC_002940	TAA	2	6	219748	219753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151521
4554	NC_002940	ATT	2	6	219793	219798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151521
4555	NC_002940	TTC	2	6	219816	219821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33151521
4556	NC_002940	A	6	6	219825	219830	100 %	0 %	0 %	0 %	33151521
4557	NC_002940	A	6	6	219889	219894	100 %	0 %	0 %	0 %	33151521
4558	NC_002940	TGA	2	6	220048	220053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151521
4559	NC_002940	TGG	2	6	220057	220062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151521
4560	NC_002940	AATG	2	8	220094	220101	50 %	25 %	25 %	0 %	33151521
4561	NC_002940	GTT	2	6	220106	220111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151521
4562	NC_002940	AAT	2	6	220122	220127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151521
4563	NC_002940	TAA	2	6	220246	220251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151522
4564	NC_002940	A	6	6	220271	220276	100 %	0 %	0 %	0 %	33151522
4565	NC_002940	AGT	2	6	220295	220300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151522
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4567	NC_002940	AAAT	2	8	220351	220358	75 %	25 %	0 %	0 %	33151522
4568	NC_002940	A	6	6	220376	220381	100 %	0 %	0 %	0 %	33151522
4569	NC_002940	TTACT	2	10	220510	220519	20 %	60 %	0 %	20 %	33151522
4570	NC_002940	AGCAAC	2	12	220527	220538	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	33151522
4571	NC_002940	TTC	2	6	220586	220591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33151522
4572	NC_002940	AGCA	2	8	220608	220615	50 %	0 %	25 %	25 %	33151522
4573	NC_002940	ATT	2	6	220702	220707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151522
4574	NC_002940	TATG	2	8	220713	220720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_002940	TAT	2	6	220733	220738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_002940	GTG	2	6	220746	220751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_002940	A	6	6	220780	220785	100 %	0 %	0 %	0 %	33151523
4578	NC_002940	ATT	2	6	220801	220806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151523
4579	NC_002940	TATT	2	8	220817	220824	25 %	75 %	0 %	0 %	33151523
4580	NC_002940	TGC	2	6	220825	220830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151523
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4582	NC_002940	A	6	6	220970	220975	100 %	0 %	0 %	0 %	33151523
4583	NC_002940	AT	4	8	221093	221100	50 %	50 %	0 %	0 %	33151523
4584	NC_002940	TGG	2	6	221116	221121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151523
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4587	NC_002940	T	7	7	221244	221250	0 %	100 %	0 %	0 %	33151523
4588	NC_002940	TTC	2	6	221253	221258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33151523
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4590	NC_002940	TCT	2	6	221347	221352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_002940	AT	3	6	221386	221391	50 %	50 %	0 %	0 %	33151524
4592	NC_002940	AGT	2	6	221445	221450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151524
4593	NC_002940	ATA	2	6	221489	221494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151524
4594	NC_002940	ATTG	2	8	221646	221653	25 %	50 %	25 %	0 %	33151524
4595	NC_002940	GTA	2	6	221675	221680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151524
4596	NC_002940	CCT	2	6	221785	221790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33151524
4597	NC_002940	ATT	2	6	221812	221817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151524
4598	NC_002940	TAT	2	6	221843	221848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_002940	TTA	2	6	221886	221891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151525
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4601	NC_002940	ATT	2	6	221983	221988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151525
4602	NC_002940	CAG	2	6	222027	222032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151525
4603	NC_002940	ATTTT	2	10	222069	222078	20 %	80 %	0 %	0 %	33151525
4604	NC_002940	GGT	2	6	222151	222156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151525
4605	NC_002940	TGA	2	6	222190	222195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151525
4606	NC_002940	GAAA	2	8	222251	222258	75 %	0 %	25 %	0 %	33151525
4607	NC_002940	TTGAG	2	10	222282	222291	20 %	40 %	40 %	0 %	33151525
4608	NC_002940	GAAT	2	8	222325	222332	50 %	25 %	25 %	0 %	33151525
4609	NC_002940	AGA	2	6	222336	222341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151525
4610	NC_002940	TACG	2	8	222455	222462	25 %	25 %	25 %	25 %	33151526
4611	NC_002940	AT	3	6	222514	222519	50 %	50 %	0 %	0 %	33151526
4612	NC_002940	TTAAT	2	10	222671	222680	40 %	60 %	0 %	0 %	33151526
4613	NC_002940	AT	3	6	222692	222697	50 %	50 %	0 %	0 %	33151526
4614	NC_002940	GAT	2	6	222722	222727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151526
4615	NC_002940	AATTCT	2	12	222748	222759	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	33151526
4616	NC_002940	CTT	2	6	222811	222816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33151526
4617	NC_002940	GTT	3	9	222867	222875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151527
4618	NC_002940	TAAA	2	8	222965	222972	75 %	25 %	0 %	0 %	33151527
4619	NC_002940	GTA	2	6	222998	223003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151527
4620	NC_002940	GA	3	6	223018	223023	50 %	0 %	50 %	0 %	33151527
4621	NC_002940	TTG	2	6	223041	223046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151527
4622	NC_002940	TTC	2	6	223070	223075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33151527
4623	NC_002940	TAA	2	6	223109	223114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151527
4624	NC_002940	ACA	2	6	223188	223193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151527
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4626	NC_002940	TTA	2	6	223308	223313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151527
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4754	NC_002940	ACA	2	6	228973	228978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151535
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