MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 58906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_002607	TGCG	2	8	187691	187698	0 %	25 %	50 %	25 %	15789522
5003	NC_002607	GC	3	6	187705	187710	0 %	0 %	50 %	50 %	15789522
5004	NC_002607	ACGG	2	8	187714	187721	25 %	0 %	50 %	25 %	15789522
5005	NC_002607	TGC	2	6	187732	187737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789523
5006	NC_002607	CTG	3	9	187746	187754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789523
5007	NC_002607	GCT	2	6	187760	187765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789523
5008	NC_002607	CGC	3	9	187769	187777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789523
5009	NC_002607	CCCA	2	8	187826	187833	25 %	0 %	0 %	75 %	15789523
5010	NC_002607	CGA	2	6	187837	187842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789523
5011	NC_002607	CTG	2	6	187843	187848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789523
5012	NC_002607	GGC	2	6	187859	187864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789523
5013	NC_002607	CCG	2	6	187915	187920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789523
5014	NC_002607	GC	3	6	187926	187931	0 %	0 %	50 %	50 %	15789523
5015	NC_002607	GC	3	6	188000	188005	0 %	0 %	50 %	50 %	15789523
5016	NC_002607	CCG	2	6	188009	188014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789523
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5018	NC_002607	GACCGT	2	12	188057	188068	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15789523
5019	NC_002607	GC	4	8	188069	188076	0 %	0 %	50 %	50 %	15789523
5020	NC_002607	CGG	2	6	188101	188106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789523
5021	NC_002607	CGA	2	6	188123	188128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789523
5022	NC_002607	CGA	2	6	188141	188146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789523
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5031	NC_002607	CGC	2	6	188362	188367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789524
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5123	NC_002607	CGACG	2	10	191319	191328	20 %	0 %	40 %	40 %	15789526
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5130	NC_002607	CGT	2	6	191498	191503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789526
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5370	NC_002607	CAC	2	6	199524	199529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16554460
5371	NC_002607	GCCC	3	12	199575	199586	0 %	0 %	25 %	75 %	16554460
5372	NC_002607	GAC	2	6	199587	199592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16554460
5373	NC_002607	GCG	2	6	199627	199632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16554460
5374	NC_002607	GTG	2	6	199660	199665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16554460
5375	NC_002607	GCCC	2	8	199686	199693	0 %	0 %	25 %	75 %	16554460
5376	NC_002607	CGCA	2	8	199773	199780	25 %	0 %	25 %	50 %	16554460
5377	NC_002607	CCG	2	6	199814	199819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16554460
5378	NC_002607	CCG	2	6	199859	199864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16554460
5379	NC_002607	GCCG	2	8	199877	199884	0 %	0 %	50 %	50 %	16554460
5380	NC_002607	GTCGCT	2	12	199893	199904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16554460
5381	NC_002607	GTA	2	6	199908	199913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16554460
5382	NC_002607	GC	3	6	199927	199932	0 %	0 %	50 %	50 %	16554460
5383	NC_002607	CGTCGG	2	12	199990	200001	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	16554461
5384	NC_002607	CGGC	2	8	200052	200059	0 %	0 %	50 %	50 %	16554461
5385	NC_002607	GCTCGC	2	12	200119	200130	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	16554461
5386	NC_002607	CAC	2	6	200141	200146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16554461
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5388	NC_002607	TCG	2	6	200190	200195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16554461
5389	NC_002607	GCG	2	6	200235	200240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16554461
5390	NC_002607	GCGG	2	8	200270	200277	0 %	0 %	75 %	25 %	16554461
5391	NC_002607	CGGA	2	8	200297	200304	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5392	NC_002607	CGGC	2	8	200305	200312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5393	NC_002607	GCA	2	6	200365	200370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5396	NC_002607	CGT	2	6	200451	200456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789538
5397	NC_002607	CTCG	2	8	200475	200482	0 %	25 %	25 %	50 %	15789538
5398	NC_002607	CGC	3	9	200526	200534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789538
5399	NC_002607	CGG	2	6	200535	200540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789538
5400	NC_002607	CGC	2	6	200547	200552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789538
5401	NC_002607	TCG	2	6	200570	200575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789538
5402	NC_002607	TCG	2	6	200585	200590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789538
5403	NC_002607	GTGGG	2	10	200611	200620	0 %	20 %	80 %	0 %	15789538
5404	NC_002607	TCC	2	6	200636	200641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15789538
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5406	NC_002607	CAT	2	6	200658	200663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15789538
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5432	NC_002607	G	6	6	201598	201603	0 %	0 %	100 %	0 %	15789539
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5435	NC_002607	GAG	2	6	201636	201641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15789540
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5485	NC_002607	GC	3	6	203036	203041	0 %	0 %	50 %	50 %	15789541
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5492	NC_002607	GGT	2	6	203348	203353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15789542
5493	NC_002607	GCC	2	6	203441	203446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789542
5494	NC_002607	GTC	2	6	203477	203482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789542
5495	NC_002607	GT	3	6	203519	203524	0 %	50 %	50 %	0 %	15789542
5496	NC_002607	CGG	2	6	203542	203547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789542
5497	NC_002607	GAC	2	6	203624	203629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789542
5498	NC_002607	CGC	2	6	203638	203643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789542
5499	NC_002607	CAC	2	6	203668	203673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789542
5500	NC_002607	GCG	2	6	203679	203684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789542

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