MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC100

Total Repeats: 4359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_001869	TCT	2	6	153998	154003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_001869	TCG	2	6	154087	154092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803686
3503	NC_001869	GAT	2	6	154095	154100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803686
3504	NC_001869	CGT	2	6	154115	154120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803686
3505	NC_001869	GTCG	2	8	154130	154137	0 %	25 %	50 %	25 %	10803686
3506	NC_001869	TCG	2	6	154144	154149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803686
3507	NC_001869	ATC	2	6	154191	154196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803686
3508	NC_001869	CAG	2	6	154237	154242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803686
3509	NC_001869	CGG	2	6	154352	154357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803686
3510	NC_001869	GGT	2	6	154394	154399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803686
3511	NC_001869	CTG	2	6	154590	154595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_001869	CT	3	6	154656	154661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3513	NC_001869	TC	3	6	154816	154821	0 %	50 %	0 %	50 %	10803687
3514	NC_001869	CGA	2	6	154867	154872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803687
3515	NC_001869	GCACA	2	10	154888	154897	40 %	0 %	20 %	40 %	10803687
3516	NC_001869	AGC	2	6	154900	154905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803687
3517	NC_001869	TCCG	2	8	154910	154917	0 %	25 %	25 %	50 %	10803687
3518	NC_001869	ACC	2	6	154931	154936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803687
3519	NC_001869	CGTGA	2	10	154965	154974	20 %	20 %	40 %	20 %	10803687
3520	NC_001869	AGG	4	12	155175	155186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803688
3521	NC_001869	TGCC	2	8	155198	155205	0 %	25 %	25 %	50 %	10803688
3522	NC_001869	CA	3	6	155245	155250	50 %	0 %	0 %	50 %	10803688
3523	NC_001869	CTC	2	6	155297	155302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803688
3524	NC_001869	CGC	2	6	155311	155316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803688
3525	NC_001869	CCA	2	6	155323	155328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803688
3526	NC_001869	AAT	2	6	155329	155334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10803688
3527	NC_001869	TCGA	2	8	155336	155343	25 %	25 %	25 %	25 %	10803688
3528	NC_001869	CCGC	2	8	155379	155386	0 %	0 %	25 %	75 %	10803688
3529	NC_001869	GCT	2	6	155428	155433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803688
3530	NC_001869	TCA	2	6	155448	155453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803688
3531	NC_001869	GCT	2	6	155462	155467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803688
3532	NC_001869	GAG	2	6	155471	155476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803688
3533	NC_001869	CTA	2	6	155539	155544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803688
3534	NC_001869	CGT	2	6	155596	155601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803688
3535	NC_001869	TCGCG	2	10	155647	155656	0 %	20 %	40 %	40 %	10803688
3536	NC_001869	TTC	2	6	155675	155680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803688
3537	NC_001869	CGG	2	6	155808	155813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803689
3538	NC_001869	CGGCG	2	10	155869	155878	0 %	0 %	60 %	40 %	10803689
3539	NC_001869	TCG	2	6	155940	155945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803689
3540	NC_001869	GCT	2	6	155968	155973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803689
3541	NC_001869	GAA	2	6	156138	156143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803690
3542	NC_001869	AGA	2	6	156303	156308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803690
3543	NC_001869	CAC	2	6	156373	156378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803690
3544	NC_001869	AC	3	6	156403	156408	50 %	0 %	0 %	50 %	10803690
3545	NC_001869	ACC	2	6	156446	156451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803690
3546	NC_001869	CGA	2	6	156480	156485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803690
3547	NC_001869	TGC	2	6	156609	156614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803690
3548	NC_001869	ACT	2	6	156620	156625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803690
3549	NC_001869	CCTG	2	8	156681	156688	0 %	25 %	25 %	50 %	10803690
3550	NC_001869	ACG	2	6	156710	156715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803690
3551	NC_001869	CAC	2	6	156732	156737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803690
3552	NC_001869	TAC	2	6	156985	156990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_001869	ATAG	2	8	157165	157172	50 %	25 %	25 %	0 %	10803691
3554	NC_001869	CG	3	6	157287	157292	0 %	0 %	50 %	50 %	10803691
3555	NC_001869	CCAC	2	8	157301	157308	25 %	0 %	0 %	75 %	10803691
3556	NC_001869	ATG	2	6	157313	157318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803691
3557	NC_001869	TCC	2	6	157319	157324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803691
3558	NC_001869	TTC	2	6	157414	157419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803691
3559	NC_001869	GTC	2	6	157441	157446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803691
3560	NC_001869	CGAG	2	8	157481	157488	25 %	0 %	50 %	25 %	10803691
3561	NC_001869	CGAG	2	8	157503	157510	25 %	0 %	50 %	25 %	10803691
3562	NC_001869	TCG	3	9	157514	157522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803691
3563	NC_001869	GCT	2	6	157572	157577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803691
3564	NC_001869	CGA	2	6	157581	157586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803691
3565	NC_001869	TCGC	2	8	157620	157627	0 %	25 %	25 %	50 %	10803691
3566	NC_001869	TCG	2	6	157646	157651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803691
3567	NC_001869	TTC	2	6	157667	157672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803691
3568	NC_001869	GACGTC	2	12	157753	157764	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	10803691
3569	NC_001869	CTC	2	6	157825	157830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803691
3570	NC_001869	GCG	2	6	157910	157915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803691
3571	NC_001869	ACG	2	6	157994	157999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803691
3572	NC_001869	GAA	2	6	158016	158021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803691
3573	NC_001869	CGA	2	6	158025	158030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803691
3574	NC_001869	TCG	2	6	158042	158047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803691
3575	NC_001869	GGT	2	6	158058	158063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803691
3576	NC_001869	GAC	2	6	158075	158080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803691
3577	NC_001869	GACGA	2	10	158135	158144	40 %	0 %	40 %	20 %	10803692
3578	NC_001869	CG	3	6	158160	158165	0 %	0 %	50 %	50 %	10803692
3579	NC_001869	CGA	2	6	158200	158205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803692
3580	NC_001869	TGC	2	6	158403	158408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803692
3581	NC_001869	ACG	2	6	158521	158526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_001869	G	6	6	158526	158531	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_001869	AGGA	2	8	158546	158553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_001869	TA	3	6	158596	158601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_001869	CGA	2	6	158656	158661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_001869	AG	3	6	158683	158688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_001869	TGC	2	6	158775	158780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803693
3588	NC_001869	GAC	2	6	158782	158787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803693
3589	NC_001869	CGA	2	6	158789	158794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803693
3590	NC_001869	CTG	2	6	158818	158823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803693
3591	NC_001869	CAG	2	6	158836	158841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803693
3592	NC_001869	GAAC	2	8	158859	158866	50 %	0 %	25 %	25 %	10803693
3593	NC_001869	GAT	2	6	158893	158898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803693
3594	NC_001869	ACT	2	6	158909	158914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803693
3595	NC_001869	TTGT	2	8	158942	158949	0 %	75 %	25 %	0 %	10803693
3596	NC_001869	GA	3	6	158952	158957	50 %	0 %	50 %	0 %	10803693
3597	NC_001869	CGA	2	6	158970	158975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803693
3598	NC_001869	CCT	2	6	158996	159001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803693
3599	NC_001869	CT	3	6	159067	159072	0 %	50 %	0 %	50 %	10803693
3600	NC_001869	CT	3	6	159096	159101	0 %	50 %	0 %	50 %	10803693
3601	NC_001869	CTGC	2	8	159183	159190	0 %	25 %	25 %	50 %	10803693
3602	NC_001869	CGG	2	6	159195	159200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803693
3603	NC_001869	GAA	2	6	159216	159221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803693
3604	NC_001869	TGC	2	6	159246	159251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803693
3605	NC_001869	CT	4	8	159341	159348	0 %	50 %	0 %	50 %	10803693
3606	NC_001869	TCG	2	6	159425	159430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803693
3607	NC_001869	TC	3	6	159456	159461	0 %	50 %	0 %	50 %	10803693
3608	NC_001869	GC	4	8	159491	159498	0 %	0 %	50 %	50 %	10803693
3609	NC_001869	GC	3	6	159500	159505	0 %	0 %	50 %	50 %	10803693
3610	NC_001869	GAGTTC	2	12	159535	159546	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	10803693
3611	NC_001869	GTA	2	6	159703	159708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803693
3612	NC_001869	CGA	2	6	159759	159764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803693
3613	NC_001869	TCG	2	6	159788	159793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803693
3614	NC_001869	ACA	2	6	159814	159819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10803693
3615	NC_001869	TCG	2	6	159842	159847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803693
3616	NC_001869	GCC	2	6	159901	159906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803693
3617	NC_001869	TCG	2	6	159920	159925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803693
3618	NC_001869	TCG	2	6	159929	159934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803693
3619	NC_001869	TTC	2	6	160024	160029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803693
3620	NC_001869	TTCG	2	8	160032	160039	0 %	50 %	25 %	25 %	10803693
3621	NC_001869	TCC	2	6	160058	160063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803693
3622	NC_001869	TCG	2	6	160067	160072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803693
3623	NC_001869	GA	3	6	160100	160105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_001869	ACC	2	6	160142	160147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3991	NC_001869	GTT	2	6	176350	176355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803713
3992	NC_001869	TCG	3	9	176384	176392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3993	NC_001869	TCG	2	6	176412	176417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3994	NC_001869	GAT	2	6	176419	176424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803713
3995	NC_001869	GGCC	2	8	176437	176444	0 %	0 %	50 %	50 %	10803713
3996	NC_001869	GCG	2	6	176445	176450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803713
3997	NC_001869	CGA	2	6	176472	176477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3998	NC_001869	TCG	2	6	176510	176515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3999	NC_001869	CGG	3	9	176550	176558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803713
4000	NC_001869	CGG	2	6	176562	176567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803713

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