MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC100

Total Repeats: 4359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_001869	CGG	2	6	111177	111182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803646
2502	NC_001869	GAG	2	6	111191	111196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803646
2503	NC_001869	GGA	3	9	111318	111326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803646
2504	NC_001869	AAGT	2	8	111545	111552	50 %	25 %	25 %	0 %	10803646
2505	NC_001869	GAA	2	6	111706	111711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803646
2506	NC_001869	AGTG	2	8	111772	111779	25 %	25 %	50 %	0 %	10803646
2507	NC_001869	GGA	2	6	111780	111785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803646
2508	NC_001869	AG	3	6	111792	111797	50 %	0 %	50 %	0 %	10803646
2509	NC_001869	CAG	2	6	111805	111810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803646
2510	NC_001869	GCGTGA	2	12	111876	111887	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	10803646
2511	NC_001869	GAG	2	6	111931	111936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803646
2512	NC_001869	TGA	2	6	111944	111949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803646
2513	NC_001869	GA	4	8	111980	111987	50 %	0 %	50 %	0 %	10803646
2514	NC_001869	TGGAG	2	10	112028	112037	20 %	20 %	60 %	0 %	10803647
2515	NC_001869	GAA	2	6	112125	112130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803647
2516	NC_001869	TCA	2	6	112141	112146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803647
2517	NC_001869	CAT	2	6	112169	112174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803647
2518	NC_001869	GAG	2	6	112215	112220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803647
2519	NC_001869	CGT	2	6	112289	112294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803647
2520	NC_001869	GAG	2	6	112407	112412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803647
2521	NC_001869	TTA	2	6	112550	112555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_001869	CA	3	6	112673	112678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2523	NC_001869	G	6	6	112789	112794	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_001869	CCA	2	6	112877	112882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2525	NC_001869	CAT	2	6	112893	112898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_001869	GCA	2	6	112948	112953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_001869	CGT	3	9	113026	113034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803648
2528	NC_001869	TCG	2	6	113172	113177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803648
2529	NC_001869	GCG	2	6	113195	113200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803648
2530	NC_001869	CGA	2	6	113265	113270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803648
2531	NC_001869	TGC	2	6	113272	113277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803648
2532	NC_001869	GTC	2	6	113300	113305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803648
2533	NC_001869	AGC	2	6	113363	113368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803648
2534	NC_001869	GGC	2	6	113404	113409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803648
2535	NC_001869	CAG	2	6	113414	113419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803648
2536	NC_001869	TCA	2	6	113460	113465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803648
2537	NC_001869	CAG	2	6	113477	113482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803648
2538	NC_001869	CAG	2	6	113525	113530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803648
2539	NC_001869	GGT	2	6	113575	113580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803648
2540	NC_001869	CATTCC	2	12	113638	113649	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	10803648
2541	NC_001869	GAC	2	6	113680	113685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803648
2542	NC_001869	TCA	2	6	113697	113702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803648
2543	NC_001869	GAC	2	6	113758	113763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803648
2544	NC_001869	TC	3	6	113767	113772	0 %	50 %	0 %	50 %	10803648
2545	NC_001869	TTG	2	6	113871	113876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803648
2546	NC_001869	CCG	2	6	113880	113885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803648
2547	NC_001869	CGG	2	6	113911	113916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803648
2548	NC_001869	CGC	2	6	113959	113964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803648
2549	NC_001869	CA	3	6	113984	113989	50 %	0 %	0 %	50 %	10803648
2550	NC_001869	CGG	2	6	114006	114011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803648
2551	NC_001869	CGACG	2	10	114016	114025	20 %	0 %	40 %	40 %	10803648
2552	NC_001869	CTC	2	6	114074	114079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803648
2553	NC_001869	TGG	2	6	114105	114110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803648
2554	NC_001869	GGA	2	6	114180	114185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_001869	AAAC	2	8	114191	114198	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2556	NC_001869	GCA	2	6	114233	114238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_001869	ATG	2	6	114244	114249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_001869	TCG	2	6	114270	114275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_001869	AG	3	6	114303	114308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_001869	AGA	2	6	114317	114322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_001869	GCT	2	6	114334	114339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_001869	GTT	2	6	114345	114350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_001869	AGC	2	6	114371	114376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_001869	TCC	2	6	114380	114385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2565	NC_001869	GGT	2	6	114400	114405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_001869	GAG	2	6	114411	114416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_001869	ACT	2	6	114555	114560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803649
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2570	NC_001869	GCC	2	6	114681	114686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803649
2571	NC_001869	CGC	2	6	114701	114706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803649
2572	NC_001869	CGA	2	6	114733	114738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803649
2573	NC_001869	TCTG	2	8	114786	114793	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2574	NC_001869	CCT	2	6	114846	114851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2575	NC_001869	CTG	2	6	114869	114874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_001869	GGGGT	2	10	114892	114901	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_001869	TAT	2	6	114945	114950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_001869	G	6	6	114999	115004	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_001869	AT	3	6	115048	115053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_001869	TGA	2	6	115179	115184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803650
2581	NC_001869	TGA	2	6	115281	115286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803650
2582	NC_001869	CGA	2	6	115302	115307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803650
2583	NC_001869	CT	3	6	115384	115389	0 %	50 %	0 %	50 %	10803650
2584	NC_001869	CTT	2	6	115450	115455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803650
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2586	NC_001869	TCG	2	6	115481	115486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803650
2587	NC_001869	TGT	2	6	115514	115519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_001869	GACG	2	8	115543	115550	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2589	NC_001869	AT	3	6	115590	115595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_001869	GA	3	6	115599	115604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_001869	ACTC	2	8	115613	115620	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2592	NC_001869	GGC	2	6	115646	115651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_001869	TG	3	6	115690	115695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_001869	CT	3	6	115764	115769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2595	NC_001869	AAC	2	6	116055	116060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10803651
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2597	NC_001869	GGA	2	6	116201	116206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803651
2598	NC_001869	TTC	2	6	116209	116214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803651
2599	NC_001869	TC	3	6	116281	116286	0 %	50 %	0 %	50 %	10803651
2600	NC_001869	GCA	2	6	116366	116371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803651
2601	NC_001869	CATC	2	8	116381	116388	25 %	25 %	0 %	50 %	10803651
2602	NC_001869	CGAG	2	8	116393	116400	25 %	0 %	50 %	25 %	10803651
2603	NC_001869	AGT	2	6	116420	116425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803651
2604	NC_001869	TTC	2	6	116525	116530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_001869	CAA	2	6	116601	116606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_001869	GGC	2	6	116715	116720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_001869	GT	3	6	116739	116744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_001869	GT	3	6	116762	116767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_001869	ACG	2	6	116841	116846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_001869	GTC	2	6	116854	116859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_001869	CTGG	2	8	116870	116877	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2612	NC_001869	AAT	2	6	116881	116886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_001869	CCG	2	6	116895	116900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2614	NC_001869	CT	3	6	116998	117003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2615	NC_001869	ACG	2	6	117052	117057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_001869	GTC	2	6	117070	117075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_001869	CA	3	6	117078	117083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2618	NC_001869	GCT	2	6	117135	117140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2619	NC_001869	GAG	2	6	117149	117154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803652
2620	NC_001869	CCG	2	6	117165	117170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803652
2621	NC_001869	GTACC	2	10	117322	117331	20 %	20 %	20 %	40 %	10803652
2622	NC_001869	CGA	2	6	117337	117342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
2623	NC_001869	CCAC	2	8	117351	117358	25 %	0 %	0 %	75 %	10803652
2624	NC_001869	CGC	2	6	117373	117378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803652
2625	NC_001869	TCA	2	6	117383	117388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803652
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2627	NC_001869	GGT	2	6	117403	117408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803652
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2746	NC_001869	ATCA	2	8	121943	121950	50 %	25 %	0 %	25 %	10803653
2747	NC_001869	CGC	3	9	121993	122001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803653
2748	NC_001869	GA	3	6	122025	122030	50 %	0 %	50 %	0 %	10803653
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