MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC100

Total Repeats: 4359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_001869	GTC	2	6	67571	67576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803614
1502	NC_001869	CGC	2	6	67577	67582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803614
1503	NC_001869	GAA	2	6	67709	67714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803614
1504	NC_001869	CGCGA	2	10	67733	67742	20 %	0 %	40 %	40 %	10803614
1505	NC_001869	GAC	2	6	67787	67792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803614
1506	NC_001869	GTA	2	6	67844	67849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803614
1507	NC_001869	CCT	2	6	67912	67917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803614
1508	NC_001869	CAG	2	6	67921	67926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803614
1509	NC_001869	GAT	2	6	67934	67939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803614
1510	NC_001869	AGC	2	6	67956	67961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803614
1511	NC_001869	GCGG	2	8	68003	68010	0 %	0 %	75 %	25 %	10803614
1512	NC_001869	CGT	2	6	68041	68046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803614
1513	NC_001869	ATT	2	6	68055	68060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10803614
1514	NC_001869	TGG	2	6	68061	68066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803614
1515	NC_001869	GAG	2	6	68087	68092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803614
1516	NC_001869	TG	3	6	68139	68144	0 %	50 %	50 %	0 %	10803614
1517	NC_001869	GGCA	2	8	68184	68191	25 %	0 %	50 %	25 %	10803615
1518	NC_001869	CCT	4	12	68203	68214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803615
1519	NC_001869	GACA	2	8	68220	68227	50 %	0 %	25 %	25 %	10803615
1520	NC_001869	CGTCA	2	10	68413	68422	20 %	20 %	20 %	40 %	10803616
1521	NC_001869	GGT	2	6	68453	68458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803616
1522	NC_001869	CGGA	2	8	68472	68479	25 %	0 %	50 %	25 %	10803616
1523	NC_001869	GCT	2	6	68484	68489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803616
1524	NC_001869	CTGTG	2	10	68491	68500	0 %	40 %	40 %	20 %	10803616
1525	NC_001869	TCG	2	6	68517	68522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803616
1526	NC_001869	GA	3	6	68568	68573	50 %	0 %	50 %	0 %	10803616
1527	NC_001869	AG	3	6	68728	68733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_001869	CAG	2	6	68794	68799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_001869	ACC	2	6	68990	68995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803617
1530	NC_001869	CCG	2	6	69032	69037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803617
1531	NC_001869	CTG	2	6	69147	69152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803617
1532	NC_001869	GAT	2	6	69193	69198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803617
1533	NC_001869	ACG	2	6	69239	69244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803617
1534	NC_001869	CGAC	2	8	69252	69259	25 %	0 %	25 %	50 %	10803617
1535	NC_001869	ACG	2	6	69269	69274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803617
1536	NC_001869	TCA	2	6	69287	69292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803617
1537	NC_001869	CGA	2	6	69297	69302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803617
1538	NC_001869	ATC	2	6	69328	69333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803617
1539	NC_001869	CAA	2	6	69378	69383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10803617
1540	NC_001869	GAA	2	6	69385	69390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803617
1541	NC_001869	CGA	2	6	69408	69413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803617
1542	NC_001869	ACG	2	6	69467	69472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803617
1543	NC_001869	GCT	2	6	69493	69498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803617
1544	NC_001869	AGG	2	6	69507	69512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803617
1545	NC_001869	CGC	2	6	69561	69566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803617
1546	NC_001869	CCG	2	6	69605	69610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803617
1547	NC_001869	AG	3	6	69634	69639	50 %	0 %	50 %	0 %	10803617
1548	NC_001869	GAT	2	6	69649	69654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803617
1549	NC_001869	TCC	2	6	69656	69661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803617
1550	NC_001869	ACG	2	6	69740	69745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803617
1551	NC_001869	CGA	2	6	69807	69812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803617
1552	NC_001869	CTCG	2	8	69906	69913	0 %	25 %	25 %	50 %	10803617
1553	NC_001869	AG	3	6	70085	70090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_001869	AGT	2	6	70094	70099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_001869	TAGA	2	8	70112	70119	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_001869	GTG	2	6	70163	70168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_001869	TG	3	6	70222	70227	0 %	50 %	50 %	0 %	10803618
1558	NC_001869	GAC	2	6	70305	70310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803618
1559	NC_001869	ATG	2	6	70523	70528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803618
1560	NC_001869	GAC	2	6	70606	70611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803618
1561	NC_001869	CAG	2	6	70612	70617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803618
1562	NC_001869	ACT	2	6	70676	70681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803618
1563	NC_001869	ATA	2	6	70768	70773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10803618
1564	NC_001869	GAACT	2	10	70880	70889	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1565	NC_001869	TGA	2	6	70893	70898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_001869	TCG	2	6	70910	70915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_001869	CTT	2	6	71079	71084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_001869	TCT	2	6	71149	71154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_001869	GAG	2	6	71377	71382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_001869	TGG	2	6	71388	71393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_001869	TGG	2	6	71427	71432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_001869	CGA	2	6	71433	71438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_001869	GAA	2	6	71482	71487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_001869	TCA	2	6	71489	71494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_001869	CAG	2	6	71524	71529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_001869	AGT	2	6	71550	71555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_001869	TAG	2	6	71657	71662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_001869	AG	3	6	71739	71744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_001869	TTC	2	6	71787	71792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_001869	GGT	2	6	71802	71807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_001869	A	6	6	72029	72034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_001869	ATC	2	6	72088	72093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_001869	TAGA	2	8	72125	72132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_001869	TGG	2	6	72145	72150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_001869	CAGC	2	8	72210	72217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_001869	TCG	2	6	72346	72351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803619
1587	NC_001869	CGT	2	6	72392	72397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803619
1588	NC_001869	TTG	2	6	72409	72414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803619
1589	NC_001869	TCC	3	9	72445	72453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803619
1590	NC_001869	TCG	2	6	72511	72516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803619
1591	NC_001869	GGA	2	6	72524	72529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803619
1592	NC_001869	GTTCG	2	10	72567	72576	0 %	40 %	40 %	20 %	10803619
1593	NC_001869	GTC	2	6	72577	72582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803619
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1596	NC_001869	GGCC	2	8	72635	72642	0 %	0 %	50 %	50 %	10803619
1597	NC_001869	CGA	2	6	72726	72731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803619
1598	NC_001869	GA	3	6	72730	72735	50 %	0 %	50 %	0 %	10803619
1599	NC_001869	AGCG	2	8	72797	72804	25 %	0 %	50 %	25 %	10803619
1600	NC_001869	ACG	2	6	72836	72841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803619
1601	NC_001869	GGA	2	6	72842	72847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803619
1602	NC_001869	TGA	2	6	72890	72895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803619
1603	NC_001869	GCT	2	6	72902	72907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803619
1604	NC_001869	CCGT	2	8	72943	72950	0 %	25 %	25 %	50 %	10803619
1605	NC_001869	GAC	2	6	72951	72956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803619
1606	NC_001869	CTCCG	2	10	72957	72966	0 %	20 %	20 %	60 %	10803619
1607	NC_001869	CA	3	6	73013	73018	50 %	0 %	0 %	50 %	10803619
1608	NC_001869	TC	3	6	73021	73026	0 %	50 %	0 %	50 %	10803619
1609	NC_001869	GAG	2	6	73032	73037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803619
1610	NC_001869	GGT	2	6	73253	73258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_001869	CCAT	2	8	73308	73315	25 %	25 %	0 %	50 %	10803620
1612	NC_001869	ATCG	2	8	73324	73331	25 %	25 %	25 %	25 %	10803620
1613	NC_001869	TGA	2	6	73341	73346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803620
1614	NC_001869	AGCG	2	8	73432	73439	25 %	0 %	50 %	25 %	10803620
1615	NC_001869	TGA	2	6	73441	73446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803620
1616	NC_001869	CTC	2	6	73526	73531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803620
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1618	NC_001869	CAT	2	6	73843	73848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803620
1619	NC_001869	GA	3	6	73887	73892	50 %	0 %	50 %	0 %	10803620
1620	NC_001869	CGG	2	6	73893	73898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803620
1621	NC_001869	AGT	2	6	73954	73959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803620
1622	NC_001869	TTG	2	6	73998	74003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803620
1623	NC_001869	GTT	2	6	74133	74138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803620
1624	NC_001869	GCG	2	6	74161	74166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803620
1625	NC_001869	TCT	2	6	74184	74189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803620
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1627	NC_001869	CTG	2	6	74247	74252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803620
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