MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 16469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000921	CAT	2	6	19	24	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_000921	GAT	3	9	162	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611072
3	NC_000921	GTT	2	6	345	350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611072
4	NC_000921	TTC	2	6	396	401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611072
5	NC_000921	ACA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611072
6	NC_000921	AAT	2	6	497	502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611073
7	NC_000921	TTA	2	6	533	538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611073
8	NC_000921	CTC	2	6	799	804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15611073
9	NC_000921	CTT	2	6	840	845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611073
10	NC_000921	TGA	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611073
11	NC_000921	CCG	4	12	1083	1094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611074
12	NC_000921	CCA	2	6	1227	1232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611074
13	NC_000921	GCT	2	6	1252	1257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611074
14	NC_000921	CTA	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611074
15	NC_000921	GGC	2	6	1443	1448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611074
16	NC_000921	GTT	2	6	1663	1668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611074
17	NC_000921	CTT	2	6	1697	1702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611074
18	NC_000921	TTC	2	6	1802	1807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611075
19	NC_000921	GTT	2	6	1937	1942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611075
20	NC_000921	TTC	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611075
21	NC_000921	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611075
22	NC_000921	TCA	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611075
23	NC_000921	AGC	2	6	2816	2821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611076
24	NC_000921	GTG	2	6	3005	3010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611076
25	NC_000921	AGA	2	6	3103	3108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611076
26	NC_000921	GCC	2	6	3171	3176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611076
27	NC_000921	GTT	2	6	3616	3621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611077
28	NC_000921	ATC	2	6	3700	3705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611077
29	NC_000921	ATT	2	6	3944	3949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611077
30	NC_000921	TGT	2	6	3955	3960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611077
31	NC_000921	TGG	2	6	4013	4018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611077
32	NC_000921	GGT	2	6	4123	4128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000921	TAT	2	6	4171	4176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000921	TGG	2	6	4211	4216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000921	TGG	2	6	4341	4346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000921	GTG	2	6	4453	4458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000921	ACC	2	6	4485	4490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_000921	GGT	2	6	4498	4503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000921	AAC	2	6	4719	4724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_000921	TAA	2	6	4845	4850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000921	TTA	2	6	4854	4859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000921	TGT	2	6	4936	4941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000921	ATT	2	6	4946	4951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000921	AAG	2	6	5050	5055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000921	ATT	2	6	5667	5672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611078
46	NC_000921	TGG	2	6	5765	5770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611078
47	NC_000921	TTG	2	6	5968	5973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
48	NC_000921	TAA	2	6	6036	6041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611078
49	NC_000921	TTA	2	6	6094	6099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611078
50	NC_000921	GTG	2	6	6163	6168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611078
51	NC_000921	GTT	2	6	6183	6188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
52	NC_000921	CAA	2	6	6231	6236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611078
53	NC_000921	TGT	2	6	6284	6289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
54	NC_000921	GTT	2	6	6339	6344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
55	NC_000921	CAG	2	6	6515	6520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611078
56	NC_000921	GCG	2	6	6542	6547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611078
57	NC_000921	CTT	2	6	6758	6763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611078
58	NC_000921	TAG	8	24	6785	6808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611078
59	NC_000921	TTA	2	6	6817	6822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611078
60	NC_000921	GTT	2	6	6838	6843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
61	NC_000921	TTG	2	6	6909	6914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
62	NC_000921	GTT	2	6	6978	6983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
63	NC_000921	TGT	2	6	7051	7056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
64	NC_000921	CCG	2	6	7112	7117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611078
65	NC_000921	GCT	2	6	7227	7232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611078
66	NC_000921	GTT	2	6	7257	7262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
67	NC_000921	GGT	2	6	7590	7595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000921	GAT	2	6	7741	7746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000921	CAT	2	6	7761	7766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611079
70	NC_000921	GCC	2	6	7767	7772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611079
71	NC_000921	TCT	2	6	7828	7833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
72	NC_000921	AAT	2	6	7926	7931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611079
73	NC_000921	CTT	2	6	7934	7939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
74	NC_000921	CCA	2	6	8020	8025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611079
75	NC_000921	ATG	2	6	8077	8082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611079
76	NC_000921	TCA	2	6	8101	8106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611079
77	NC_000921	CCG	2	6	8155	8160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611079
78	NC_000921	CTT	2	6	8174	8179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
79	NC_000921	CCG	2	6	8183	8188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611079
80	NC_000921	GTG	2	6	8410	8415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611079
81	NC_000921	TTC	2	6	8490	8495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
82	NC_000921	TGA	2	6	8498	8503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611079
83	NC_000921	CCG	2	6	8509	8514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611079
84	NC_000921	CAC	2	6	8610	8615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611079
85	NC_000921	GAT	2	6	8652	8657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611079
86	NC_000921	TAG	2	6	8691	8696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611079
87	NC_000921	CTT	2	6	8864	8869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
88	NC_000921	TCT	2	6	8974	8979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
89	NC_000921	CTT	2	6	9095	9100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
90	NC_000921	CTT	2	6	9173	9178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
91	NC_000921	TAA	3	9	9409	9417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000921	TCT	2	6	9529	9534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611080
93	NC_000921	CTT	2	6	9611	9616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611080
94	NC_000921	GAT	3	9	9699	9707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611080
95	NC_000921	TCT	2	6	9727	9732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611080
96	NC_000921	CTA	2	6	9743	9748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611080
97	NC_000921	TTA	2	6	9830	9835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000921	ATT	2	6	9909	9914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000921	CAA	2	6	9978	9983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_000921	GAA	2	6	10051	10056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000921	TTG	2	6	10171	10176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611081
102	NC_000921	GAA	2	6	10187	10192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611081
103	NC_000921	TTA	2	6	10366	10371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611081
104	NC_000921	AGA	2	6	10381	10386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611081
105	NC_000921	ACC	2	6	10389	10394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611081
106	NC_000921	AAG	2	6	10422	10427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611081
107	NC_000921	ATT	2	6	10455	10460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611081
108	NC_000921	CAT	2	6	10636	10641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611081
109	NC_000921	GTG	2	6	10670	10675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611081
110	NC_000921	ATG	2	6	10950	10955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611081
111	NC_000921	AAC	2	6	11042	11047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611081
112	NC_000921	ATC	2	6	11073	11078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611081
113	NC_000921	AGA	2	6	11428	11433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611081
114	NC_000921	GAC	2	6	11528	11533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611081
115	NC_000921	TTA	3	9	11549	11557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611081
116	NC_000921	TTG	2	6	11606	11611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611081
117	NC_000921	TGT	2	6	11792	11797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611082
118	NC_000921	TGT	2	6	11960	11965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611082
119	NC_000921	AAG	2	6	12119	12124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611082
120	NC_000921	TAA	2	6	12429	12434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611082
121	NC_000921	TGG	3	9	12530	12538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611082
122	NC_000921	GAA	3	9	12547	12555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611082
123	NC_000921	TGG	2	6	12629	12634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611082
124	NC_000921	AGA	2	6	12651	12656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611082
125	NC_000921	AGG	2	6	12874	12879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000921	TTA	2	6	12961	12966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611083
127	NC_000921	GAA	2	6	12978	12983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611083
128	NC_000921	GTT	2	6	13001	13006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611083
129	NC_000921	GTT	2	6	13045	13050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611083
130	NC_000921	TAA	2	6	13055	13060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611083
131	NC_000921	ATT	2	6	13068	13073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611083
132	NC_000921	ATG	2	6	13141	13146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611083
133	NC_000921	ACC	2	6	13444	13449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611083
134	NC_000921	GGT	2	6	13586	13591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611083
135	NC_000921	TTG	2	6	13594	13599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611083
136	NC_000921	AGA	2	6	13646	13651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611083
137	NC_000921	AGT	2	6	13708	13713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611083
138	NC_000921	ACC	2	6	13764	13769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_000921	ATG	2	6	13856	13861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611084
140	NC_000921	GTG	2	6	14072	14077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611084
141	NC_000921	GAA	2	6	14163	14168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611085
142	NC_000921	ATT	2	6	14350	14355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611085
143	NC_000921	GAA	2	6	14489	14494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611086
144	NC_000921	AAC	2	6	14495	14500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611086
145	NC_000921	ATG	2	6	14514	14519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611086
146	NC_000921	TCC	2	6	14559	14564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15611086
147	NC_000921	AAG	2	6	14760	14765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611086
148	NC_000921	TAG	2	6	15027	15032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611086
149	NC_000921	ATT	2	6	15084	15089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611086
150	NC_000921	GGA	2	6	15394	15399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15611086
151	NC_000921	ACC	2	6	15522	15527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611086
152	NC_000921	ATT	2	6	15645	15650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611086
153	NC_000921	AAG	2	6	15678	15683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611086
154	NC_000921	ATA	2	6	15690	15695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611086
155	NC_000921	ATG	2	6	15782	15787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611086
156	NC_000921	AAG	2	6	15993	15998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611086
157	NC_000921	AGA	2	6	16003	16008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611086
158	NC_000921	AGA	2	6	16279	16284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611086
159	NC_000921	GTG	3	9	16406	16414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611086
160	NC_000921	CTG	2	6	16844	16849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_000921	TAT	2	6	17104	17109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611087
162	NC_000921	GAA	2	6	17110	17115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611087
163	NC_000921	GAA	2	6	17154	17159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611087
164	NC_000921	CTT	2	6	17228	17233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611087
165	NC_000921	ATT	2	6	17375	17380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611087
166	NC_000921	TAT	2	6	17476	17481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611087
167	NC_000921	ACA	2	6	17576	17581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611087
168	NC_000921	CGG	2	6	17630	17635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611087
169	NC_000921	GTT	2	6	17652	17657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611087
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171	NC_000921	GGT	2	6	17982	17987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611087
172	NC_000921	TAT	2	6	18079	18084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611087
173	NC_000921	TTG	2	6	18092	18097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611087
174	NC_000921	ATA	2	6	18359	18364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611087
175	NC_000921	TTG	2	6	18587	18592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611088
176	NC_000921	GTG	2	6	18653	18658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611088
177	NC_000921	TAT	2	6	18770	18775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611088
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190	NC_000921	CAT	2	6	20158	20163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611089
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220	NC_000921	GGT	2	6	23255	23260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
221	NC_000921	TGG	2	6	23394	23399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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245	NC_000921	GTT	2	6	25833	25838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
246	NC_000921	TAA	2	6	25913	25918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
247	NC_000921	GTT	2	6	25940	25945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
248	NC_000921	TGT	2	6	26027	26032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
249	NC_000921	TGT	2	6	26039	26044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
250	NC_000921	ATT	2	6	26157	26162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_000921	ATC	2	6	26277	26282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_000921	TTA	2	6	26289	26294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_000921	GGT	2	6	28220	28225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611094
265	NC_000921	AAG	2	6	28319	28324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611094
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267	NC_000921	AAG	2	6	28430	28435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611094
268	NC_000921	CAT	2	6	28518	28523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611094
269	NC_000921	ATC	2	6	28645	28650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611094
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273	NC_000921	TAT	2	6	28887	28892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611094
274	NC_000921	ATG	2	6	28906	28911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611094
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278	NC_000921	CTA	2	6	29600	29605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611095
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389	NC_000921	TAA	2	6	40747	40752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_000921	AAT	2	6	52421	52426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611117
500	NC_000921	ATG	2	6	52466	52471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611117

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