MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae Rd KW20 chromosome

Total Repeats: 38666

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_000907	GCT	2	6	259654	259659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16272192
5502	NC_000907	AGA	3	9	259689	259697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272192
5503	NC_000907	GGT	2	6	259993	259998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16272192
5504	NC_000907	CAA	2	6	260000	260005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16272192
5505	NC_000907	GAA	2	6	260020	260025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272192
5506	NC_000907	TGA	2	6	260046	260051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272192
5507	NC_000907	GAA	2	6	260116	260121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272192
5508	NC_000907	TCG	2	6	260192	260197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16272192
5509	NC_000907	AAG	2	6	260213	260218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272192
5510	NC_000907	AAG	2	6	260288	260293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272192
5511	NC_000907	GTT	2	6	260305	260310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16272192
5512	NC_000907	ATCG	2	8	260314	260321	25 %	25 %	25 %	25 %	16272192
5513	NC_000907	AAG	2	6	260384	260389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272192
5514	NC_000907	GAA	2	6	260398	260403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272192
5515	NC_000907	AAT	2	6	260408	260413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272192
5516	NC_000907	TGT	2	6	260459	260464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_000907	AAAG	2	8	260483	260490	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_000907	TATT	2	8	260530	260537	25 %	75 %	0 %	0 %	16272193
5519	NC_000907	GCTG	2	8	260563	260570	0 %	25 %	50 %	25 %	16272193
5520	NC_000907	AAG	2	6	260648	260653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272193
5521	NC_000907	TGA	2	6	260654	260659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272193
5522	NC_000907	TAC	2	6	260678	260683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272193
5523	NC_000907	GAA	2	6	260704	260709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272193
5524	NC_000907	TTTA	2	8	260840	260847	25 %	75 %	0 %	0 %	16272193
5525	NC_000907	GAA	2	6	260854	260859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272193
5526	NC_000907	ACG	2	6	260864	260869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16272193
5527	NC_000907	TAT	2	6	260950	260955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272193
5528	NC_000907	A	6	6	261010	261015	100 %	0 %	0 %	0 %	16272193
5529	NC_000907	GAAC	2	8	261045	261052	50 %	0 %	25 %	25 %	16272193
5530	NC_000907	AAG	2	6	261068	261073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272193
5531	NC_000907	CAAA	2	8	261076	261083	75 %	0 %	0 %	25 %	16272193
5532	NC_000907	TTG	2	6	261086	261091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16272193
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5535	NC_000907	CAA	2	6	261208	261213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16272193
5536	NC_000907	CAAAA	2	10	261251	261260	80 %	0 %	0 %	20 %	16272193
5537	NC_000907	TAG	2	6	261275	261280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272193
5538	NC_000907	AGC	3	9	261285	261293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16272193
5539	NC_000907	TTTA	2	8	261294	261301	25 %	75 %	0 %	0 %	16272193
5540	NC_000907	TTG	2	6	261332	261337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16272193
5541	NC_000907	AGA	2	6	261387	261392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272193
5542	NC_000907	AGA	2	6	261399	261404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272193
5543	NC_000907	AATC	2	8	261440	261447	50 %	25 %	0 %	25 %	16272193
5544	NC_000907	ATTC	2	8	261486	261493	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5545	NC_000907	TAA	2	6	261507	261512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_000907	TTAT	2	8	261537	261544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_000907	TGAC	2	8	261560	261567	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5548	NC_000907	CAA	2	6	261652	261657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16272194
5549	NC_000907	ATG	2	6	261686	261691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272194
5550	NC_000907	TGCG	2	8	261831	261838	0 %	25 %	50 %	25 %	16272194
5551	NC_000907	TGG	2	6	261885	261890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16272194
5552	NC_000907	TCG	2	6	261975	261980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16272194
5553	NC_000907	TGA	2	6	262056	262061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272194
5554	NC_000907	ATC	2	6	262094	262099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272194
5555	NC_000907	CAA	2	6	262118	262123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16272194
5556	NC_000907	CGT	2	6	262138	262143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16272194
5557	NC_000907	ATGA	2	8	262159	262166	50 %	25 %	25 %	0 %	16272194
5558	NC_000907	AAG	2	6	262172	262177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272194
5559	NC_000907	GTT	2	6	262223	262228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16272194
5560	NC_000907	GCGT	2	8	262241	262248	0 %	25 %	50 %	25 %	16272194
5561	NC_000907	CTT	2	6	262261	262266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16272194
5562	NC_000907	ACT	2	6	262344	262349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272194
5563	NC_000907	A	7	7	262352	262358	100 %	0 %	0 %	0 %	16272194
5564	NC_000907	ACA	2	6	262395	262400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16272194
5565	NC_000907	TTG	2	6	262448	262453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16272194
5566	NC_000907	TATTGA	2	12	262479	262490	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16272194
5567	NC_000907	TAT	2	6	262592	262597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272194
5568	NC_000907	TTG	2	6	262598	262603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16272194
5569	NC_000907	CGT	2	6	262615	262620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16272194
5570	NC_000907	A	6	6	262648	262653	100 %	0 %	0 %	0 %	16272194
5571	NC_000907	ATC	2	6	262679	262684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272194
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5573	NC_000907	A	6	6	262708	262713	100 %	0 %	0 %	0 %	16272194
5574	NC_000907	AAC	2	6	262733	262738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16272194
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5581	NC_000907	CGT	3	9	262888	262896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16272194
5582	NC_000907	CGT	2	6	262945	262950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16272194
5583	NC_000907	TATCG	2	10	262993	263002	20 %	40 %	20 %	20 %	16272194
5584	NC_000907	GTCG	2	8	263005	263012	0 %	25 %	50 %	25 %	16272194
5585	NC_000907	ATG	2	6	263102	263107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272194
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5588	NC_000907	CAAATG	2	12	263188	263199	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16272194
5589	NC_000907	TCTT	2	8	263200	263207	0 %	75 %	0 %	25 %	16272194
5590	NC_000907	GAT	2	6	263242	263247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272194
5591	NC_000907	GTG	2	6	263270	263275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16272194
5592	NC_000907	A	6	6	263342	263347	100 %	0 %	0 %	0 %	16272194
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5594	NC_000907	AAAT	2	8	263401	263408	75 %	25 %	0 %	0 %	16272194
5595	NC_000907	TACA	2	8	263421	263428	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5596	NC_000907	T	6	6	263497	263502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_000907	T	7	7	263528	263534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_000907	TAT	2	6	263538	263543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_000907	TTA	2	6	263557	263562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_000907	GAA	2	6	263611	263616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272195
5601	NC_000907	AATA	2	8	263664	263671	75 %	25 %	0 %	0 %	16272195
5602	NC_000907	TTATT	2	10	263682	263691	20 %	80 %	0 %	0 %	16272195
5603	NC_000907	TGA	2	6	263799	263804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272195
5604	NC_000907	GCC	2	6	263833	263838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16272195
5605	NC_000907	A	6	6	263922	263927	100 %	0 %	0 %	0 %	16272195
5606	NC_000907	AAAG	2	8	263958	263965	75 %	0 %	25 %	0 %	16272195
5607	NC_000907	AAT	2	6	263980	263985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272195
5608	NC_000907	AGA	2	6	263994	263999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272195
5609	NC_000907	AATT	2	8	264032	264039	50 %	50 %	0 %	0 %	16272195
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5611	NC_000907	TAC	2	6	264077	264082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272195
5612	NC_000907	TGC	2	6	264132	264137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16272195
5613	NC_000907	CAA	2	6	264142	264147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16272195
5614	NC_000907	TGA	2	6	264183	264188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272195
5615	NC_000907	AAT	2	6	264259	264264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272195
5616	NC_000907	GAA	2	6	264268	264273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272195
5617	NC_000907	ACT	2	6	264426	264431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272195
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5621	NC_000907	GGA	2	6	264715	264720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16272195
5622	NC_000907	A	8	8	264745	264752	100 %	0 %	0 %	0 %	16272195
5623	NC_000907	TTA	2	6	264760	264765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272195
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