MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.03

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019759	AGC	2	6	1282	1287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019759	CTAG	2	8	1406	1413	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019759	GAA	2	6	1469	1474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019759	CCA	2	6	1499	1504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_019759	TCT	2	6	1508	1513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019759	ATT	2	6	1544	1549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019759	AGA	2	6	5187	5192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019759	GTT	2	6	5776	5781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019759	AATT	2	8	5816	5823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019759	TTAG	2	8	6403	6410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019759	ATT	2	6	6462	6467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019759	TAG	2	6	6509	6514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019759	AGA	2	6	6536	6541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019759	TTTC	2	8	8933	8940	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019759	GTTGC	2	10	8987	8996	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019759	GCT	2	6	9017	9022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019759	TAA	2	6	9067	9072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019759	AGA	2	6	9128	9133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019759	TTA	2	6	9138	9143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019759	ATC	2	6	16008	16013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019759	GATT	2	8	16030	16037	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019759	AGT	2	6	16038	16043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019759	CTA	2	6	16180	16185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019759	TTG	2	6	18724	18729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019759	GTTT	2	8	18797	18804	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019759	AGCC	2	8	18832	18839	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019759	CAT	2	6	18847	18852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019759	GCA	2	6	18863	18868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019759	AGT	2	6	18970	18975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019759	GTC	2	6	18990	18995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019759	CTT	2	6	20902	20907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019759	CAG	2	6	20911	20916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019759	TAC	2	6	20920	20925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019759	GAGT	2	8	21054	21061	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019759	TTAC	2	8	21076	21083	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019759	GAA	2	6	21200	21205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019759	TTG	2	6	24918	24923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019759	T	6	6	25057	25062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019759	GCG	2	6	26371	26376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019759	CTA	2	6	26418	26423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019759	TTC	2	6	26547	26552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019759	T	6	6	26625	26630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019759	TAA	2	6	26919	26924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019759	CTTG	2	8	27032	27039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019759	AAT	2	6	27055	27060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019759	ACA	2	6	27073	27078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019759	CAG	2	6	27089	27094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019759	TA	4	8	27810	27817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019759	T	6	6	27847	27852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019759	TTTTG	2	10	27875	27884	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019759	CAC	2	6	27951	27956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_019759	TAT	2	6	28043	28048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019759	GCA	2	6	28066	28071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019759	AATCA	2	10	28079	28088	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_019759	ATAA	2	8	28120	28127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019759	GCA	2	6	28160	28165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019759	TTCGA	2	10	28182	28191	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_019759	GAA	2	6	28208	28213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019759	AGG	2	6	28293	28298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019759	AGT	2	6	29307	29312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019759	TAG	2	6	29314	29319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019759	TAG	2	6	29345	29350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019759	TTG	2	6	30710	30715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019759	TTAC	2	8	30724	30731	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019759	GAT	2	6	30738	30743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019759	CTA	2	6	30751	30756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.