MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.04

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019747	CTG	2	6	132	137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019747	AAC	2	6	310	315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019747	AAT	2	6	343	348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019747	CAA	2	6	385	390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019747	TCA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019747	CAA	2	6	418	423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019747	CTC	2	6	430	435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_019747	GTT	2	6	4195	4200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019747	GCA	2	6	4969	4974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019747	TTC	2	6	5488	5493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019747	GCA	2	6	5695	5700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019747	AGT	2	6	5804	5809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019747	AGA	2	6	5838	5843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019747	GTA	2	6	5926	5931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019747	AGC	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019747	ATT	2	6	5977	5982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019747	CTT	2	6	6005	6010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019747	ATG	2	6	6446	6451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019747	GTA	2	6	6484	6489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019747	CTC	2	6	6522	6527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_019747	TTA	2	6	6562	6567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019747	GTT	2	6	6582	6587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019747	AGC	2	6	7788	7793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019747	GAT	2	6	7896	7901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019747	CGA	2	6	7926	7931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019747	CTG	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019747	GCC	2	6	8718	8723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_019747	GCA	2	6	8759	8764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019747	GCG	2	6	8795	8800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019747	GCA	2	6	8816	8821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019747	TCT	2	6	8880	8885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019747	TAT	2	6	9235	9240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019747	TCA	2	6	9359	9364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019747	GCT	2	6	9984	9989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019747	CAA	2	6	10000	10005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019747	CAA	2	6	10067	10072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019747	TGT	2	6	10794	10799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019747	CAC	2	6	10818	10823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_019747	TAT	2	6	11524	11529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019747	CTA	2	6	11533	11538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019747	TAG	2	6	11540	11545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019747	AGA	2	6	11758	11763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019747	ACA	2	6	11770	11775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019747	GCA	2	6	11892	11897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019747	GAG	2	6	12383	12388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019747	AAG	2	6	12396	12401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019747	TGA	2	6	12424	12429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019747	GAA	2	6	12459	12464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019747	CTG	2	6	12542	12547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.