MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Geitlerinema sp. PCC 7407 chromosome

Total Repeats: 1984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019703	ATTT	2	8	1652	1659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019703	CGAT	2	8	2052	2059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019703	AAGC	2	8	2134	2141	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019703	AAGC	2	8	2176	2183	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019703	GTTT	2	8	2512	2519	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019703	TTCA	2	8	7045	7052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019703	TTGA	2	8	9502	9509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019703	CAAT	2	8	13187	13194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019703	ATCA	2	8	13465	13472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019703	AAAG	2	8	13597	13604	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019703	TCCT	2	8	13613	13620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019703	TTTG	2	8	14131	14138	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019703	AGCA	2	8	14449	14456	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019703	GACT	2	8	22350	22357	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019703	CCAC	2	8	22930	22937	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_019703	TGCT	2	8	24374	24381	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019703	ACCT	2	8	27303	27310	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019703	CAAA	2	8	32204	32211	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019703	CTGT	2	8	32379	32386	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019703	GCCC	2	8	34696	34703	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_019703	AAAT	2	8	43080	43087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019703	ATGA	2	8	43125	43132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019703	GCTT	2	8	46409	46416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019703	GAAT	2	8	48478	48485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019703	AGGG	2	8	49149	49156	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019703	TGGC	2	8	50449	50456	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019703	TTTG	2	8	51860	51867	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019703	GTGA	2	8	51903	51910	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019703	TCAG	2	8	57547	57554	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019703	TCAG	2	8	57661	57668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019703	TCCC	2	8	59534	59541	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_019703	TCGC	3	12	61422	61433	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019703	GTGA	2	8	67924	67931	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019703	TTTA	3	12	69382	69393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019703	TTGA	2	8	73283	73290	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019703	TGGG	2	8	73898	73905	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019703	ATTA	2	8	77415	77422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019703	TCTA	2	8	77742	77749	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019703	CGAT	2	8	81393	81400	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019703	TCTA	2	8	83651	83658	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019703	GCCC	2	8	86272	86279	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_019703	AGCC	2	8	86581	86588	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019703	GATT	2	8	89747	89754	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019703	AGAA	2	8	94357	94364	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019703	AGAA	2	8	94444	94451	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019703	GGTG	2	8	95997	96004	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019703	AAAG	2	8	103235	103242	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019703	CAAC	2	8	107954	107961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019703	TAGC	2	8	113797	113804	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019703	GATT	2	8	123300	123307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019703	GAAT	2	8	123376	123383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019703	TAAA	2	8	124355	124362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019703	CAGC	2	8	124537	124544	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019703	TGTT	2	8	131129	131136	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019703	CTGT	2	8	138978	138985	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019703	AACG	2	8	139886	139893	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019703	TAAA	2	8	140054	140061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019703	AAAT	2	8	140269	140276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019703	AAAG	2	8	140302	140309	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019703	TGGC	2	8	140439	140446	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019703	AACA	2	8	147811	147818	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019703	CCAG	2	8	148048	148055	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019703	AATC	2	8	150698	150705	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019703	GAAG	2	8	152055	152062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019703	CCCG	2	8	152191	152198	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_019703	TTGC	2	8	152572	152579	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019703	AGGG	2	8	152631	152638	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019703	CAAT	2	8	153306	153313	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019703	CGGG	2	8	157517	157524	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019703	GGGC	2	8	157535	157542	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019703	ATCA	2	8	161364	161371	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019703	TGCC	2	8	161375	161382	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019703	AGAC	2	8	165303	165310	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019703	GTGA	2	8	166030	166037	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019703	GGGC	2	8	166127	166134	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_019703	GCTG	2	8	171867	171874	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019703	GGCT	2	8	174417	174424	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019703	GAGG	2	8	174428	174435	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019703	GCTC	2	8	179787	179794	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019703	TTGA	2	8	179995	180002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019703	GAAG	2	8	180151	180158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019703	TTTG	2	8	183023	183030	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019703	AGCC	2	8	185570	185577	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019703	TTGG	2	8	185856	185863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019703	TAAT	2	8	187218	187225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019703	ATTA	2	8	187311	187318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019703	GAAG	2	8	187583	187590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019703	ATCA	2	8	193174	193181	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019703	GCAC	2	8	193195	193202	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019703	TGCT	2	8	193262	193269	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019703	GACA	2	8	193355	193362	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_019703	TGAA	2	8	197815	197822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019703	TTGA	2	8	198038	198045	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019703	ACCA	2	8	198283	198290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019703	CCCT	2	8	203005	203012	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
96	NC_019703	TAGA	2	8	205379	205386	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019703	TTGG	2	8	205445	205452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019703	CGAC	2	8	207193	207200	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019703	CGCC	2	8	211492	211499	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_019703	GGAA	2	8	218561	218568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019703	ATCC	2	8	221811	221818	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019703	GGTT	2	8	227165	227172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019703	ACTT	2	8	227797	227804	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019703	AATT	2	8	227845	227852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019703	ATTG	2	8	229423	229430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019703	TGGC	2	8	229663	229670	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019703	GCCT	2	8	232821	232828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019703	GAAA	2	8	235824	235831	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019703	CGAA	2	8	235941	235948	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019703	GAGG	2	8	236252	236259	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019703	ACGC	2	8	236716	236723	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019703	TCAG	2	8	237862	237869	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_019703	AAGC	2	8	238036	238043	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019703	AGAA	2	8	238152	238159	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019703	GCGA	2	8	238181	238188	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019703	TGCA	2	8	238212	238219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_019703	AGCT	2	8	238766	238773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_019703	ATCC	2	8	240959	240966	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_019703	CTTT	2	8	241089	241096	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019703	TTGA	2	8	241498	241505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019703	GCTG	2	8	241714	241721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_019703	CAAA	2	8	242821	242828	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019703	GCGA	2	8	245316	245323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_019703	GATA	2	8	245963	245970	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019703	TCTT	2	8	245987	245994	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_019703	GCCT	2	8	246267	246274	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019703	AAAT	2	8	252810	252817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019703	GAAA	2	8	255618	255625	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019703	CGAA	2	8	255735	255742	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_019703	GAGG	2	8	256047	256054	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019703	ACGC	2	8	256511	256518	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_019703	TCAG	2	8	257660	257667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_019703	AAGC	2	8	257834	257841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_019703	AGAA	2	8	257950	257957	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019703	GCGA	2	8	257979	257986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019703	TGCA	2	8	258010	258017	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_019703	AGCT	2	8	258564	258571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_019703	ATCC	2	8	260757	260764	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019703	TGAG	2	8	260951	260958	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019703	TGGT	2	8	262009	262016	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019703	AGTG	2	8	263559	263566	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019703	TCGC	2	8	266298	266305	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_019703	GGTG	2	8	266371	266378	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019703	GGCT	2	8	267303	267310	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_019703	CAGT	2	8	272179	272186	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_019703	TTCG	2	8	273623	273630	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_019703	ATTG	2	8	279839	279846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019703	AAAT	2	8	279931	279938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019703	CGGA	2	8	279961	279968	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_019703	CAGC	2	8	281731	281738	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_019703	GCCC	2	8	281945	281952	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
152	NC_019703	CTGC	2	8	287844	287851	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_019703	ATCG	2	8	287878	287885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_019703	CGCC	2	8	287953	287960	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
155	NC_019703	TCTG	2	8	288203	288210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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157	NC_019703	CTGA	2	8	294936	294943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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161	NC_019703	ACAG	2	8	318037	318044	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_019703	GCCA	2	8	320417	320424	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
163	NC_019703	CTGA	2	8	320466	320473	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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166	NC_019703	TGAG	2	8	326312	326319	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_019703	GACA	2	8	335713	335720	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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171	NC_019703	CTAG	2	8	337951	337958	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
172	NC_019703	CTTC	2	8	340045	340052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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175	NC_019703	GGCG	2	8	348458	348465	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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178	NC_019703	TCGA	2	8	355960	355967	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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180	NC_019703	GGGC	2	8	368172	368179	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
181	NC_019703	CCCA	2	8	368906	368913	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
182	NC_019703	GATA	2	8	370375	370382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_019703	CGCC	2	8	378175	378182	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
190	NC_019703	TTGG	2	8	378725	378732	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_019703	ATCA	2	8	585484	585491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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