MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Geitlerinema sp. PCC 7407 chromosome

Total Repeats: 13187

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019703	CA	4	8	1394243	1394250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4002	NC_019703	AATA	2	8	1394287	1394294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_019703	GCG	2	6	1394370	1394375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_019703	GCG	2	6	1394394	1394399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_019703	TGC	2	6	1394574	1394579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_019703	TA	3	6	1395612	1395617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_019703	TC	3	6	1395659	1395664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4008	NC_019703	TCCCT	2	10	1395673	1395682	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4009	NC_019703	TCT	2	6	1395722	1395727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_019703	TTG	3	9	1396572	1396580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_019703	GCC	2	6	1397465	1397470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_019703	CTAGG	2	10	1397477	1397486	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4013	NC_019703	ACT	2	6	1398700	1398705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_019703	GTT	2	6	1398707	1398712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_019703	ATG	2	6	1398770	1398775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_019703	GT	3	6	1398781	1398786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_019703	TGC	2	6	1399610	1399615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_019703	GCTTG	2	10	1399628	1399637	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4019	NC_019703	G	6	6	1399653	1399658	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_019703	CTG	2	6	1399668	1399673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_019703	CGC	2	6	1399681	1399686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_019703	GCG	2	6	1399716	1399721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_019703	CTG	2	6	1399723	1399728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_019703	AGC	2	6	1399750	1399755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_019703	A	6	6	1399772	1399777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_019703	AAT	2	6	1399783	1399788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_019703	TGG	2	6	1399811	1399816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_019703	CGG	2	6	1401106	1401111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_019703	TCC	2	6	1401139	1401144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4030	NC_019703	T	7	7	1402140	1402146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_019703	TG	3	6	1402786	1402791	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_019703	TTTAA	2	10	1402815	1402824	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_019703	T	6	6	1405556	1405561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_019703	GC	3	6	1405603	1405608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_019703	CGA	2	6	1405640	1405645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_019703	GC	3	6	1405649	1405654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_019703	C	6	6	1405664	1405669	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4038	NC_019703	GCC	2	6	1405684	1405689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_019703	CT	3	6	1406573	1406578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_019703	GA	3	6	1406708	1406713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_019703	TGG	2	6	1406782	1406787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_019703	GTG	2	6	1406932	1406937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_019703	AAATG	2	10	1409243	1409252	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_019703	TTGGT	2	10	1409294	1409303	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_019703	A	6	6	1409311	1409316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_019703	T	6	6	1409735	1409740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_019703	AC	3	6	1409776	1409781	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4048	NC_019703	GCT	2	6	1409800	1409805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_019703	T	7	7	1409816	1409822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_019703	TGA	2	6	1409830	1409835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_019703	A	6	6	1409859	1409864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_019703	CCAG	2	8	1410205	1410212	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4053	NC_019703	GACA	2	8	1410218	1410225	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_019703	TTCC	2	8	1410248	1410255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_019703	ATTC	2	8	1410361	1410368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4056	NC_019703	TGG	2	6	1412843	1412848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_019703	CGG	2	6	1412860	1412865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_019703	TGC	2	6	1412971	1412976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_019703	TGCC	2	8	1412988	1412995	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_019703	CAAGC	2	10	1419550	1419559	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4061	NC_019703	GC	3	6	1419558	1419563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4062	NC_019703	GCG	2	6	1419583	1419588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_019703	TC	3	6	1421157	1421162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_019703	CGG	2	6	1421186	1421191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_019703	TGA	2	6	1421256	1421261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_019703	AGCC	2	8	1421497	1421504	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4067	NC_019703	GCA	2	6	1421523	1421528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_019703	TGA	2	6	1421601	1421606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_019703	CAG	2	6	1422667	1422672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_019703	A	6	6	1422923	1422928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_019703	T	6	6	1422957	1422962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_019703	CGAA	2	8	1422976	1422983	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4073	NC_019703	AC	3	6	1423059	1423064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_019703	CTCC	2	8	1424488	1424495	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4075	NC_019703	ATC	2	6	1424586	1424591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4077	NC_019703	AAG	2	6	1425714	1425719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_019703	CAA	2	6	1425765	1425770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_019703	A	6	6	1425769	1425774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_019703	CAAA	3	12	1425776	1425787	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4081	NC_019703	GA	3	6	1425791	1425796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_019703	TC	3	6	1425808	1425813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4083	NC_019703	GGCA	2	8	1425846	1425853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4084	NC_019703	TGAGC	2	10	1425877	1425886	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4085	NC_019703	TC	4	8	1426261	1426268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_019703	TTC	2	6	1426292	1426297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_019703	AGA	2	6	1426328	1426333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_019703	GGCT	2	8	1426362	1426369	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4089	NC_019703	ATC	2	6	1426660	1426665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_019703	TGA	2	6	1426737	1426742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_019703	GAAGA	2	10	1426892	1426901	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_019703	GAC	2	6	1426944	1426949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_019703	AAG	2	6	1426994	1426999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_019703	A	6	6	1427064	1427069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_019703	A	6	6	1427097	1427102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_019703	AG	3	6	1427170	1427175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_019703	A	6	6	1427219	1427224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_019703	GCC	2	6	1427246	1427251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4099	NC_019703	TGC	2	6	1427351	1427356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_019703	GAA	2	6	1431202	1431207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_019703	AG	3	6	1431261	1431266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_019703	CAGGA	2	10	1431408	1431417	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4103	NC_019703	CT	4	8	1431499	1431506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_019703	G	6	6	1431573	1431578	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_019703	GGTA	2	8	1431583	1431590	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_019703	GAA	2	6	1431600	1431605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_019703	A	6	6	1431680	1431685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_019703	TGC	2	6	1431715	1431720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_019703	G	6	6	1431754	1431759	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_019703	CGC	2	6	1431768	1431773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_019703	TCC	2	6	1431843	1431848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_019703	GTT	2	6	1432103	1432108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_019703	GCG	2	6	1432126	1432131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_019703	TCC	2	6	1432196	1432201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_019703	CCCTT	2	10	1432202	1432211	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4116	NC_019703	CGT	2	6	1432240	1432245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_019703	GCCAA	2	10	1432269	1432278	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4118	NC_019703	GAT	2	6	1432280	1432285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_019703	CTG	2	6	1432298	1432303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_019703	CTC	2	6	1432343	1432348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_019703	CGA	2	6	1432382	1432387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_019703	ACG	2	6	1432510	1432515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_019703	TG	3	6	1432706	1432711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_019703	CGG	2	6	1434360	1434365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_019703	TGT	2	6	1434461	1434466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_019703	G	6	6	1436800	1436805	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_019703	GGT	2	6	1436859	1436864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_019703	TGC	2	6	1436882	1436887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_019703	GTT	2	6	1436892	1436897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_019703	T	6	6	1441191	1441196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_019703	GGC	2	6	1441197	1441202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_019703	GTC	2	6	1441258	1441263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_019703	CTA	2	6	1443070	1443075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_019703	T	7	7	1443223	1443229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_019703	TTGG	2	8	1443231	1443238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_019703	TGC	2	6	1443256	1443261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4137	NC_019703	TGT	2	6	1443265	1443270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_019703	CAT	3	9	1443349	1443357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4141	NC_019703	CGC	3	9	1443513	1443521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4142	NC_019703	GCT	2	6	1443573	1443578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4230	NC_019703	AAG	2	6	1469052	1469057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4249	NC_019703	TTAG	2	8	1473906	1473913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_019703	AGG	2	6	1473934	1473939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4255	NC_019703	TCC	2	6	1476802	1476807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4258	NC_019703	CCTG	2	8	1477033	1477040	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4259	NC_019703	GGA	2	6	1478036	1478041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_019703	GCT	2	6	1478086	1478091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4263	NC_019703	CGC	2	6	1478180	1478185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4264	NC_019703	CT	3	6	1478193	1478198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4265	NC_019703	AC	3	6	1480538	1480543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4266	NC_019703	AG	3	6	1480565	1480570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4271	NC_019703	CAGA	2	8	1481232	1481239	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4376	NC_019703	TATC	2	8	1526595	1526602	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4383	NC_019703	CTAT	2	8	1526765	1526772	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4384	NC_019703	GA	3	6	1526798	1526803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4387	NC_019703	TCGAA	2	10	1527463	1527472	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4388	NC_019703	TAAA	3	12	1527566	1527577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4389	NC_019703	AATG	2	8	1527581	1527588	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4390	NC_019703	TGA	2	6	1527602	1527607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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