MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Gordonia sp. KTR9 plasmid pGKT3

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018583	GGCGC	2	10	1958	1967	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_018583	CGGGT	2	10	2019	2028	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018583	GGCCG	2	10	23517	23526	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_018583	CGACC	2	10	33733	33742	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_018583	CACCT	2	10	50827	50836	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_018583	CCGGC	2	10	55820	55829	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_018583	GGAGG	2	10	64578	64587	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018583	CCCTC	2	10	64614	64623	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
9	NC_018583	TTGGG	2	10	68064	68073	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018583	CGAGG	2	10	69430	69439	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018583	CGTCA	2	10	71069	71078	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_018583	GTCCC	2	10	71813	71822	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_018583	CCTTG	2	10	82927	82936	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018583	TCGAT	2	10	86703	86712	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018583	ACCCA	2	10	110669	110678	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_018583	GGAGG	2	10	132552	132561	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018583	GCAGC	2	10	140578	140587	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_018583	GGAAG	2	10	141211	141220	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018583	GAAGG	2	10	143291	143300	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018583	CCGCA	2	10	149225	149234	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_018583	CCCGG	2	10	159931	159940	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_018583	GCTTT	2	10	163293	163302	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018583	ACCCC	2	10	164230	164239	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
24	NC_018583	AACCG	2	10	165696	165705	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_018583	ACCCC	2	10	165956	165965	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
26	NC_018583	CCAGC	2	10	167229	167238	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.