MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Gordonia sp. KTR9 plasmid pGKT2

Total Repeats: 374

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018580	CCT	2	6	4511	4516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_018580	CGG	2	6	4568	4573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018580	TGC	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018580	CGC	2	6	4753	4758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_018580	CAG	2	6	4799	4804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018580	AGT	2	6	4987	4992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018580	GCA	2	6	5509	5514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018580	AGT	2	6	7565	7570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018580	AGG	2	6	7585	7590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018580	GAT	2	6	8134	8139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018580	CCA	2	6	8823	8828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_018580	GGT	2	6	8837	8842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018580	CGG	2	6	8923	8928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018580	GGC	2	6	8991	8996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018580	GGC	2	6	9004	9009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018580	GGC	2	6	9058	9063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018580	TCG	2	6	9104	9109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018580	CTT	3	9	9169	9177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018580	ACG	2	6	9179	9184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018580	GCT	2	6	9203	9208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018580	AGC	2	6	9305	9310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018580	CCG	2	6	9322	9327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_018580	GGT	2	6	9341	9346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018580	GAT	2	6	9354	9359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018580	CGT	2	6	9377	9382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018580	GCG	2	6	9395	9400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018580	CTG	2	6	9414	9419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018580	CCG	2	6	9475	9480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_018580	GGT	2	6	9527	9532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018580	GGT	2	6	9549	9554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018580	AGC	2	6	9562	9567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018580	TGG	2	6	9581	9586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018580	CGA	2	6	9635	9640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018580	GGT	2	6	9665	9670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018580	TCC	2	6	9937	9942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_018580	GGC	2	6	9953	9958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018580	TCT	2	6	9968	9973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018580	CGG	2	6	9991	9996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018580	GAA	2	6	10035	10040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018580	CCA	2	6	10050	10055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018580	GCT	2	6	10629	10634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018580	ACG	2	6	10674	10679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018580	CGA	2	6	10681	10686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018580	CGA	2	6	10718	10723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018580	GAT	2	6	11914	11919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018580	TGG	2	6	12002	12007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018580	ACG	3	9	12573	12581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018580	ACG	2	6	12636	12641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018580	TTG	2	6	12650	12655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018580	ACC	2	6	12699	12704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018580	GCG	2	6	12764	12769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018580	TGG	2	6	12786	12791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018580	CTG	2	6	12874	12879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018580	GAG	2	6	15188	15193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018580	CGA	2	6	15307	15312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018580	GCC	2	6	15532	15537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_018580	ACG	2	6	15620	15625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018580	CGG	2	6	16010	16015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018580	GTG	2	6	16530	16535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018580	GCG	2	6	16580	16585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018580	ACG	2	6	16699	16704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018580	GTA	2	6	16722	16727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018580	AGG	2	6	16747	16752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018580	GCT	2	6	16814	16819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018580	AGT	2	6	16855	16860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018580	GCT	2	6	16909	16914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018580	GGA	2	6	16941	16946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018580	GCC	2	6	16985	16990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_018580	CAT	2	6	17453	17458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018580	GAG	2	6	17487	17492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018580	GTC	2	6	17556	17561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018580	GTC	2	6	17601	17606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018580	GGC	2	6	17654	17659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018580	GTA	2	6	17754	17759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018580	CAG	2	6	17772	17777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018580	TCC	2	6	17780	17785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_018580	GCA	2	6	18042	18047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018580	AGA	2	6	18082	18087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018580	GCC	2	6	18112	18117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_018580	CCG	2	6	18130	18135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_018580	GGC	2	6	18143	18148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018580	AGC	2	6	18210	18215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018580	ACC	2	6	18228	18233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_018580	CCT	2	6	18286	18291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_018580	GCT	2	6	18339	18344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018580	CGT	2	6	18358	18363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018580	CAC	2	6	18378	18383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_018580	CGA	2	6	18399	18404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018580	GTG	2	6	18440	18445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018580	TGG	2	6	20392	20397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018580	ATG	2	6	20403	20408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018580	TTC	2	6	20418	20423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018580	GGT	3	9	20434	20442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018580	GCC	2	6	20461	20466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_018580	ATC	2	6	20563	20568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018580	TCG	2	6	20581	20586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018580	CCG	2	6	20617	20622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_018580	TCT	2	6	20705	20710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018580	GAG	2	6	20742	20747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018580	ATC	2	6	20767	20772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018580	GCG	2	6	20773	20778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018580	GCA	2	6	21652	21657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018580	CGA	2	6	21723	21728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018580	ACA	2	6	21785	21790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018580	GTG	2	6	21907	21912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018580	GGA	2	6	21914	21919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018580	CCG	2	6	22432	22437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_018580	TCC	2	6	22465	22470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_018580	TGT	2	6	22497	22502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018580	GTT	2	6	22511	22516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018580	CTG	2	6	22579	22584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018580	ATC	2	6	22613	22618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018580	GAT	2	6	23980	23985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018580	TTC	2	6	25179	25184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018580	AGT	2	6	25209	25214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018580	TCC	2	6	25254	25259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_018580	TCG	2	6	25287	25292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018580	GTT	2	6	25896	25901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018580	GCG	2	6	26426	26431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018580	CGG	2	6	26443	26448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018580	CCT	2	6	26989	26994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_018580	AGA	2	6	27114	27119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018580	AGC	2	6	28032	28037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018580	GGT	2	6	28085	28090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018580	GCA	2	6	28126	28131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018580	CGC	2	6	29257	29262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_018580	GAA	2	6	29303	29308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018580	GAG	2	6	29402	29407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018580	GTT	2	6	29939	29944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018580	CGA	2	6	30308	30313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018580	CGG	3	9	30649	30657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018580	GCT	2	6	30662	30667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018580	TGG	2	6	30711	30716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018580	CAA	2	6	30846	30851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018580	CGC	2	6	30879	30884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_018580	CTC	2	6	31029	31034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_018580	AAG	2	6	31097	31102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018580	GCG	2	6	31151	31156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018580	TGG	2	6	31299	31304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018580	CCG	2	6	31317	31322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.