MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 5994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017456	TCC	2	6	1135391	1135396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_017456	TGT	2	6	1135403	1135408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017456	TAA	2	6	1135433	1135438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017456	GCA	2	6	1135446	1135451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_017456	TAC	2	6	1136733	1136738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_017456	T	6	6	1140550	1140555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017456	ATT	2	6	1140596	1140601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017456	TAT	2	6	1143397	1143402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017456	TAA	2	6	1143547	1143552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017456	TAC	2	6	1143573	1143578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_017456	CCT	2	6	1144266	1144271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_017456	GCC	2	6	1144351	1144356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_017456	GA	3	6	1144521	1144526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017456	CGG	2	6	1144578	1144583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_017456	ACC	2	6	1144592	1144597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_017456	GCT	2	6	1144668	1144673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_017456	GATG	2	8	1144725	1144732	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017456	AATA	2	8	1148398	1148405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017456	TTG	2	6	1148412	1148417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017456	A	6	6	1148449	1148454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017456	ATT	2	6	1148468	1148473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017456	AC	3	6	1149269	1149274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4023	NC_017456	AT	3	6	1149287	1149292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017456	ATA	2	6	1150453	1150458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017456	A	6	6	1152114	1152119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017456	TTA	2	6	1153450	1153455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017456	TTC	2	6	1155019	1155024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_017456	AT	3	6	1156274	1156279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017456	AATA	2	8	1156282	1156289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017456	AT	3	6	1156294	1156299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017456	TAT	2	6	1156304	1156309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017456	ATA	2	6	1156371	1156376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017456	A	7	7	1156380	1156386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017456	AAT	2	6	1156399	1156404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017456	ATTG	2	8	1156414	1156421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017456	GCA	2	6	1156462	1156467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_017456	TAT	2	6	1156470	1156475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017456	CATC	2	8	1156484	1156491	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4039	NC_017456	TA	3	6	1156533	1156538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017456	AT	3	6	1157222	1157227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017456	AT	3	6	1157234	1157239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017456	TATTT	2	10	1157264	1157273	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017456	A	6	6	1157277	1157282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017456	AAC	2	6	1157291	1157296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017456	ATA	2	6	1157300	1157305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017456	A	6	6	1157330	1157335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017456	A	6	6	1161104	1161109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017456	ACA	2	6	1162112	1162117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_017456	ACT	2	6	1162140	1162145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_017456	ATTA	2	8	1163276	1163283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017456	TAT	2	6	1163299	1163304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017456	TAA	2	6	1164307	1164312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017456	AGA	2	6	1164343	1164348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017456	ACAT	2	8	1164376	1164383	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4055	NC_017456	AGT	2	6	1164397	1164402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017456	AGT	2	6	1164429	1164434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017456	GAC	2	6	1164468	1164473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_017456	TTG	2	6	1164482	1164487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017456	TTTTA	2	10	1164493	1164502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017456	ATT	2	6	1164578	1164583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017456	TGT	2	6	1164635	1164640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017456	ATT	2	6	1165501	1165506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017456	TGT	2	6	1165513	1165518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017456	TG	3	6	1165547	1165552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017456	AAC	2	6	1165562	1165567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_017456	A	6	6	1165615	1165620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017456	TCT	2	6	1165701	1165706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_017456	CTG	2	6	1165718	1165723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_017456	CAAG	2	8	1165822	1165829	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4070	NC_017456	TCT	2	6	1165830	1165835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_017456	CAC	2	6	1165848	1165853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4072	NC_017456	AGC	2	6	1165879	1165884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_017456	GCA	2	6	1165917	1165922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_017456	AAT	2	6	1166093	1166098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017456	TAAA	2	8	1166104	1166111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017456	ATTT	2	8	1166146	1166153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017456	TTCC	2	8	1167892	1167899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_017456	GCTTT	2	10	1167913	1167922	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4079	NC_017456	CTT	2	6	1169559	1169564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_017456	AT	3	6	1169565	1169570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017456	TTAT	2	8	1169574	1169581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017456	T	6	6	1169589	1169594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017456	TA	3	6	1169710	1169715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017456	ACATA	2	10	1169735	1169744	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4085	NC_017456	T	6	6	1169786	1169791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017456	CAA	2	6	1169792	1169797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_017456	ATG	2	6	1169856	1169861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017456	TAA	2	6	1172506	1172511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017456	A	6	6	1172510	1172515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017456	A	6	6	1172521	1172526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017456	A	6	6	1172529	1172534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017456	TTG	2	6	1172540	1172545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017456	TTC	2	6	1172577	1172582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_017456	GAA	2	6	1172616	1172621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017456	ATGCA	2	10	1172635	1172644	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4096	NC_017456	TAA	2	6	1174358	1174363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017456	TAA	2	6	1174392	1174397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017456	GGA	2	6	1174468	1174473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017456	AAC	2	6	1175723	1175728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_017456	ATAA	2	8	1175749	1175756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017456	A	7	7	1175766	1175772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017456	ATT	2	6	1175779	1175784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017456	ATT	2	6	1175799	1175804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017456	CTAT	2	8	1177216	1177223	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4105	NC_017456	A	6	6	1179809	1179814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017456	CAT	2	6	1179844	1179849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_017456	TTC	2	6	1180542	1180547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_017456	AAT	2	6	1180698	1180703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017456	T	6	6	1180744	1180749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017456	TA	3	6	1180799	1180804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017456	A	6	6	1180870	1180875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017456	GC	3	6	1180923	1180928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_017456	A	6	6	1182188	1182193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017456	TA	3	6	1182241	1182246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017456	AT	3	6	1184409	1184414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017456	TA	3	6	1184416	1184421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017456	AAT	2	6	1184474	1184479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017456	ATA	2	6	1184492	1184497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017456	A	9	9	1184497	1184505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017456	ATTG	2	8	1184576	1184583	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017456	TGA	2	6	1184611	1184616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017456	AAAT	2	8	1188302	1188309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017456	A	6	6	1190331	1190336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017456	TGT	2	6	1190354	1190359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017456	T	6	6	1190498	1190503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017456	ATCA	2	8	1190530	1190537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4127	NC_017456	AAT	2	6	1191447	1191452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017456	T	6	6	1194601	1194606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017456	ATT	2	6	1194612	1194617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017456	AAC	2	6	1194646	1194651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_017456	AAT	2	6	1194670	1194675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017456	CCA	2	6	1195532	1195537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4133	NC_017456	AC	3	6	1195538	1195543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4134	NC_017456	CAT	2	6	1195594	1195599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4136	NC_017456	CAA	2	6	1199481	1199486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4142	NC_017456	AT	3	6	1200202	1200207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_017456	ATTT	2	8	1200216	1200223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4249	NC_017456	A	6	6	1239402	1239407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_017456	CAA	2	6	1239421	1239426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4251	NC_017456	ATA	2	6	1239433	1239438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_017456	CG	3	6	1239474	1239479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4253	NC_017456	TAT	2	6	1240906	1240911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_017456	TTTA	2	8	1240927	1240934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_017456	TACT	2	8	1240953	1240960	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4256	NC_017456	TTA	2	6	1241700	1241705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_017456	GC	3	6	1248159	1248164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4258	NC_017456	AT	3	6	1248175	1248180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_017456	A	6	6	1248206	1248211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_017456	ATT	2	6	1248226	1248231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_017456	T	7	7	1248230	1248236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_017456	TAA	2	6	1248264	1248269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_017456	TAA	2	6	1248300	1248305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_017456	ATT	2	6	1248622	1248627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_017456	AAT	2	6	1248631	1248636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4303	NC_017456	A	6	6	1259545	1259550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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