MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 5994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017456	TGA	2	6	423649	423654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017456	AAG	2	6	423677	423682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017456	AAGCCA	2	12	423698	423709	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_017456	AAG	2	6	423779	423784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017456	GAA	3	9	423805	423813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017456	TTCT	2	8	423870	423877	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_017456	CTG	3	9	423909	423917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_017456	TTG	2	6	423978	423983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017456	GTT	2	6	424004	424009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017456	AAT	2	6	424037	424042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017456	GAA	2	6	424046	424051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017456	CCTAAG	2	12	424085	424096	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_017456	CTG	2	6	424116	424121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_017456	AAG	2	6	424130	424135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017456	ATT	2	6	424157	424162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017456	AGA	2	6	424191	424196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017456	AAG	2	6	424205	424210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017456	AGG	2	6	424233	424238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017456	AAT	2	6	424283	424288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017456	GAC	2	6	424298	424303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_017456	AAG	2	6	424307	424312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017456	AGAA	2	8	424317	424324	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017456	GAAAAG	2	12	424325	424336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017456	AAG	2	6	424364	424369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017456	AAG	2	6	424386	424391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017456	AAG	2	6	424409	424414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017456	TAC	2	6	424504	424509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_017456	GAA	2	6	424532	424537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017456	CAG	2	6	424541	424546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_017456	AAGCTC	2	12	424557	424568	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_017456	TGC	2	6	424573	424578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_017456	ACG	2	6	424638	424643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_017456	AAG	2	6	424682	424687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017456	AAT	2	6	424751	424756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017456	AGC	2	6	424765	424770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_017456	GCA	2	6	424840	424845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_017456	AGA	2	6	424881	424886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017456	CTG	2	6	424887	424892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_017456	AAG	2	6	424937	424942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017456	CTG	2	6	424980	424985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_017456	AAC	2	6	425054	425059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_017456	CAAG	2	8	425062	425069	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1543	NC_017456	AAAG	2	8	425101	425108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017456	AGA	2	6	425154	425159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017456	TGA	2	6	425167	425172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017456	CAA	2	6	425176	425181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_017456	A	6	6	425185	425190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017456	CG	3	6	425219	425224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_017456	AGA	2	6	425235	425240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017456	AGA	2	6	425256	425261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017456	TGA	2	6	425263	425268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017456	ATC	2	6	425312	425317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_017456	GAC	2	6	425372	425377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_017456	TGC	2	6	425398	425403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_017456	AGA	2	6	425499	425504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017456	TCT	2	6	425602	425607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_017456	ACA	2	6	425628	425633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_017456	TGC	2	6	425668	425673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_017456	AAAGA	2	10	425756	425765	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017456	GCT	2	6	425801	425806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_017456	AAG	2	6	425840	425845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017456	AAG	2	6	425874	425879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017456	TTA	2	6	425919	425924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017456	ACA	2	6	425985	425990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_017456	AAG	2	6	426032	426037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017456	AAG	2	6	426080	426085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017456	AGCA	2	8	426105	426112	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_017456	GAA	2	6	426187	426192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017456	GCT	2	6	426203	426208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_017456	CCGACC	3	18	426251	426268	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_017456	CTGGTT	2	12	426324	426335	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1572	NC_017456	GTG	2	6	426495	426500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017456	GCACTG	2	12	426528	426539	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_017456	ACA	2	6	426564	426569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_017456	TGC	2	6	426619	426624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1578	NC_017456	CGCAAG	2	12	426699	426710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_017456	GCT	3	9	426716	426724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_017456	TGC	2	6	426772	426777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_017456	GTGC	2	8	426782	426789	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1582	NC_017456	TGC	2	6	426844	426849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_017456	CTG	2	6	426867	426872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_017456	TGC	2	6	426892	426897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_017456	GGA	2	6	426902	426907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017456	TCG	2	6	426919	426924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_017456	GC	3	6	426928	426933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1588	NC_017456	GTC	2	6	426978	426983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_017456	CGA	2	6	426987	426992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_017456	GC	3	6	427016	427021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1591	NC_017456	GCTT	2	8	427043	427050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1592	NC_017456	CG	3	6	427094	427099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_017456	TGT	2	6	427130	427135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017456	GTG	2	6	427185	427190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017456	AGG	2	6	427223	427228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_017456	CCA	2	6	427290	427295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_017456	ACAA	2	8	427298	427305	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1598	NC_017456	AAC	2	6	427341	427346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_017456	CAA	3	9	427349	427357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_017456	CAA	2	6	427411	427416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_017456	T	6	6	427527	427532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017456	CTC	2	6	432044	432049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1603	NC_017456	TAG	2	6	432066	432071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017456	T	6	6	432135	432140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017456	G	10	10	432178	432187	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017456	CGA	2	6	432240	432245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_017456	AACA	2	8	432309	432316	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_017456	ATCA	2	8	432383	432390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_017456	A	6	6	433848	433853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017456	ATA	2	6	433873	433878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017456	TAT	2	6	433997	434002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017456	A	6	6	434010	434015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017456	AAT	2	6	434032	434037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017456	AACAA	2	10	434048	434057	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1615	NC_017456	GT	3	6	434084	434089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017456	AC	3	6	434248	434253	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_017456	AC	3	6	434260	434265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_017456	ACTTTA	2	12	434280	434291	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1619	NC_017456	AAGG	2	8	436385	436392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017456	TAA	2	6	439049	439054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017456	TTA	2	6	439086	439091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017456	T	6	6	440741	440746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017456	CGG	2	6	440778	440783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_017456	AAT	2	6	440854	440859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017456	GTT	2	6	440860	440865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017456	ATT	2	6	440887	440892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017456	TTA	2	6	440893	440898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017456	TGC	2	6	440905	440910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_017456	CAA	2	6	440928	440933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_017456	T	6	6	441945	441950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017456	CGG	2	6	442004	442009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1633	NC_017456	CA	3	6	442081	442086	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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