MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 5994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017456	TAT	2	6	112024	112029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017456	TAT	2	6	112064	112069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017456	AATC	2	8	112077	112084	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
504	NC_017456	GC	3	6	112117	112122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_017456	GTTTT	2	10	112134	112143	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017456	TTA	2	6	112158	112163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017456	ACA	2	6	112216	112221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017456	AAGC	2	8	112222	112229	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
509	NC_017456	AGA	2	6	112235	112240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017456	AGA	2	6	112249	112254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017456	TAAAC	2	10	112282	112291	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
512	NC_017456	CAG	2	6	112322	112327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017456	AG	3	6	112326	112331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017456	TAG	2	6	112402	112407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017456	AAC	2	6	112459	112464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017456	A	6	6	113759	113764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017456	AAGA	2	8	113766	113773	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017456	T	6	6	115622	115627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017456	CTTT	2	8	115628	115635	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
520	NC_017456	AT	3	6	115667	115672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017456	ACT	2	6	115742	115747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017456	TTG	2	6	115781	115786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017456	AT	3	6	115834	115839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017456	TGT	2	6	115854	115859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017456	TGC	2	6	115878	115883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017456	AT	3	6	115898	115903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017456	ACT	2	6	115905	115910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017456	TAG	2	6	115916	115921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017456	ATT	2	6	115992	115997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017456	GTTT	2	8	116011	116018	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017456	GTA	2	6	116025	116030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017456	TG	3	6	116211	116216	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017456	ACATG	2	10	116218	116227	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
534	NC_017456	A	6	6	116260	116265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017456	ACA	2	6	116289	116294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_017456	A	7	7	116301	116307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017456	GTTT	2	8	116314	116321	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017456	AAG	2	6	116397	116402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017456	AAT	2	6	120905	120910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017456	AAG	2	6	120919	120924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017456	GTA	2	6	121997	122002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017456	TTCC	2	8	122012	122019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_017456	T	7	7	122049	122055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017456	T	6	6	122107	122112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017456	TCTT	2	8	123668	123675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
546	NC_017456	ACA	2	6	123718	123723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_017456	A	6	6	123784	123789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017456	GAATT	2	10	123806	123815	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017456	AATA	2	8	123881	123888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017456	ATTT	2	8	123901	123908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017456	CG	3	6	123956	123961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_017456	CG	3	6	126148	126153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_017456	GC	3	6	126160	126165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_017456	CGC	2	6	126175	126180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_017456	TCG	2	6	126383	126388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_017456	GC	4	8	126406	126413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_017456	TAG	2	6	126430	126435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017456	TAAT	2	8	126863	126870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017456	AAT	2	6	126875	126880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017456	ACT	2	6	127772	127777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017456	ATGGTA	2	12	128389	128400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017456	AGCG	2	8	128454	128461	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
563	NC_017456	GTAA	2	8	128484	128491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017456	TTG	2	6	128535	128540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017456	TTG	2	6	129332	129337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017456	CAT	2	6	129355	129360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_017456	ATA	2	6	129402	129407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017456	GCG	2	6	129436	129441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_017456	TAG	2	6	129447	129452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017456	ATT	2	6	130834	130839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017456	TTTG	2	8	130988	130995	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017456	TCA	2	6	132115	132120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_017456	TTA	2	6	132127	132132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017456	ATC	2	6	132155	132160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_017456	AGC	2	6	132178	132183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_017456	ATA	3	9	132235	132243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017456	TGC	2	6	132252	132257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_017456	TTC	2	6	132280	132285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_017456	A	6	6	132321	132326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017456	GTA	2	6	132354	132359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017456	CGT	2	6	132399	132404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_017456	AGG	2	6	132410	132415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017456	ATG	3	9	134144	134152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017456	CCA	2	6	134173	134178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_017456	T	6	6	134198	134203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017456	AAT	2	6	134982	134987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017456	CAT	2	6	135003	135008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_017456	CAT	2	6	135030	135035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_017456	GGGA	2	8	135086	135093	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017456	TTTA	2	8	135146	135153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017456	CTTT	2	8	135168	135175	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
592	NC_017456	T	6	6	135173	135178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017456	CATCG	2	10	137498	137507	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
594	NC_017456	TGC	2	6	137698	137703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_017456	TTC	2	6	140363	140368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_017456	AAT	2	6	140569	140574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017456	AATATT	2	12	140681	140692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017456	GT	3	6	140710	140715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017456	GT	3	6	140800	140805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017456	A	6	6	140806	140811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017456	TTC	2	6	140865	140870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017456	AAGCT	2	10	142016	142025	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
603	NC_017456	TCA	2	6	142049	142054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_017456	AC	3	6	142065	142070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_017456	GTT	2	6	142113	142118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017456	TGA	2	6	142139	142144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017456	GGC	2	6	142165	142170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_017456	ACG	2	6	142233	142238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_017456	AAG	2	6	142289	142294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017456	T	6	6	142321	142326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017456	AAGG	2	8	142327	142334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017456	GA	3	6	142428	142433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017456	AAG	2	6	142454	142459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017456	ATG	2	6	142534	142539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017456	ATG	2	6	142615	142620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017456	ATA	2	6	142621	142626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017456	AGT	2	6	142629	142634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017456	GAC	2	6	142652	142657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017456	GTG	2	6	142743	142748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017456	CGA	2	6	142865	142870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_017456	CGAC	2	8	142952	142959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
622	NC_017456	T	6	6	142998	143003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017456	ATA	2	6	143062	143067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017456	TG	3	6	143082	143087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017456	TG	3	6	143092	143097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017456	AGC	2	6	143112	143117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017456	GC	3	6	143180	143185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
628	NC_017456	GTG	2	6	143285	143290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017456	TG	4	8	143289	143296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017456	TGG	2	6	143302	143307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017456	GT	3	6	143308	143313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017456	GCAC	2	8	143330	143337	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
633	NC_017456	GGC	2	6	143351	143356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_017456	GCA	2	6	143363	143368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_017456	TGC	2	6	143373	143378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_017456	AT	3	6	143428	143433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017456	AT	3	6	143443	143448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_017456	TGG	3	9	143495	143503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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