MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 5994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017456	CAC	2	6	1502498	1502503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5002	NC_017456	TCT	2	6	1502521	1502526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_017456	ACA	2	6	1502558	1502563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_017456	AAAC	2	8	1502632	1502639	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5005	NC_017456	TGT	2	6	1502755	1502760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017456	GC	3	6	1502774	1502779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_017456	CGC	2	6	1502789	1502794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_017456	T	6	6	1503822	1503827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017456	ATT	2	6	1503833	1503838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017456	CAAA	2	8	1503899	1503906	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5011	NC_017456	AAC	2	6	1503938	1503943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_017456	AAC	2	6	1503948	1503953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_017456	AAC	2	6	1504053	1504058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_017456	CTAA	2	8	1504104	1504111	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5015	NC_017456	CA	3	6	1505621	1505626	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_017456	AGC	2	6	1506671	1506676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_017456	AATC	2	8	1508158	1508165	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5018	NC_017456	AAT	2	6	1508169	1508174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017456	TTC	2	6	1509292	1509297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_017456	T	6	6	1509330	1509335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017456	ATT	2	6	1510507	1510512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017456	ATT	2	6	1510525	1510530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017456	ATT	2	6	1510534	1510539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017456	ATT	3	9	1510544	1510552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017456	CG	3	6	1510613	1510618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_017456	TA	3	6	1511672	1511677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017456	GAT	2	6	1511761	1511766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017456	TTA	2	6	1514406	1514411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017456	AC	3	6	1516270	1516275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5030	NC_017456	TAA	2	6	1519712	1519717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017456	ACA	2	6	1519732	1519737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_017456	GCAACC	2	12	1519812	1519823	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_017456	GAA	2	6	1519833	1519838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017456	ATC	2	6	1519853	1519858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_017456	ATC	2	6	1519862	1519867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_017456	TCA	2	6	1519878	1519883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_017456	TTC	2	6	1519886	1519891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_017456	ATT	2	6	1519985	1519990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017456	TCG	2	6	1520069	1520074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_017456	CAC	2	6	1520143	1520148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5041	NC_017456	TAT	2	6	1520155	1520160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017456	ATT	2	6	1520168	1520173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017456	TTC	2	6	1520205	1520210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_017456	CCA	2	6	1520268	1520273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_017456	GCA	2	6	1520304	1520309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_017456	CCA	2	6	1520340	1520345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5047	NC_017456	TTA	2	6	1520373	1520378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017456	ATT	2	6	1520384	1520389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017456	TCA	2	6	1520427	1520432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_017456	TCAGAA	2	12	1520436	1520447	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5051	NC_017456	ATC	3	9	1520456	1520464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_017456	CAT	2	6	1520467	1520472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_017456	TCA	2	6	1520523	1520528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_017456	TTA	2	6	1520535	1520540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_017456	AAGG	2	8	1520568	1520575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017456	TCCT	2	8	1520663	1520670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_017456	T	6	6	1520670	1520675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017456	TAC	2	6	1520837	1520842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_017456	TC	3	6	1520978	1520983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_017456	GCAC	2	8	1521024	1521031	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5061	NC_017456	ACT	2	6	1521069	1521074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_017456	ACC	2	6	1521086	1521091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_017456	ATGA	2	8	1521103	1521110	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017456	CAC	2	6	1521157	1521162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_017456	CTT	2	6	1521208	1521213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_017456	CAT	3	9	1521214	1521222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_017456	TAA	2	6	1521229	1521234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017456	CGA	2	6	1521243	1521248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_017456	TCT	2	6	1521303	1521308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_017456	TGC	2	6	1521374	1521379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_017456	TGCA	2	8	1521422	1521429	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5072	NC_017456	CAG	2	6	1521436	1521441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_017456	TGA	2	6	1521447	1521452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017456	TCG	2	6	1521495	1521500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_017456	CTG	2	6	1521613	1521618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_017456	GCA	2	6	1521654	1521659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_017456	AG	3	6	1521682	1521687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017456	TAG	2	6	1521720	1521725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017456	GTA	2	6	1521759	1521764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017456	AGT	2	6	1521788	1521793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017456	T	6	6	1521903	1521908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017456	CA	3	6	1522012	1522017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5083	NC_017456	CG	3	6	1522025	1522030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5084	NC_017456	CT	3	6	1522074	1522079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5085	NC_017456	TCT	2	6	1522088	1522093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_017456	CTT	2	6	1522113	1522118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_017456	ACT	2	6	1522128	1522133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_017456	AAT	4	12	1522159	1522170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_017456	ATT	2	6	1522242	1522247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017456	TAA	2	6	1522248	1522253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_017456	ATT	2	6	1522257	1522262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017456	TAA	2	6	1522263	1522268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_017456	TTAT	2	8	1522269	1522276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017456	AC	3	6	1522893	1522898	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5095	NC_017456	GGT	2	6	1523002	1523007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_017456	GA	3	6	1523016	1523021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017456	GAT	2	6	1523043	1523048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017456	GAG	2	6	1523136	1523141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017456	CAA	2	6	1523162	1523167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_017456	TAAG	2	8	1523168	1523175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017456	AGGT	2	8	1523208	1523215	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017456	CTA	2	6	1523228	1523233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_017456	GC	3	6	1523250	1523255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_017456	CG	3	6	1523262	1523267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_017456	ATA	2	6	1523287	1523292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017456	AAT	2	6	1523331	1523336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_017456	ACC	2	6	1523443	1523448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_017456	ATC	2	6	1523534	1523539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_017456	CAA	2	6	1523545	1523550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_017456	AGT	2	6	1523617	1523622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017456	CA	4	8	1523711	1523718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_017456	GAC	2	6	1523816	1523821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_017456	ACG	2	6	1523919	1523924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_017456	CGA	2	6	1523999	1524004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_017456	AGG	2	6	1524250	1524255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_017456	ACC	2	6	1524604	1524609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_017456	CAA	2	6	1524777	1524782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_017456	ACC	2	6	1524891	1524896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_017456	ACC	2	6	1525054	1525059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_017456	CTAC	2	8	1525071	1525078	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_017456	CTA	2	6	1525100	1525105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_017456	AGA	2	6	1525130	1525135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017456	GACTC	2	10	1525265	1525274	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5124	NC_017456	GAC	2	6	1525282	1525287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_017456	TC	3	6	1525338	1525343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5126	NC_017456	GCT	2	6	1525540	1525545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_017456	CCT	2	6	1525556	1525561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_017456	GAC	2	6	1525617	1525622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_017456	GAC	2	6	1525644	1525649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_017456	CCG	2	6	1525662	1525667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5131	NC_017456	GCT	2	6	1525708	1525713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5134	NC_017456	C	6	6	1525855	1525860	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5256	NC_017456	A	10	10	1558671	1558680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5259	NC_017456	CT	3	6	1558748	1558753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5260	NC_017456	TAA	2	6	1558756	1558761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_017456	TGT	2	6	1558782	1558787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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