MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 plasmid p174

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016907	GGCC	2	8	75	82	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016907	CCGA	2	8	924	931	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016907	CCCG	2	8	1011	1018	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_016907	GGCG	2	8	1461	1468	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016907	GCGG	2	8	2783	2790	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016907	AGCG	2	8	3127	3134	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016907	GCCG	2	8	3494	3501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016907	GGCC	2	8	3792	3799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016907	GCTC	2	8	4503	4510	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016907	TCAG	2	8	4552	4559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016907	CGGC	2	8	5154	5161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016907	CGCT	2	8	5193	5200	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016907	GGCC	2	8	5918	5925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016907	CGCC	2	8	6030	6037	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_016907	ACCT	2	8	10015	10022	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016907	CCGA	2	8	10056	10063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016907	CCGC	2	8	11563	11570	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_016907	GGAT	2	8	11749	11756	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016907	TTGG	2	8	11767	11774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016907	TTCG	2	8	11820	11827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016907	TCAA	2	8	11912	11919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016907	CGCC	2	8	11928	11935	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_016907	CCGA	2	8	11942	11949	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016907	CTGG	2	8	11980	11987	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016907	CTCA	2	8	12285	12292	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016907	CCAC	2	8	12357	12364	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_016907	CTGT	2	8	14129	14136	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016907	TCGA	2	8	14349	14356	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016907	ACCA	2	8	17536	17543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016907	TCCT	2	8	24817	24824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016907	GTTC	2	8	25132	25139	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016907	TGGT	2	8	25275	25282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016907	GTCG	2	8	29289	29296	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016907	GATG	2	8	32126	32133	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016907	CGTT	2	8	32290	32297	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016907	CGAT	2	8	34734	34741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016907	CGGG	2	8	34922	34929	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016907	CCGA	2	8	35532	35539	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016907	GATC	2	8	36616	36623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016907	CGGT	2	8	49490	49497	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016907	GAAC	2	8	53460	53467	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016907	GTCC	2	8	57806	57813	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016907	CGAA	2	8	65504	65511	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016907	GCCG	2	8	65978	65985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016907	GGCA	2	8	68208	68215	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016907	ATCG	2	8	68262	68269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016907	GGGC	2	8	69024	69031	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016907	GCCG	2	8	69242	69249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016907	CCTT	2	8	75748	75755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016907	GTGG	2	8	80781	80788	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016907	GTCG	2	8	80789	80796	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016907	GCCG	2	8	82308	82315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016907	ATCG	2	8	91917	91924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016907	GCAT	2	8	91947	91954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016907	GCCG	2	8	105495	105502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016907	GGCC	2	8	107688	107695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016907	CGCT	2	8	111575	111582	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016907	CGGC	2	8	112456	112463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016907	AATT	2	8	112481	112488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016907	GACC	2	8	118525	118532	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016907	GCCG	2	8	120704	120711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016907	CGGC	2	8	120826	120833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016907	CGGG	2	8	124302	124309	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016907	CGCT	2	8	128571	128578	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016907	GGCA	2	8	132437	132444	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016907	GTAC	2	8	133177	133184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016907	CGTC	2	8	139575	139582	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016907	GTCG	2	8	139586	139593	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016907	GCGG	2	8	145564	145571	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016907	CGTT	2	8	147108	147115	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016907	TTAC	2	8	152223	152230	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016907	TCGA	2	8	152412	152419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016907	ATGT	2	8	153437	153444	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016907	GCGG	2	8	153465	153472	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016907	ACCA	2	8	155809	155816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016907	GGTG	2	8	156519	156526	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016907	TGCG	2	8	164370	164377	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016907	TGTC	2	8	164941	164948	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016907	AATG	2	8	165194	165201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016907	GACC	2	8	165654	165661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016907	ATCG	2	8	170509	170516	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016907	CATC	2	8	170561	170568	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016907	ACTG	2	8	171947	171954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016907	CTCC	2	8	171976	171983	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_016907	CGGG	2	8	172967	172974	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.