MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 chromosome

Total Repeats: 13109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016906	AAGT	2	8	5629975	5629982	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_016906	CG	4	8	5630003	5630010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13003	NC_016906	TGG	2	6	5631873	5631878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_016906	CGG	2	6	5631880	5631885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_016906	CCA	2	6	5634783	5634788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13006	NC_016906	TGG	2	6	5634796	5634801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_016906	CG	4	8	5634835	5634842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13008	NC_016906	CTGC	2	8	5634866	5634873	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13009	NC_016906	TGG	2	6	5634885	5634890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_016906	C	6	6	5639278	5639283	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13011	NC_016906	TCGG	2	8	5640063	5640070	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13012	NC_016906	CGGG	2	8	5641954	5641961	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13013	NC_016906	CGA	2	6	5641995	5642000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_016906	CG	3	6	5643139	5643144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13015	NC_016906	AGCGA	2	10	5644644	5644653	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13016	NC_016906	AGCGA	2	10	5644682	5644691	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13017	NC_016906	AGCGA	2	10	5644720	5644729	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13018	NC_016906	GCT	2	6	5644769	5644774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_016906	CAG	2	6	5644806	5644811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_016906	CGCCC	2	10	5645052	5645061	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
13021	NC_016906	CGG	2	6	5645098	5645103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13022	NC_016906	CACCAG	2	12	5645116	5645127	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13023	NC_016906	GCCCG	2	10	5645182	5645191	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13024	NC_016906	CGG	2	6	5645202	5645207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13025	NC_016906	GC	3	6	5645241	5645246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13026	NC_016906	AGG	2	6	5645254	5645259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_016906	AGG	2	6	5645269	5645274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_016906	TCG	2	6	5646123	5646128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_016906	GC	3	6	5646131	5646136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13030	NC_016906	TGG	2	6	5646138	5646143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_016906	GTC	2	6	5646159	5646164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_016906	AGGC	2	8	5648949	5648956	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13033	NC_016906	GAGC	2	8	5648961	5648968	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13034	NC_016906	ACC	2	6	5648982	5648987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13035	NC_016906	CGC	2	6	5648994	5648999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13036	NC_016906	CTCCGG	2	12	5649020	5649031	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13037	NC_016906	CCG	2	6	5649048	5649053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13038	NC_016906	CCCGC	2	10	5649057	5649066	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
13039	NC_016906	CGGC	2	8	5649079	5649086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13040	NC_016906	CCG	3	9	5649124	5649132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13041	NC_016906	GGCC	2	8	5649135	5649142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13042	NC_016906	CGC	2	6	5649158	5649163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13043	NC_016906	AGC	2	6	5654105	5654110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_016906	CGA	2	6	5654196	5654201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_016906	CGCC	2	8	5654208	5654215	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13046	NC_016906	TCGC	2	8	5654855	5654862	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13047	NC_016906	TCG	2	6	5654883	5654888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_016906	ATG	2	6	5654900	5654905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_016906	TC	3	6	5655353	5655358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13050	NC_016906	CAC	2	6	5655377	5655382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13051	NC_016906	TGCGC	2	10	5655400	5655409	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13052	NC_016906	TTG	2	6	5655462	5655467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_016906	GCT	2	6	5655542	5655547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_016906	CA	3	6	5655607	5655612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13055	NC_016906	GCGT	2	8	5655633	5655640	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13056	NC_016906	CGTGG	2	10	5655647	5655656	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13057	NC_016906	CGAC	2	8	5656086	5656093	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13058	NC_016906	TGG	2	6	5656118	5656123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_016906	GCG	2	6	5656740	5656745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_016906	CGC	2	6	5656759	5656764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13061	NC_016906	GTG	2	6	5656791	5656796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_016906	AGT	2	6	5656822	5656827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_016906	G	6	6	5656898	5656903	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_016906	GCA	2	6	5657190	5657195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_016906	TGCGG	2	10	5657237	5657246	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13066	NC_016906	GCACC	2	10	5657317	5657326	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13067	NC_016906	CTG	2	6	5658009	5658014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_016906	CGACA	2	10	5658065	5658074	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13069	NC_016906	CCG	2	6	5658859	5658864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13070	NC_016906	TCGT	2	8	5658881	5658888	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13071	NC_016906	CG	3	6	5658914	5658919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13072	NC_016906	GGA	2	6	5659012	5659017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_016906	CCCGAG	2	12	5660035	5660046	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13074	NC_016906	TCA	2	6	5660049	5660054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13075	NC_016906	TCA	2	6	5660064	5660069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13076	NC_016906	AGG	2	6	5660071	5660076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_016906	GTT	2	6	5662815	5662820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_016906	TGGT	2	8	5662848	5662855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_016906	TCG	2	6	5662865	5662870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13080	NC_016906	AGT	2	6	5664942	5664947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_016906	GA	3	6	5664950	5664955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_016906	CTTG	2	8	5664978	5664985	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13083	NC_016906	CGAC	2	8	5665042	5665049	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13084	NC_016906	TCA	2	6	5665060	5665065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13085	NC_016906	TGA	2	6	5665086	5665091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_016906	CTC	2	6	5665797	5665802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13087	NC_016906	GGGGA	2	10	5665823	5665832	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_016906	CGT	2	6	5665844	5665849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13089	NC_016906	CGC	2	6	5665944	5665949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13090	NC_016906	AGA	2	6	5666687	5666692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_016906	CTT	2	6	5666764	5666769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_016906	CGT	2	6	5668220	5668225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_016906	GCGAT	2	10	5668228	5668237	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13094	NC_016906	ACG	2	6	5668238	5668243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_016906	CCG	2	6	5668247	5668252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13096	NC_016906	GTC	2	6	5668269	5668274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_016906	TTG	2	6	5668290	5668295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_016906	AAC	2	6	5669104	5669109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13099	NC_016906	GCCG	2	8	5669115	5669122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13100	NC_016906	TGG	2	6	5669359	5669364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_016906	GTG	2	6	5669404	5669409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_016906	C	6	6	5669413	5669418	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13103	NC_016906	CGA	2	6	5669437	5669442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_016906	GCT	2	6	5669444	5669449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_016906	GGA	2	6	5669568	5669573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_016906	GT	3	6	5669729	5669734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_016906	GGT	2	6	5669760	5669765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_016906	CGAC	2	8	5669779	5669786	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13109	NC_016906	CCG	2	6	5669789	5669794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.