MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 chromosome

Total Repeats: 13109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016906	AG	3	6	191360	191365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016906	GCG	2	6	191420	191425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_016906	GC	3	6	191465	191470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
504	NC_016906	GGA	2	6	191496	191501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016906	CTC	2	6	191576	191581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_016906	GC	3	6	195423	195428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_016906	CAG	2	6	195497	195502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_016906	TGA	3	9	195566	195574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016906	TG	3	6	195598	195603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016906	CCGCT	2	10	195608	195617	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
511	NC_016906	GCT	2	6	203435	203440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_016906	GCC	2	6	203607	203612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_016906	GT	3	6	203647	203652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016906	CAC	2	6	203756	203761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_016906	GTT	2	6	203767	203772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016906	GGCG	2	8	203773	203780	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
517	NC_016906	CGA	2	6	203820	203825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_016906	CGC	2	6	203930	203935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_016906	CGT	2	6	203981	203986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_016906	CGC	2	6	204074	204079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_016906	TGGTAG	2	12	205262	205273	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016906	CAG	2	6	205384	205389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_016906	GTT	2	6	205402	205407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016906	CGG	2	6	205442	205447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_016906	CCA	2	6	205545	205550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_016906	CGG	2	6	205626	205631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_016906	CGT	2	6	205639	205644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_016906	GCG	2	6	205659	205664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_016906	CTT	2	6	205685	205690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_016906	GAG	2	6	205791	205796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016906	CGG	2	6	205801	205806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_016906	ACC	2	6	206240	206245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_016906	CGA	2	6	206259	206264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_016906	CGGT	2	8	206275	206282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
535	NC_016906	GGA	2	6	206300	206305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016906	ATA	2	6	206317	206322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016906	GTC	2	6	206325	206330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_016906	AGG	2	6	206346	206351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016906	GTCGAA	2	12	206380	206391	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
540	NC_016906	GTTC	2	8	206403	206410	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
541	NC_016906	CAC	2	6	206436	206441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_016906	CAC	2	6	206445	206450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_016906	CAA	2	6	206505	206510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_016906	CA	3	6	206613	206618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_016906	GCTCGA	2	12	206638	206649	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_016906	GCG	2	6	206795	206800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_016906	CGC	2	6	208190	208195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_016906	G	7	7	208309	208315	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016906	GCG	2	6	208359	208364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_016906	TGGG	2	8	208378	208385	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016906	CGA	2	6	208412	208417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_016906	AC	4	8	208436	208443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_016906	GCT	2	6	209162	209167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_016906	CGC	2	6	209631	209636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_016906	CGC	3	9	209646	209654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_016906	CCA	2	6	209670	209675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_016906	CCA	2	6	209738	209743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_016906	ATCC	2	8	209758	209765	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_016906	GCC	2	6	209787	209792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_016906	CAC	2	6	209897	209902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_016906	ATA	2	6	213624	213629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016906	GATCT	2	10	213702	213711	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
563	NC_016906	GAG	2	6	213755	213760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016906	TTG	3	9	213795	213803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016906	GTTG	2	8	213823	213830	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016906	TAA	2	6	213864	213869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016906	CGT	2	6	213880	213885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_016906	CGA	2	6	213953	213958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_016906	GT	4	8	213974	213981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016906	TGAT	2	8	214014	214021	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016906	ACG	2	6	214043	214048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_016906	GTC	2	6	214106	214111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_016906	CGG	2	6	214138	214143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_016906	CGC	2	6	214153	214158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_016906	TAA	3	9	214195	214203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016906	C	6	6	214332	214337	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
577	NC_016906	GCAA	2	8	214350	214357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
578	NC_016906	GCTA	2	8	214358	214365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
579	NC_016906	AAG	2	6	214372	214377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016906	AGA	2	6	214620	214625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_016906	CCG	2	6	214644	214649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_016906	TCC	2	6	214743	214748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_016906	GCA	2	6	214756	214761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_016906	TTGG	2	8	214904	214911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_016906	CGA	2	6	215138	215143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_016906	GGT	2	6	215493	215498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_016906	CG	3	6	215541	215546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_016906	CGAA	2	8	215555	215562	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
589	NC_016906	ACG	2	6	215691	215696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_016906	GGGA	2	8	217276	217283	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016906	ATG	2	6	217296	217301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016906	TCAG	2	8	217305	217312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
593	NC_016906	GC	3	6	217340	217345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
594	NC_016906	ACC	2	6	218650	218655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_016906	TCC	2	6	218680	218685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_016906	TCC	2	6	225144	225149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_016906	CCT	2	6	225205	225210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_016906	CGAG	2	8	225257	225264	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
599	NC_016906	CCG	2	6	227278	227283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_016906	CCT	2	6	227294	227299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_016906	ACT	2	6	227368	227373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_016906	GCGCCG	2	12	227433	227444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
603	NC_016906	ATCG	2	8	229369	229376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
604	NC_016906	GAA	2	6	229392	229397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016906	CT	3	6	229519	229524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_016906	TCG	2	6	229532	229537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_016906	CCT	2	6	229560	229565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_016906	CGC	3	9	229591	229599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_016906	GTG	2	6	229615	229620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016906	GTTGC	2	10	229624	229633	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
611	NC_016906	CCGT	2	8	229664	229671	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
612	NC_016906	GC	3	6	229741	229746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
613	NC_016906	CGG	2	6	231467	231472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_016906	TCG	2	6	232831	232836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_016906	CCG	2	6	232863	232868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_016906	ACG	2	6	232897	232902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_016906	GCAG	2	8	232913	232920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
618	NC_016906	GCGCTG	2	12	232965	232976	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_016906	GC	3	6	233044	233049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_016906	TGC	2	6	233124	233129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_016906	CAC	2	6	233167	233172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_016906	CA	3	6	233195	233200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_016906	GTA	2	6	233219	233224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016906	CTGG	2	8	233252	233259	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
625	NC_016906	GGCC	2	8	233311	233318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
626	NC_016906	GCT	2	6	233343	233348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_016906	CTGTTC	2	12	233376	233387	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_016906	CGG	2	6	233460	233465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_016906	CAA	2	6	233482	233487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_016906	GAC	2	6	234563	234568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_016906	CCG	2	6	234677	234682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_016906	TG	3	6	234706	234711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_016906	GTGC	2	8	234777	234784	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
634	NC_016906	ACC	2	6	234908	234913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_016906	TGT	2	6	235733	235738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016906	CGA	2	6	237112	237117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_016906	TCA	2	6	237169	237174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_016906	GAG	2	6	237228	237233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_016906	GATC	2	8	237234	237241	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
640	NC_016906	ACC	3	9	237722	237730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
641	NC_016906	ACG	2	6	246021	246026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_016906	ACG	3	9	246069	246077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_016906	AC	3	6	246938	246943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
644	NC_016906	GCG	2	6	247026	247031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_016906	TCCG	2	8	247075	247082	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
646	NC_016906	CA	3	6	247100	247105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
647	NC_016906	CGT	2	6	247596	247601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_016906	GTG	2	6	248122	248127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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650	NC_016906	AGCG	2	8	250051	250058	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
651	NC_016906	TGG	2	6	250061	250066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
652	NC_016906	CG	3	6	250132	250137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
653	NC_016906	GGT	2	6	250160	250165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
654	NC_016906	CCG	2	6	250226	250231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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656	NC_016906	CCG	2	6	251329	251334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
657	NC_016906	CGG	2	6	251337	251342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
658	NC_016906	GCG	2	6	251359	251364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
659	NC_016906	GAAC	2	8	251384	251391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
660	NC_016906	AGG	2	6	251435	251440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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662	NC_016906	GTC	2	6	252022	252027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
663	NC_016906	GTGG	2	8	252043	252050	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
664	NC_016906	CCG	2	6	252135	252140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
665	NC_016906	CCG	2	6	252142	252147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
666	NC_016906	AGCG	2	8	252165	252172	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
667	NC_016906	CTC	2	6	252952	252957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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669	NC_016906	CGT	2	6	255123	255128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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671	NC_016906	CACAA	2	10	257108	257117	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
672	NC_016906	GAGG	2	8	257194	257201	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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674	NC_016906	GAC	2	6	258296	258301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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676	NC_016906	GTC	2	6	260548	260553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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678	NC_016906	GAG	3	9	260614	260622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
679	NC_016906	GGA	2	6	260632	260637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
680	NC_016906	GCC	2	6	260659	260664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
681	NC_016906	GCC	2	6	261206	261211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
682	NC_016906	CG	4	8	261253	261260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
683	NC_016906	GC	3	6	261327	261332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
684	NC_016906	TG	3	6	261339	261344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
685	NC_016906	GGTG	2	8	261366	261373	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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702	NC_016906	GC	3	6	269203	269208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
703	NC_016906	ACC	2	6	269221	269226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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721	NC_016906	CGT	2	6	275732	275737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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767	NC_016906	GAG	2	6	298189	298194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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