MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus thermoleovorans CCB_US3_UF5 chromosome

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016593	GTTTTT	2	12	1557	1568	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016593	CGAAGG	2	12	10353	10364	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016593	TGCGTC	2	12	12269	12280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016593	CGAAGG	2	12	15651	15662	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016593	AAGCGA	2	12	21653	21664	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016593	TGCGTC	2	12	31157	31168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016593	CGAAGG	2	12	31473	31484	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016593	CGAAGG	2	12	34545	34556	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016593	TTTGCG	2	12	60084	60095	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016593	CGAAGG	2	12	95783	95794	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016593	AGTAAG	2	12	96218	96229	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016593	AGTCAA	2	12	96239	96250	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016593	GTTCCG	2	12	116348	116359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016593	CGAAGG	2	12	155324	155335	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016593	GTATCC	2	12	170494	170505	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016593	AGATGA	2	12	194235	194246	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016593	TTTTGT	2	12	240950	240961	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016593	CTTTTT	2	12	253766	253777	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016593	CCGCAT	2	12	271010	271021	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016593	GGAAGA	2	12	271196	271207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016593	CATTTT	2	12	305970	305981	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016593	TGCGTC	2	12	316328	316339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016593	TGCGTC	2	12	316503	316514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016593	GGAAAC	2	12	320218	320229	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016593	AGTAAA	2	12	356808	356819	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016593	AAGGGC	2	12	362554	362565	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016593	TGTGCA	2	12	362767	362778	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016593	GCCGAG	2	12	396621	396632	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016593	AAAGCC	2	12	436133	436144	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016593	AAAGAA	2	12	445526	445537	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016593	AAGGAA	2	12	467373	467384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016593	GCAACA	2	12	483170	483181	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016593	CTTGCC	2	12	486462	486473	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016593	GTTCCA	2	12	542862	542873	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016593	TGCGTC	2	12	570746	570757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016593	CGAAGG	2	12	571008	571019	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016593	ACTAGA	2	12	585828	585839	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016593	GAAAAT	2	12	598897	598908	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016593	TAGGGA	2	12	639850	639861	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016593	TTTCGT	2	12	731581	731592	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016593	TTACAC	2	12	761548	761559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016593	TCTCCT	2	12	769057	769068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016593	GAAAGG	2	12	820204	820215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016593	AAGGAA	2	12	838989	839000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016593	TTTTTA	2	12	853807	853818	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016593	CAAAAA	2	12	878048	878059	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016593	GGATAC	2	12	878508	878519	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016593	AAAGTA	2	12	878842	878853	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016593	TCCGGA	2	12	913645	913656	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016593	CTTTTC	2	12	914092	914103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016593	GCGGAT	2	12	943729	943740	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016593	CATTTG	2	12	1058060	1058071	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016593	AAGATC	2	12	1064035	1064046	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_016593	GAAAAA	2	12	1070716	1070727	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016593	TTTGAC	2	12	1073095	1073106	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_016593	AAGGAG	2	12	1074164	1074175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016593	ACGTAT	2	12	1103744	1103755	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016593	TTTTTA	2	12	1108445	1108456	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016593	GTATCC	2	12	1112181	1112192	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016593	ACTTTC	2	12	1115773	1115784	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016593	GTGATC	2	12	1137837	1137848	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016593	CTATCG	2	12	1142264	1142275	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016593	CTTTTT	2	12	1145331	1145342	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016593	GGCCTT	2	12	1149252	1149263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016593	CCAATT	2	12	1150105	1150116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016593	ACAAGC	2	12	1156581	1156592	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016593	GGTGGA	2	12	1159205	1159216	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016593	TGGAAC	2	12	1227263	1227274	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016593	TCCATT	2	12	1347202	1347213	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016593	AAAATA	2	12	1412279	1412290	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016593	GTTTTT	2	12	1443389	1443400	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016593	CCCTTA	2	12	1470191	1470202	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016593	CCTTTT	2	12	1508125	1508136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016593	AGGAAA	2	12	1510625	1510636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016593	AGTTAT	2	12	1558428	1558439	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016593	CTTTTC	2	12	1563935	1563946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016593	CATATA	2	12	1630838	1630849	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016593	CCGGAA	2	12	1680257	1680268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016593	TTGATT	2	12	1741144	1741155	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016593	TTGTTT	2	12	1751472	1751483	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016593	AATCGT	2	12	1765677	1765688	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_016593	GCAAAT	2	12	1782815	1782826	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_016593	AAATAA	2	12	1806993	1807004	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016593	ATCATT	2	12	1807065	1807076	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016593	GTTATG	2	12	1837447	1837458	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016593	TATAAG	2	12	1849039	1849050	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016593	CTTTTT	2	12	1850431	1850442	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_016593	AGAAAA	2	12	1850528	1850539	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016593	TGAAAA	2	12	1862316	1862327	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016593	AATTCA	2	12	1911683	1911694	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_016593	TTTTGG	2	12	1938667	1938678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016593	GGTAAA	2	12	1994639	1994650	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016593	GGTACA	2	12	2022313	2022324	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016593	TTCGAG	2	12	2028074	2028085	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_016593	CTATAT	2	12	2038462	2038473	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016593	GCAAGT	2	12	2051680	2051691	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_016593	TTGCTT	2	12	2084214	2084225	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_016593	ACCTCC	2	12	2099351	2099362	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_016593	CCCTTT	2	12	2130878	2130889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016593	ATTACC	2	12	2174867	2174878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016593	TTTTTG	2	12	2174922	2174933	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016593	ACCGCA	2	12	2179934	2179945	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016593	ATTTTT	2	12	2190873	2190884	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016593	CAAGCG	2	12	2204059	2204070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016593	CCTTCG	2	12	2238130	2238141	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016593	AGACGC	2	12	2238303	2238314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016593	CCTTCG	2	12	2240137	2240148	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016593	AAAAGA	2	12	2258319	2258330	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016593	GCAAAA	2	12	2384614	2384625	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_016593	CGATGG	2	12	2441715	2441726	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_016593	TAAATA	2	12	2454051	2454062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016593	CGGCCG	2	12	2529614	2529625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016593	GCTATG	2	12	2541063	2541074	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_016593	TGACTT	2	12	2582742	2582753	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_016593	GGCGAG	2	12	2633612	2633623	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_016593	GCAAAA	2	12	2665902	2665913	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_016593	CGGAAA	2	12	2756746	2756757	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_016593	TATAAA	2	12	2776001	2776012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016593	AAAGGA	2	12	2844670	2844681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016593	CGTTTC	2	12	2882645	2882656	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016593	ATTTTC	2	12	2970715	2970726	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_016593	TCATTA	2	12	3004465	3004476	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_016593	CATGAT	2	12	3004804	3004815	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_016593	CCTTCG	2	12	3011463	3011474	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016593	AAATCA	2	12	3037545	3037556	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_016593	TACATT	2	12	3037628	3037639	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_016593	CGCCTT	2	12	3046188	3046199	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016593	GCAAAA	2	12	3049099	3049110	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_016593	GAACGA	2	12	3066673	3066684	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_016593	CTCATT	2	12	3080272	3080283	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016593	ATTTTT	2	12	3084915	3084926	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016593	TGAAAA	2	12	3085781	3085792	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016593	ATGGAG	2	12	3141365	3141376	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016593	AAAGGA	2	12	3146393	3146404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_016593	ATTCGG	2	12	3563234	3563245	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_016593	TGGGAG	2	12	3579427	3579438	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.