MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Glaciecola nitratireducens FR1064 chromosome

Total Repeats: 9954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016041	AG	3	6	1931929	1931934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_016041	TGT	2	6	1931985	1931990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_016041	GAAA	2	8	1932079	1932086	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_016041	AAT	2	6	1932129	1932134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_016041	GTT	2	6	1932149	1932154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_016041	AGC	2	6	1932167	1932172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_016041	AATTG	2	10	1932252	1932261	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_016041	TAA	2	6	1932430	1932435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_016041	CGT	2	6	1932465	1932470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_016041	GAT	2	6	1932483	1932488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_016041	A	6	6	1932506	1932511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_016041	AG	3	6	1932568	1932573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_016041	T	6	6	1932584	1932589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_016041	TGGC	2	8	1932602	1932609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5015	NC_016041	ACTC	2	8	1932677	1932684	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_016041	TCT	2	6	1932715	1932720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_016041	ATA	2	6	1934601	1934606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_016041	TAT	2	6	1934622	1934627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_016041	GTT	2	6	1934644	1934649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_016041	AGC	2	6	1934660	1934665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_016041	CT	3	6	1934804	1934809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_016041	TA	3	6	1936607	1936612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_016041	ATA	2	6	1936639	1936644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_016041	TA	3	6	1936667	1936672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_016041	A	6	6	1936672	1936677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_016041	TAAA	2	8	1936703	1936710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_016041	CCTGT	2	10	1938423	1938432	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5028	NC_016041	TTA	2	6	1941004	1941009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_016041	GTA	2	6	1941076	1941081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_016041	AATAG	2	10	1941085	1941094	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_016041	A	6	6	1943552	1943557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_016041	CGA	2	6	1943558	1943563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_016041	AATA	2	8	1943566	1943573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_016041	GGA	3	9	1947291	1947299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_016041	ACC	2	6	1947320	1947325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5036	NC_016041	TGA	2	6	1947332	1947337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_016041	GCC	2	6	1947338	1947343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_016041	GCA	2	6	1947371	1947376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_016041	T	7	7	1948500	1948506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_016041	T	6	6	1948508	1948513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_016041	ACC	2	6	1948540	1948545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_016041	TTA	3	9	1948626	1948634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_016041	T	6	6	1948635	1948640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_016041	TGA	2	6	1948688	1948693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_016041	AT	3	6	1950736	1950741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_016041	A	6	6	1950828	1950833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_016041	A	8	8	1951963	1951970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_016041	ATAA	2	8	1953023	1953030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_016041	A	6	6	1953052	1953057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_016041	TTG	2	6	1953068	1953073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_016041	A	7	7	1953104	1953110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_016041	AAT	2	6	1955917	1955922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_016041	T	7	7	1955954	1955960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_016041	A	6	6	1955965	1955970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_016041	T	7	7	1956839	1956845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_016041	TAT	2	6	1956859	1956864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_016041	GTC	2	6	1957145	1957150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_016041	TAT	2	6	1960682	1960687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_016041	TTA	2	6	1960746	1960751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_016041	TTA	2	6	1960760	1960765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_016041	TGAA	2	8	1960804	1960811	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_016041	GTT	2	6	1960823	1960828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_016041	TTG	2	6	1960835	1960840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_016041	T	6	6	1960884	1960889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_016041	TAG	2	6	1960894	1960899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_016041	GGA	2	6	1960936	1960941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_016041	ATT	2	6	1960951	1960956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_016041	ATTT	2	8	1960960	1960967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_016041	AAAT	2	8	1960975	1960982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_016041	GTTT	2	8	1960996	1961003	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_016041	TTA	2	6	1961045	1961050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_016041	ATT	2	6	1961856	1961861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_016041	ACAT	2	8	1961865	1961872	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5074	NC_016041	ATA	2	6	1961896	1961901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_016041	TAAT	2	8	1964683	1964690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_016041	GCG	2	6	1964707	1964712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_016041	GCG	2	6	1967211	1967216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_016041	T	6	6	1967217	1967222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_016041	GAC	2	6	1967951	1967956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_016041	AAC	2	6	1967966	1967971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_016041	GAT	2	6	1967986	1967991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_016041	A	6	6	1968002	1968007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_016041	TGG	2	6	1972264	1972269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_016041	GTT	2	6	1972279	1972284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_016041	A	8	8	1972298	1972305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_016041	A	6	6	1972344	1972349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_016041	TTAA	2	8	1973497	1973504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_016041	T	6	6	1973524	1973529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_016041	AAAATA	2	12	1973531	1973542	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_016041	GTT	2	6	1974104	1974109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_016041	ATT	2	6	1974150	1974155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_016041	TAAA	2	8	1974175	1974182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_016041	GCA	2	6	1977428	1977433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_016041	CTA	2	6	1977447	1977452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_016041	TCT	2	6	1977473	1977478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_016041	CTAG	2	8	1977491	1977498	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5097	NC_016041	CTTA	2	8	1977499	1977506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5098	NC_016041	AGC	2	6	1977512	1977517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_016041	AAT	2	6	1977521	1977526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_016041	GTC	2	6	1978938	1978943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_016041	CTTA	3	12	1980505	1980516	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5102	NC_016041	CT	3	6	1980875	1980880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5103	NC_016041	AACA	2	8	1981998	1982005	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5104	NC_016041	ATA	2	6	1982737	1982742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_016041	AGT	2	6	1982804	1982809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_016041	TAT	2	6	1982827	1982832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_016041	A	6	6	1982846	1982851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_016041	CAAA	3	12	1982856	1982867	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5109	NC_016041	A	9	9	1982865	1982873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_016041	T	6	6	1982877	1982882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_016041	ACA	2	6	1982898	1982903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_016041	CTGG	2	8	1983212	1983219	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5113	NC_016041	T	6	6	1983254	1983259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_016041	CT	3	6	1983267	1983272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_016041	AGCTT	2	10	1983333	1983342	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5116	NC_016041	CGAA	2	8	1983368	1983375	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5117	NC_016041	CAG	2	6	1983410	1983415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_016041	CA	3	6	1983457	1983462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_016041	AT	3	6	1983493	1983498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_016041	TAA	2	6	1983558	1983563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_016041	ATA	2	6	1983564	1983569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_016041	GA	3	6	1986082	1986087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_016041	AGC	2	6	1986711	1986716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_016041	GTTT	2	8	1986772	1986779	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_016041	TTGA	2	8	1986891	1986898	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_016041	CAA	2	6	1986912	1986917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_016041	GCG	2	6	1986922	1986927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_016041	AC	3	6	1987022	1987027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_016041	GCAA	2	8	1987029	1987036	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5130	NC_016041	AAT	2	6	1987050	1987055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_016041	T	7	7	1987071	1987077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_016041	CAC	2	6	1987090	1987095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5133	NC_016041	TACTTT	2	12	1987125	1987136	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5134	NC_016041	CAA	2	6	1987145	1987150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_016041	GTA	2	6	1987155	1987160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5137	NC_016041	GT	4	8	1991271	1991278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_016041	TAC	2	6	1994454	1994459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5140	NC_016041	GA	3	6	1994594	1994599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5141	NC_016041	TTG	2	6	1995202	1995207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_016041	TGTA	2	8	1995221	1995228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_016041	CTC	2	6	1995234	1995239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5145	NC_016041	TTAA	2	8	1995374	1995381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5147	NC_016041	GTG	2	6	1995402	1995407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5148	NC_016041	CTCG	2	8	1995438	1995445	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5149	NC_016041	CAC	2	6	1995478	1995483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5150	NC_016041	GTT	2	6	1995495	1995500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5154	NC_016041	TAAT	2	8	1995592	1995599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5155	NC_016041	ATT	2	6	1995694	1995699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5164	NC_016041	AATCA	2	10	1996722	1996731	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5165	NC_016041	T	6	6	1996793	1996798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5166	NC_016041	T	6	6	1996844	1996849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5167	NC_016041	ATT	2	6	1996858	1996863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5168	NC_016041	T	6	6	1998452	1998457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5182	NC_016041	TAAG	2	8	2011933	2011940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5246	NC_016041	AGTT	2	8	2036593	2036600	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_016041	ATT	2	6	2036616	2036621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5252	NC_016041	A	6	6	2036805	2036810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_016041	TAA	2	6	2036828	2036833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5256	NC_016041	ATT	2	6	2037395	2037400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5257	NC_016041	TCAA	2	8	2037422	2037429	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5258	NC_016041	ATC	2	6	2038111	2038116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5259	NC_016041	CGCTC	2	10	2038151	2038160	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5260	NC_016041	ACT	2	6	2038241	2038246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5261	NC_016041	TTAC	2	8	2039043	2039050	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5262	NC_016041	ATTG	2	8	2039123	2039130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5263	NC_016041	ATAGG	2	10	2039237	2039246	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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5265	NC_016041	TAGCGA	2	12	2039326	2039337	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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5399	NC_016041	AAAC	2	8	2097944	2097951	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5400	NC_016041	AC	3	6	2097950	2097955	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5401	NC_016041	AAGC	2	8	2098005	2098012	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5402	NC_016041	TTA	2	6	2098033	2098038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5403	NC_016041	T	6	6	2100325	2100330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5404	NC_016041	TGT	2	6	2101158	2101163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5405	NC_016041	AAT	2	6	2101188	2101193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5406	NC_016041	CCA	2	6	2101209	2101214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5408	NC_016041	TCA	2	6	2102447	2102452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5411	NC_016041	TAT	2	6	2105123	2105128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5412	NC_016041	A	8	8	2105724	2105731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5413	NC_016041	AC	3	6	2105774	2105779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5421	NC_016041	A	6	6	2108147	2108152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5422	NC_016041	CCA	2	6	2108155	2108160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5424	NC_016041	T	7	7	2110697	2110703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5425	NC_016041	TTG	2	6	2110705	2110710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5426	NC_016041	ATT	2	6	2114351	2114356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5427	NC_016041	T	6	6	2114355	2114360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5429	NC_016041	CAT	2	6	2114413	2114418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5431	NC_016041	TTG	2	6	2114430	2114435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5432	NC_016041	TGAAT	2	10	2114467	2114476	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5441	NC_016041	GTT	2	6	2121634	2121639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5442	NC_016041	GCC	2	6	2121713	2121718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5443	NC_016041	A	6	6	2121722	2121727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5444	NC_016041	ATT	2	6	2122250	2122255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5446	NC_016041	TAT	2	6	2122297	2122302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5451	NC_016041	TTA	2	6	2124765	2124770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5483	NC_016041	ATC	2	6	2131502	2131507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5492	NC_016041	TTTG	2	8	2132507	2132514	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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