MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH01

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015665	AGAA	2	8	99	106	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015665	AAGT	2	8	861	868	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015665	TCTT	2	8	1126	1133	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015665	CATA	2	8	3571	3578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015665	CTTC	2	8	4565	4572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015665	GATA	2	8	4607	4614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015665	TTTA	2	8	4720	4727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015665	AATG	2	8	8502	8509	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015665	CGAA	2	8	8753	8760	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015665	TTGT	2	8	9232	9239	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015665	TAAA	2	8	11113	11120	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015665	TTCA	2	8	11632	11639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015665	CCTG	2	8	12052	12059	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015665	AAGC	2	8	12137	12144	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015665	TTGC	2	8	12274	12281	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015665	CATG	2	8	12657	12664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015665	TAAA	2	8	12818	12825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015665	GAAA	2	8	12989	12996	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015665	TTAG	2	8	13092	13099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015665	TACG	2	8	14139	14146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015665	AATT	2	8	14651	14658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015665	AGGT	2	8	15691	15698	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015665	CTTT	2	8	16947	16954	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015665	TATT	2	8	17259	17266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015665	TTAC	2	8	18975	18982	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015665	GTTT	2	8	21590	21597	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015665	TAAA	2	8	21610	21617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015665	CTTT	2	8	30253	30260	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015665	AAAT	2	8	30340	30347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015665	AACA	3	12	30503	30514	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015665	CAGG	2	8	30740	30747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015665	TATC	2	8	30799	30806	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015665	GTTT	2	8	30999	31006	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015665	GAAA	2	8	31090	31097	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015665	AGAA	2	8	31105	31112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015665	ATCC	2	8	31398	31405	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015665	TGAT	2	8	31417	31424	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015665	GAAA	2	8	31606	31613	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015665	GCTT	2	8	31668	31675	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015665	GTCG	2	8	31828	31835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015665	AAAG	2	8	32015	32022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015665	TGTC	2	8	32386	32393	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015665	TTGC	2	8	32583	32590	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015665	GAAA	2	8	33002	33009	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015665	TTTA	2	8	33266	33273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015665	ATTT	2	8	33293	33300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015665	ATTG	2	8	33301	33308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015665	ATTT	2	8	33325	33332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015665	GTTT	2	8	33341	33348	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015665	GCCG	2	8	36692	36699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015665	AGAA	2	8	36759	36766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015665	GAAG	2	8	45159	45166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015665	AATA	2	8	45176	45183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015665	CAAC	2	8	46478	46485	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015665	AATA	2	8	47375	47382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015665	TATT	2	8	47401	47408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015665	TAAT	2	8	48123	48130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015665	TCAT	2	8	48326	48333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015665	GAAC	2	8	48594	48601	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015665	ATGA	2	8	48760	48767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015665	AATC	2	8	49117	49124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015665	ACAA	2	8	49312	49319	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015665	ATAA	2	8	49624	49631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015665	TCGT	2	8	50455	50462	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015665	TACG	2	8	50479	50486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015665	CCGG	2	8	52361	52368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015665	CCGC	2	8	52417	52424	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_015665	CAGC	2	8	52607	52614	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015665	TGTT	2	8	61837	61844	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015665	ACAA	2	8	62031	62038	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015665	ACAA	2	8	62074	62081	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015665	AAAC	2	8	62096	62103	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015665	TGAT	2	8	62218	62225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015665	CAAA	2	8	62255	62262	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015665	ACAA	2	8	63794	63801	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015665	CCTT	2	8	64125	64132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015665	CGAA	2	8	64993	65000	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015665	GAGG	2	8	65245	65252	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015665	TAAT	2	8	66573	66580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015665	ATAA	2	8	67937	67944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015665	GAAT	2	8	69789	69796	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015665	TTGA	2	8	69938	69945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015665	AGGG	2	8	69960	69967	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015665	CTTG	2	8	70257	70264	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015665	GGAG	2	8	71333	71340	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015665	TCAT	2	8	72593	72600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015665	TCAT	2	8	72749	72756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015665	AACA	2	8	72814	72821	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015665	AGGA	2	8	72845	72852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015665	GATA	2	8	73166	73173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015665	CGTT	2	8	74426	74433	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015665	TTGA	2	8	74480	74487	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015665	CTTT	2	8	74909	74916	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015665	CCAT	2	8	75723	75730	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015665	AAAT	2	8	75812	75819	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015665	TTAA	2	8	75832	75839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015665	TCCC	2	8	76032	76039	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_015665	AAAC	2	8	77042	77049	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015665	GATC	2	8	78243	78250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015665	AAAC	2	8	78467	78474	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015665	TTGG	2	8	78506	78513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015665	ATTC	2	8	78868	78875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015665	TTTA	2	8	79094	79101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015665	AAAG	2	8	79732	79739	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015665	GCTT	2	8	80841	80848	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.