MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH01

Total Repeats: 342

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015665	GGC	2	6	111	116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015665	ATT	2	6	901	906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015665	ACC	2	6	929	934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015665	TGA	2	6	944	949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015665	TCA	2	6	1091	1096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015665	GAA	2	6	1177	1182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015665	ATA	2	6	1183	1188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015665	ACA	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015665	CTG	2	6	1309	1314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015665	AAT	2	6	1320	1325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015665	TCT	2	6	1329	1334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015665	AGG	2	6	1464	1469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015665	TGA	2	6	1480	1485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015665	CTG	2	6	1621	1626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015665	TGC	2	6	1838	1843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015665	GAT	2	6	1934	1939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015665	CAC	2	6	3476	3481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015665	TAC	2	6	3485	3490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015665	TAA	2	6	3521	3526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015665	CTC	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015665	TAG	2	6	4551	4556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015665	TGT	2	6	5935	5940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015665	CAT	2	6	6010	6015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015665	CTG	2	6	6016	6021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015665	CAG	2	6	6028	6033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015665	CCG	2	6	6066	6071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_015665	CGG	2	6	8440	8445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015665	CAT	2	6	8643	8648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015665	TGC	2	6	8706	8711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015665	CTT	2	6	8894	8899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015665	GCA	2	6	9273	9278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015665	ATT	2	6	9300	9305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015665	CCG	2	6	9339	9344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015665	TCT	2	6	10964	10969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015665	TAA	2	6	11047	11052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015665	GGA	2	6	11441	11446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015665	TCC	2	6	11455	11460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_015665	TAA	2	6	11540	11545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015665	GAA	2	6	11599	11604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015665	GTC	2	6	11611	11616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015665	ACG	2	6	11930	11935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015665	GCG	2	6	12021	12026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015665	CTG	2	6	12062	12067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015665	CAT	2	6	12164	12169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015665	GTG	2	6	12217	12222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015665	AGC	2	6	12357	12362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015665	CGC	2	6	12404	12409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015665	AAC	2	6	12463	12468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015665	AAG	2	6	12531	12536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015665	CGG	2	6	12563	12568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015665	AAT	2	6	12621	12626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015665	TCA	2	6	12648	12653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015665	CCA	2	6	12697	12702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015665	GTT	2	6	12710	12715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015665	GGT	2	6	12741	12746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015665	ACA	2	6	12786	12791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015665	GGA	2	6	12833	12838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015665	GTT	2	6	13007	13012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015665	ATC	2	6	13040	13045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015665	ATT	2	6	13049	13054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015665	GTG	2	6	13117	13122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015665	CAC	2	6	14105	14110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015665	AAT	3	9	14120	14128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015665	TAA	2	6	14131	14136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015665	TCT	2	6	14168	14173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015665	AGC	2	6	14207	14212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015665	GAT	2	6	14255	14260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015665	ATC	2	6	14288	14293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015665	ATT	2	6	14319	14324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015665	ATT	2	6	14510	14515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015665	CTT	2	6	14574	14579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015665	CTG	2	6	14706	14711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015665	AAT	2	6	14744	14749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015665	ACA	2	6	14843	14848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015665	CCA	2	6	14864	14869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_015665	TTC	2	6	14917	14922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015665	CGG	2	6	15056	15061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015665	CTT	2	6	15079	15084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015665	CGT	2	6	15214	15219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015665	TTC	2	6	15256	15261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015665	AAT	2	6	15368	15373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015665	ACA	2	6	15403	15408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015665	ATG	2	6	15433	15438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015665	GCG	2	6	15473	15478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015665	CCG	2	6	15591	15596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_015665	AGG	2	6	15618	15623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015665	CTT	2	6	16856	16861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015665	GTT	2	6	16897	16902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015665	GCC	2	6	17213	17218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_015665	ACT	2	6	17248	17253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015665	TCG	2	6	18564	18569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015665	TGA	2	6	18804	18809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015665	AAG	2	6	18851	18856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015665	TCC	2	6	19954	19959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_015665	ATA	2	6	21561	21566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015665	ACC	2	6	26959	26964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015665	TTA	2	6	27576	27581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015665	AAT	2	6	27662	27667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015665	AAG	2	6	27739	27744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015665	TCA	2	6	29895	29900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015665	TAT	2	6	29909	29914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015665	AAT	2	6	29921	29926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015665	AAT	2	6	30000	30005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015665	TAA	2	6	30020	30025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015665	TGA	2	6	30120	30125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015665	TTG	2	6	30234	30239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015665	AAT	2	6	30468	30473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015665	ACA	2	6	30710	30715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015665	TCA	2	6	30785	30790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015665	AAT	2	6	30823	30828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015665	TCC	3	9	31007	31015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_015665	CCT	2	6	31064	31069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_015665	AAG	2	6	31078	31083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015665	GAA	2	6	31131	31136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015665	AAG	2	6	31137	31142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015665	TCT	2	6	31162	31167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015665	AAC	2	6	31177	31182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015665	CGC	2	6	31354	31359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015665	TCA	2	6	31489	31494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015665	TTG	2	6	31536	31541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015665	GGC	2	6	31573	31578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015665	CGC	2	6	31634	31639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_015665	CTT	2	6	31736	31741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015665	TCT	2	6	31763	31768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015665	CCA	2	6	31839	31844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_015665	CGT	2	6	31875	31880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015665	TCG	2	6	32219	32224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015665	TCT	2	6	32262	32267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015665	ATT	3	9	32326	32334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015665	TGC	2	6	32339	32344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015665	GGC	2	6	32351	32356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015665	TCC	2	6	32368	32373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_015665	ATA	2	6	32554	32559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015665	AAT	2	6	32594	32599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015665	ACA	2	6	32705	32710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015665	GGA	2	6	32774	32779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015665	GAA	2	6	33088	33093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015665	TCT	2	6	33133	33138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015665	GAA	2	6	33237	33242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015665	GAA	2	6	33245	33250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015665	TGT	2	6	33280	33285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_015665	TTC	2	6	74456	74461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_015665	TCA	2	6	74547	74552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_015665	TCC	2	6	74587	74592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
283	NC_015665	TGA	2	6	74743	74748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_015665	ATA	2	6	74756	74761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_015665	ATT	2	6	74765	74770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_015665	ATA	2	6	74798	74803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_015665	AAT	2	6	74842	74847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_015665	CAA	2	6	74956	74961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_015665	ATA	2	6	75039	75044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_015665	GTA	2	6	75062	75067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_015665	GGC	2	6	75193	75198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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295	NC_015665	AAT	2	6	75376	75381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_015665	GTT	2	6	75557	75562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
299	NC_015665	AAT	2	6	75586	75591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_015665	TAT	2	6	75637	75642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_015665	ATA	2	6	75745	75750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_015665	ATA	2	6	75846	75851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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342	NC_015665	ATT	2	6	80776	80781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.