MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 chromosome

Total Repeats: 777

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015660	TAAAA	2	10	3181	3190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015660	TCGTG	2	10	11753	11762	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015660	GAAAA	2	10	12262	12271	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015660	TTTAT	2	10	16064	16073	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015660	TTTTA	2	10	22080	22089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015660	TCGTG	2	10	32058	32067	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015660	GAAAA	2	10	32567	32576	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015660	AGACA	2	10	38970	38979	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015660	CTCTC	2	10	43272	43281	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_015660	TAAAA	2	10	43625	43634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015660	GGATT	2	10	68352	68361	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015660	CTTTT	2	10	68866	68875	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015660	GATAT	2	10	77282	77291	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015660	TCGTG	2	10	90725	90734	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015660	TCGTG	2	10	96755	96764	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015660	AAAGC	2	10	97550	97559	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015660	AAAAG	2	10	100798	100807	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015660	ATGAT	2	10	100835	100844	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015660	GATTA	2	10	109455	109464	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015660	TGTTT	2	10	116274	116283	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015660	AAACC	2	10	116292	116301	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015660	TCGTG	2	10	158465	158474	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015660	AAAGC	2	10	159260	159269	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015660	TATGT	2	10	163279	163288	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015660	ATATG	2	10	166210	166219	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015660	ATTCT	2	10	169753	169762	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015660	ATAAA	2	10	175553	175562	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015660	AAAAT	2	10	179465	179474	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015660	CGGGA	2	10	198877	198886	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015660	TGATT	2	10	208919	208928	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015660	GTTAA	2	10	209287	209296	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015660	CAAAG	2	10	209434	209443	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015660	TCACG	2	10	210076	210085	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_015660	TAACG	2	10	213204	213213	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015660	TAGTT	2	10	214802	214811	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015660	TGCAA	2	10	215076	215085	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015660	AGCAG	2	10	217280	217289	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015660	GTAAA	2	10	222985	222994	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015660	AAATG	2	10	227086	227095	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015660	ATTAT	2	10	228793	228802	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015660	TATTC	2	10	231315	231324	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015660	GAAAA	2	10	235154	235163	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015660	CAAAC	2	10	245961	245970	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_015660	CTTTG	2	10	255680	255689	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_015660	GCTCC	2	10	269049	269058	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_015660	AACAA	2	10	269981	269990	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015660	AGAAA	2	10	270435	270444	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015660	GTTTT	2	10	277101	277110	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015660	TGCCG	2	10	281506	281515	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015660	TAAAA	2	10	283687	283696	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015660	AGGGA	2	10	284008	284017	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015660	ATTTA	2	10	312414	312423	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015660	TTAAA	2	10	317384	317393	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015660	ATATC	2	10	317548	317557	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015660	CTTTT	2	10	340013	340022	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015660	CAGAT	2	10	346847	346856	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015660	CATAA	2	10	363228	363237	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015660	TTTTC	2	10	369060	369069	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015660	TAAAA	2	10	369235	369244	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015660	AAGGA	2	10	369352	369361	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015660	GAAAA	2	10	375785	375794	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015660	TAGTC	2	10	395008	395017	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015660	TAAGA	2	10	396263	396272	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015660	AATAT	2	10	413776	413785	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015660	ACAGC	2	10	425015	425024	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_015660	GAAAC	2	10	434005	434014	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_015660	GCGAA	2	10	445175	445184	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015660	ACTTC	2	10	445964	445973	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_015660	GTAGT	2	10	459831	459840	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015660	TATTT	2	10	469546	469555	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015660	ACCTT	2	10	477427	477436	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_015660	TATTT	2	10	480897	480906	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015660	TTTTG	2	10	492935	492944	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015660	AAAGC	2	10	498927	498936	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015660	TAACC	2	10	499077	499086	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_015660	CATCG	2	10	502311	502320	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_015660	GCTTA	2	10	504846	504855	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015660	ACCGA	2	10	505286	505295	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_015660	GTAAT	2	10	505891	505900	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015660	ATGGG	2	10	507398	507407	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015660	ATTAA	2	10	507672	507681	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015660	GATTT	2	10	509452	509461	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015660	CGTTA	2	10	518794	518803	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015660	TTACA	2	10	520355	520364	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015660	CGGTC	2	10	526298	526307	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_015660	AACTT	2	10	527966	527975	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015660	TGAAG	2	10	528186	528195	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015660	ACAGA	2	10	529038	529047	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015660	AAGGA	2	10	529305	529314	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015660	GTTGA	2	10	529535	529544	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015660	TTTTA	2	10	534919	534928	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015660	TGTAT	2	10	535180	535189	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015660	CAAAA	2	10	536016	536025	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015660	CATTT	2	10	544234	544243	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_015660	AGAAT	2	10	555371	555380	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015660	TACTT	2	10	573349	573358	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015660	CCGTT	2	10	585270	585279	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_015660	AATAA	2	10	585407	585416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015660	CATTT	2	10	599561	599570	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015660	TCGGT	2	10	607896	607905	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015660	GAAAA	2	10	617515	617524	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015660	TAAAA	2	10	619186	619195	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015660	GAAGC	2	10	621746	621755	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_015660	AAAAT	2	10	623446	623455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015660	AATAT	2	10	633156	633165	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015660	AACTT	2	10	634512	634521	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015660	ATGGC	2	10	644038	644047	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015660	GGGCT	2	10	650635	650644	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015660	GCATG	2	10	653813	653822	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015660	GATAA	2	10	656370	656379	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015660	CTTTT	2	10	657475	657484	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015660	AGAGA	2	10	661079	661088	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015660	TCGTG	2	10	662696	662705	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015660	GTAGT	2	10	667170	667179	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015660	AGCAT	2	10	669269	669278	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015660	AAACA	2	10	670104	670113	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015660	AATAA	2	10	675042	675051	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015660	TTACA	2	10	675155	675164	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015660	CTTTA	2	10	675190	675199	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015660	GGAAA	2	10	683721	683730	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015660	ACGAA	2	10	683793	683802	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015660	TTGGA	2	10	684111	684120	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015660	AACTT	2	10	685045	685054	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015660	GGAAA	2	10	685143	685152	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015660	AAGAA	2	10	685173	685182	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015660	TAGAT	2	10	692244	692253	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015660	TCTTT	2	10	697557	697566	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_015660	TTTTG	2	10	699204	699213	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015660	ATACA	2	10	700138	700147	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015660	ATTAT	2	10	702173	702182	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015660	TAGAT	2	10	704429	704438	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015660	GATGC	2	10	707698	707707	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015660	TATCA	2	10	735467	735476	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_015660	TAAAA	2	10	736201	736210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015660	TATCA	2	10	758562	758571	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015660	TTTTA	2	10	759095	759104	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015660	ATGTT	2	10	759114	759123	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015660	AATAC	2	10	759769	759778	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_015660	GTATT	2	10	759807	759816	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015660	CCTTT	2	10	788453	788462	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_015660	TTTCT	2	10	792789	792798	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_015660	AGGGA	2	10	798792	798801	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015660	TAATA	2	10	806475	806484	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015660	TTGGA	2	10	806519	806528	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015660	TAAAA	2	10	833122	833131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015660	ATTTT	2	10	833314	833323	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015660	GTTCA	2	10	838687	838696	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_015660	AGTAA	2	10	858537	858546	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015660	AGACA	2	10	858547	858556	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_015660	GGCAA	2	10	859526	859535	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
151	NC_015660	ATGAT	2	10	888984	888993	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015660	ATTCG	2	10	893556	893565	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
153	NC_015660	AGCAG	2	10	900428	900437	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
154	NC_015660	TATAA	2	10	901991	902000	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015660	AGAGG	2	10	902399	902408	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015660	TAAAA	2	10	924193	924202	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015660	AGGGA	2	10	932903	932912	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015660	CCTTT	2	10	936471	936480	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
159	NC_015660	AGGGA	2	10	936489	936498	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015660	CGATT	2	10	941814	941823	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
161	NC_015660	TGTTT	2	10	943708	943717	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015660	TATAA	2	10	963486	963495	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015660	TTTGC	2	10	981066	981075	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
164	NC_015660	CTTTT	2	10	988106	988115	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
165	NC_015660	TTTTC	2	10	1011112	1011121	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_015660	GTTTT	2	10	1013033	1013042	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015660	ATGGA	2	10	1022718	1022727	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
168	NC_015660	CAGGC	2	10	1022884	1022893	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
169	NC_015660	ATAAA	2	10	1023286	1023295	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015660	TAATG	2	10	1026489	1026498	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015660	ATTTT	2	10	1045612	1045621	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_015660	AAACA	2	10	1071222	1071231	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
173	NC_015660	TAAAA	2	10	1071819	1071828	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_015660	CTTTT	2	10	1078875	1078884	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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176	NC_015660	GTATA	2	10	1105248	1105257	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_015660	TTTTC	2	10	1148141	1148150	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
182	NC_015660	TAAAA	2	10	1152434	1152443	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_015660	GAGAA	2	10	1157896	1157905	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
184	NC_015660	ATGAA	2	10	1159119	1159128	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_015660	GAGAG	2	10	1170602	1170611	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
186	NC_015660	CATCG	2	10	1171414	1171423	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
187	NC_015660	AAAAG	2	10	1172843	1172852	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
188	NC_015660	TTCTT	2	10	1182789	1182798	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_015660	TTAGT	2	10	1201973	1201982	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
192	NC_015660	TAATG	2	10	1201991	1202000	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_015660	ATGTC	2	10	1202144	1202153	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
194	NC_015660	AAGCA	2	10	1203991	1204000	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
195	NC_015660	GGTAA	2	10	1205129	1205138	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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212	NC_015660	ATAAA	2	10	1374491	1374500	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_015660	TCCTT	2	10	1693439	1693448	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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285	NC_015660	GAATG	2	10	1760576	1760585	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_015660	AATAA	2	10	2290748	2290757	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_015660	CCTTG	2	10	2340441	2340450	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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462	NC_015660	TTTCT	2	10	2401140	2401149	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
463	NC_015660	TGTTT	2	10	2401609	2401618	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_015660	TGTTT	2	10	2433694	2433703	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
477	NC_015660	ATGAA	2	10	2434573	2434582	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_015660	TACCA	2	10	2448524	2448533	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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500	NC_015660	CCCTT	2	10	2519986	2519995	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding

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