MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Glaciecola sp. 4H-3-7+YE-5 plasmid pGLAAG01

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015498	ATTT	2	8	1084	1091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015498	AAAG	2	8	1382	1389	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015498	GCAC	2	8	7200	7207	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015498	TTGG	2	8	10838	10845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015498	TTTA	2	8	11943	11950	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015498	GATA	2	8	12793	12800	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015498	TTGA	2	8	14889	14896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015498	GATT	2	8	14926	14933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015498	AGGC	2	8	17168	17175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015498	TTCC	2	8	17878	17885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015498	CAAG	2	8	20843	20850	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015498	ATTT	2	8	21205	21212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015498	TTGC	2	8	21325	21332	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015498	CAGT	2	8	21337	21344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015498	TAAA	2	8	21355	21362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015498	TAAC	2	8	24189	24196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015498	GATT	2	8	24794	24801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015498	AAAG	2	8	24864	24871	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015498	ACCA	2	8	26380	26387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015498	CCCA	2	8	27478	27485	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_015498	CGCT	2	8	28140	28147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015498	TAAA	2	8	30440	30447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015498	TTGC	2	8	30619	30626	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015498	TTGC	2	8	30639	30646	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015498	TAGG	2	8	31875	31882	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015498	CAGC	2	8	32011	32018	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015498	ATCA	2	8	47987	47994	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015498	TGAA	2	8	50478	50485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015498	TGAG	2	8	65254	65261	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015498	GCCT	2	8	72510	72517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015498	CAAT	2	8	72556	72563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015498	TATT	2	8	87973	87980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015498	AATT	2	8	103067	103074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015498	AAAC	2	8	103110	103117	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015498	TGAC	2	8	104271	104278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015498	AACA	2	8	104847	104854	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015498	GCTG	2	8	104894	104901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015498	TCAC	2	8	105412	105419	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015498	CATA	2	8	105436	105443	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015498	GTTA	2	8	105787	105794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015498	CTCG	2	8	106891	106898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015498	TCAC	2	8	107287	107294	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015498	TGAT	2	8	107962	107969	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015498	ACGG	2	8	108502	108509	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015498	TCGT	2	8	108523	108530	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015498	TCCG	2	8	108555	108562	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015498	ATTT	2	8	112209	112216	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015498	TTCG	2	8	112450	112457	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015498	GAAG	2	8	112596	112603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015498	AATT	2	8	114227	114234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015498	TCAA	2	8	114267	114274	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015498	AAAT	2	8	115671	115678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015498	TTGG	2	8	117122	117129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015498	AGAT	2	8	117367	117374	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015498	TTAA	2	8	117627	117634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015498	CAAA	2	8	120365	120372	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015498	GTAA	2	8	120726	120733	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015498	GCTT	2	8	120862	120869	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015498	TGGC	2	8	121070	121077	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015498	GATA	2	8	124841	124848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015498	GGTT	2	8	124907	124914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015498	GTAA	2	8	124953	124960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015498	CATT	2	8	131956	131963	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015498	CTTC	2	8	132292	132299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015498	CCGG	2	8	132475	132482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015498	CGTT	2	8	137064	137071	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015498	CAAG	2	8	142247	142254	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015498	CCGG	2	8	143280	143287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015498	AGTT	2	8	145582	145589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015498	TTTA	2	8	146088	146095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015498	TAAT	2	8	146213	146220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015498	CATT	2	8	146322	146329	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015498	ATAG	2	8	149566	149573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015498	ATCT	2	8	152309	152316	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015498	TACT	2	8	154948	154955	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015498	TGAC	2	8	155074	155081	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015498	TAAT	2	8	165098	165105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015498	TTTA	2	8	168362	168369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015498	ACTG	2	8	174111	174118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015498	ATCA	2	8	174130	174137	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015498	CCTA	2	8	174380	174387	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015498	TAAG	2	8	174589	174596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015498	TTAG	2	8	174934	174941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015498	TCAC	2	8	175402	175409	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015498	ATGA	2	8	175421	175428	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015498	CCTT	2	8	176495	176502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015498	ATTT	2	8	180713	180720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015498	GTAA	2	8	182746	182753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015498	TGAT	2	8	188729	188736	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015498	ACTA	2	8	197865	197872	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015498	AATT	2	8	200358	200365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015498	TGCA	2	8	209871	209878	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015498	GTGG	2	8	209899	209906	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015498	AAAC	2	8	210243	210250	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015498	GTTA	2	8	210433	210440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015498	GTTA	2	8	210869	210876	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015498	GTAA	2	8	210959	210966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015498	TGAT	2	8	210985	210992	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015498	TGGC	2	8	211181	211188	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015498	CAAG	2	8	211268	211275	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015498	ATTA	2	8	217521	217528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015498	GTCA	2	8	217542	217549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015498	TTAT	2	8	241122	241129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015498	TATC	2	8	241144	241151	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015498	TAAA	2	8	244888	244895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015498	GTCC	2	8	244999	245006	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015498	TAAA	2	8	257680	257687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015498	GACA	2	8	258138	258145	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015498	ATCT	2	8	260708	260715	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015498	TAAT	2	8	262998	263005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015498	TGAA	2	8	265698	265705	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015498	TCGT	2	8	265816	265823	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015498	CTTA	2	8	266905	266912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015498	GCGT	2	8	267626	267633	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015498	ATAA	2	8	268119	268126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015498	TTCG	2	8	276352	276359	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015498	CCCA	2	8	276774	276781	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_015498	GATT	2	8	280426	280433	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015498	TTGG	2	8	281168	281175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015498	TCCG	2	8	281266	281273	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015498	ACTT	2	8	281629	281636	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015498	ATTG	2	8	281968	281975	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015498	AGTC	2	8	282049	282056	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015498	TTGC	2	8	282187	282194	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015498	CAAT	2	8	284035	284042	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015498	AACA	2	8	284110	284117	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015498	TACA	2	8	284531	284538	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015498	GTTA	2	8	284953	284960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015498	ATAA	2	8	285019	285026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015498	CTTT	2	8	286546	286553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015498	AACA	2	8	286584	286591	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015498	TAAT	2	8	286641	286648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015498	ACTT	2	8	287814	287821	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015498	AATT	2	8	288166	288173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015498	TGCC	2	8	289020	289027	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015498	TAGA	2	8	294420	294427	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015498	CCTG	2	8	299965	299972	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015498	CAGG	2	8	299979	299986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015498	ATTT	2	8	302121	302128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015498	TTTC	2	8	330815	330822	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015498	CCTG	2	8	334441	334448	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015498	TTGG	2	8	339882	339889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015498	CCAC	2	8	339960	339967	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.