MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Glaciecola sp. 4H-3-7+YE-5 plasmid pGLAAG01

Total Repeats: 480

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015498	TGG	2	6	65	70	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015498	GGT	2	6	101	106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015498	CGC	2	6	149	154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015498	ATT	2	6	169	174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015498	CGC	2	6	213	218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_015498	ATT	2	6	233	238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015498	CGC	2	6	277	282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_015498	ATT	2	6	297	302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015498	CGC	2	6	341	346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_015498	CGC	2	6	405	410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_015498	TTG	2	6	426	431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015498	CGC	2	6	469	474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_015498	ATT	2	6	489	494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015498	CGC	2	6	533	538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015498	ATT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015498	CGC	2	6	597	602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015498	CGC	2	6	661	666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015498	TTG	2	6	682	687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015498	TAA	2	6	785	790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015498	GTC	2	6	828	833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015498	CGC	2	6	834	839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015498	CGC	2	6	865	870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015498	ATC	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015498	GCG	2	6	1031	1036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015498	TAT	2	6	1075	1080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015498	TAA	2	6	1129	1134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015498	TTA	2	6	1176	1181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015498	CGA	2	6	1192	1197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015498	TTA	2	6	1319	1324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015498	TAC	2	6	4500	4505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015498	AGA	2	6	5525	5530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015498	TGC	2	6	7163	7168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015498	CAG	2	6	7183	7188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015498	TCA	2	6	9084	9089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015498	GTG	2	6	9582	9587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015498	CTT	2	6	9902	9907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015498	ACT	2	6	9951	9956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015498	GAA	2	6	9981	9986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015498	TTG	2	6	10772	10777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015498	GTT	2	6	10895	10900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015498	TAA	2	6	13397	13402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015498	AGG	2	6	14942	14947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015498	TAA	2	6	15322	15327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015498	TTC	2	6	15424	15429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015498	CAA	2	6	15836	15841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015498	TGG	2	6	16518	16523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015498	CAC	2	6	16541	16546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015498	CTT	2	6	17221	17226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015498	TAA	2	6	17248	17253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015498	ATT	2	6	17863	17868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015498	AAG	2	6	18981	18986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015498	GGC	2	6	18998	19003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015498	GCA	2	6	19038	19043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015498	ATG	2	6	19480	19485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015498	CTA	2	6	19610	19615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015498	TGA	2	6	19906	19911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015498	GGA	2	6	19933	19938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015498	ATA	2	6	19939	19944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015498	TTA	3	9	20058	20066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015498	AAC	2	6	21239	21244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015498	ATT	2	6	21269	21274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015498	CTC	2	6	21376	21381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015498	CAC	2	6	21500	21505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_015498	CAA	2	6	21588	21593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015498	AAT	2	6	24144	24149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015498	AAC	2	6	24579	24584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015498	CTG	2	6	24737	24742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015498	GAA	2	6	24759	24764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015498	TGA	2	6	24886	24891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015498	GGA	2	6	24920	24925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015498	TAA	2	6	24953	24958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015498	AAT	2	6	25033	25038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015498	TAT	2	6	25109	25114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015498	TGG	2	6	25126	25131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015498	GAG	2	6	25166	25171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015498	AGC	2	6	26167	26172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015498	TTG	2	6	29605	29610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015498	ATC	2	6	30122	30127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015498	CTC	2	6	30158	30163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_015498	TGT	2	6	30384	30389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015498	GAT	2	6	30595	30600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015498	CAG	2	6	30633	30638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015498	CAG	2	6	30653	30658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015498	GAT	2	6	30708	30713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015498	TTG	2	6	30729	30734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015498	CAA	2	6	31733	31738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015498	ATA	2	6	31836	31841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015498	CAT	2	6	31942	31947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015498	TGA	2	6	31989	31994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015498	TGA	2	6	32002	32007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015498	GGT	2	6	32123	32128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015498	GAT	2	6	32193	32198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015498	GTT	2	6	32207	32212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015498	TCT	2	6	34716	34721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015498	TAC	2	6	34902	34907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015498	ACT	3	9	35659	35667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015498	CAA	2	6	35678	35683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015498	ACT	2	6	35709	35714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015498	TAT	2	6	47943	47948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015498	GTT	2	6	48143	48148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015498	GCA	2	6	48226	48231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015498	TTA	2	6	50341	50346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015498	TCG	2	6	50432	50437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015498	CAG	2	6	50445	50450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015498	TTA	2	6	50470	50475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015498	TAG	2	6	53186	53191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015498	AAT	2	6	53247	53252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015498	AAG	2	6	53287	53292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015498	ATT	2	6	55542	55547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015498	TTG	2	6	59231	59236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015498	GGA	2	6	59287	59292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015498	CAT	2	6	63613	63618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015498	TAA	2	6	63620	63625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015498	TTG	2	6	65171	65176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015498	GAC	2	6	65287	65292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015498	TAT	2	6	65371	65376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015498	CTA	2	6	66839	66844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015498	GTA	2	6	66867	66872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015498	TAC	2	6	66887	66892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015498	ACC	2	6	72543	72548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_015498	CCA	2	6	88024	88029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015498	TAG	2	6	97012	97017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015498	TCC	2	6	98940	98945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_015498	GTA	2	6	102542	102547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015498	CTG	2	6	102852	102857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015498	ATA	2	6	102976	102981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015498	TCA	2	6	102985	102990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015498	CCA	2	6	103014	103019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_015498	TCC	2	6	103058	103063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015498	TTA	2	6	103177	103182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015498	ATC	2	6	104171	104176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015498	CTT	2	6	104317	104322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015498	ATT	2	6	104356	104361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015498	AGC	2	6	104579	104584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015498	GGC	2	6	105447	105452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015498	GTT	2	6	105510	105515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015498	GTA	2	6	105593	105598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015498	TCA	2	6	105698	105703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015498	CAT	2	6	105942	105947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015498	TAA	2	6	106018	106023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015498	GGC	2	6	106507	106512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.