MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Gallibacterium anatis UMN179 plasmid pUMN179

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015461	T	6	6	1033	1038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015461	TGA	2	6	1066	1071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015461	T	6	6	1084	1089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015461	A	7	7	1094	1100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015461	AAC	2	6	1144	1149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015461	TCT	2	6	1775	1780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015461	AGT	2	6	1792	1797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015461	CAA	2	6	1876	1881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015461	TGA	2	6	1882	1887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015461	AGAT	2	8	1926	1933	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015461	TC	3	6	1937	1942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015461	A	6	6	1953	1958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015461	GAT	2	6	2062	2067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015461	A	6	6	2079	2084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015461	TAA	2	6	2097	2102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015461	ACC	2	6	2122	2127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015461	TCTT	2	8	2137	2144	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015461	GAA	2	6	2152	2157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015461	A	8	8	4171	4178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015461	TCTA	2	8	4198	4205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015461	TAA	2	6	4206	4211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015461	GCTC	2	8	4516	4523	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015461	CAG	2	6	4591	4596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015461	T	7	7	4640	4646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015461	TCA	2	6	4657	4662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015461	A	6	6	4686	4691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015461	TAA	2	6	4692	4697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015461	A	6	6	4704	4709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015461	T	6	6	4738	4743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015461	TGA	2	6	5636	5641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015461	AATT	2	8	5649	5656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015461	TTAG	2	8	5677	5684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015461	TAA	3	9	5697	5705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015461	ATT	2	6	5754	5759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015461	AT	3	6	5780	5785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015461	AG	3	6	5816	5821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015461	ATTAC	2	10	5829	5838	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015461	GAC	2	6	5970	5975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015461	CAA	2	6	6033	6038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015461	TAG	2	6	6121	6126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015461	AAT	2	6	6212	6217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015461	A	6	6	6236	6241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015461	T	6	6	6248	6253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015461	TTA	2	6	6292	6297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015461	CGAA	2	8	6322	6329	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015461	A	6	6	6417	6422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015461	AT	3	6	6433	6438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015461	T	6	6	6479	6484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015461	A	6	6	6509	6514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015461	A	7	7	6526	6532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015461	TTCT	2	8	6558	6565	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015461	TCTT	4	16	6566	6581	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015461	GTA	2	6	6633	6638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015461	GTA	2	6	6655	6660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015461	GTA	2	6	6677	6682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015461	GTA	2	6	6699	6704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015461	TA	3	6	6713	6718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015461	TAT	2	6	6723	6728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015461	TAA	2	6	6750	6755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015461	ATTA	2	8	6759	6766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015461	ATC	2	6	6774	6779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.