MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Granulicella tundricola plasmid pACIX901

Total Repeats: 198

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015057	TCAA	2	8	8016	8023	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015057	TTGC	2	8	23821	23828	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015057	GGAT	2	8	37443	37450	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015057	TGGG	2	8	37481	37488	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015057	GCGG	2	8	37512	37519	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015057	TGAA	2	8	37835	37842	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015057	GGCC	2	8	37924	37931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015057	GGGT	2	8	49587	49594	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015057	TAGG	2	8	62788	62795	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015057	GTCG	2	8	65364	65371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015057	CGGG	2	8	70770	70777	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015057	GGCA	2	8	70981	70988	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015057	TGCA	2	8	74945	74952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015057	GCAC	2	8	76130	76137	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015057	CCTT	2	8	79009	79016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015057	GCGG	2	8	83366	83373	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015057	TCAA	2	8	88189	88196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015057	ATAC	2	8	88608	88615	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015057	CCGA	2	8	89211	89218	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015057	GCGT	2	8	89641	89648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015057	AAGT	2	8	89760	89767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015057	TCGA	2	8	90474	90481	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015057	ACGA	2	8	90786	90793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015057	GGCA	2	8	96497	96504	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015057	AGGC	2	8	96549	96556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015057	GGCC	2	8	96618	96625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015057	GCAA	2	8	96627	96634	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015057	TGGT	2	8	96771	96778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015057	CCAG	2	8	97056	97063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015057	CGCA	2	8	97502	97509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015057	CGCA	2	8	97632	97639	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015057	GCCA	2	8	97741	97748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015057	CTGG	2	8	97791	97798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015057	GATG	2	8	98429	98436	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015057	CCTG	2	8	98919	98926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015057	GTTC	2	8	99054	99061	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015057	CTGG	2	8	99433	99440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015057	CTCA	2	8	100567	100574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015057	TTAC	2	8	100940	100947	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015057	CAGT	2	8	102298	102305	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015057	TGGC	2	8	102693	102700	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015057	ATCG	2	8	112536	112543	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015057	CGAT	2	8	112763	112770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015057	ATTG	2	8	114934	114941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015057	CGTG	2	8	115620	115627	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015057	TGGC	2	8	115883	115890	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015057	ATCG	2	8	116085	116092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015057	GTGG	2	8	118401	118408	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015057	TGCG	2	8	118694	118701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015057	CTGC	2	8	122434	122441	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015057	CTGC	2	8	126561	126568	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015057	ACGG	2	8	129284	129291	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015057	GCCA	2	8	145371	145378	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015057	CCCT	2	8	147732	147739	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_015057	CGCC	2	8	147936	147943	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_015057	CCCA	2	8	149119	149126	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_015057	CAAA	2	8	149432	149439	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015057	CGCC	2	8	149873	149880	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_015057	CACC	2	8	150320	150327	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_015057	CCGC	2	8	151951	151958	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_015057	TGGT	2	8	152046	152053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015057	GAAA	2	8	152443	152450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015057	GATC	2	8	152883	152890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015057	CGGG	2	8	164089	164096	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015057	AGGG	2	8	164323	164330	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015057	CAGG	2	8	165547	165554	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015057	GGAG	2	8	170158	170165	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015057	TCGG	2	8	172903	172910	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015057	GGGA	2	8	176272	176279	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015057	GATC	2	8	182027	182034	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015057	ACCC	2	8	182038	182045	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_015057	TCCG	2	8	193586	193593	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015057	TTGC	2	8	195499	195506	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015057	GAAT	2	8	195855	195862	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015057	CGAT	2	8	198716	198723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015057	GAAC	2	8	199065	199072	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015057	ACTT	2	8	216566	216573	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015057	TATT	2	8	216595	216602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015057	AAGT	2	8	226551	226558	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015057	CCTG	2	8	229933	229940	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015057	ATTC	2	8	230094	230101	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015057	ATTC	2	8	230135	230142	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015057	TGAT	2	8	230494	230501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015057	CTTC	2	8	230718	230725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015057	GCGG	2	8	233573	233580	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015057	GATT	2	8	233754	233761	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015057	TCCA	2	8	235982	235989	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015057	TCAC	2	8	236124	236131	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015057	CTTT	2	8	236285	236292	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015057	CGGG	2	8	243663	243670	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015057	TCCA	2	8	243706	243713	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015057	TTTG	2	8	243748	243755	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015057	TTGG	2	8	243796	243803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015057	TTGA	2	8	245399	245406	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015057	GTGG	2	8	250175	250182	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015057	AGGC	2	8	250687	250694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015057	GGGC	2	8	250775	250782	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015057	GGCG	2	8	250866	250873	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015057	GTTG	2	8	251223	251230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015057	TGGG	2	8	251249	251256	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015057	GATT	2	8	252302	252309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015057	TTTA	2	8	259779	259786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015057	CCAT	2	8	259926	259933	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015057	TTCA	2	8	270975	270982	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015057	GCTT	2	8	274802	274809	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015057	GGCG	2	8	278546	278553	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015057	GTTT	2	8	278793	278800	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015057	AAGT	2	8	285418	285425	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015057	GTTT	2	8	285446	285453	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015057	CTTG	2	8	285829	285836	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015057	CCAT	2	8	288218	288225	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015057	CCTT	2	8	288309	288316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015057	AGGC	2	8	290773	290780	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015057	TGGG	2	8	292029	292036	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015057	TTCG	2	8	296709	296716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015057	AAGG	2	8	301901	301908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015057	GTGG	2	8	303261	303268	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015057	TGAG	2	8	306094	306101	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015057	GATC	2	8	306150	306157	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015057	CCTG	2	8	310649	310656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015057	TTGC	2	8	314358	314365	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015057	CTTA	2	8	316024	316031	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015057	CTTC	2	8	332926	332933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015057	CCGC	2	8	333152	333159	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_015057	CCAC	2	8	333514	333521	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
126	NC_015057	AGCA	2	8	333867	333874	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015057	GTTC	2	8	334014	334021	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015057	ACGC	2	8	334656	334663	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015057	GCTG	2	8	335392	335399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015057	GCAG	2	8	335572	335579	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015057	GACC	2	8	335697	335704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015057	ACCC	2	8	335793	335800	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_015057	CGAC	2	8	335934	335941	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015057	TCCA	2	8	336058	336065	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015057	GCTG	2	8	336133	336140	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015057	GATC	2	8	336565	336572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015057	TGCC	2	8	336580	336587	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015057	TCGT	2	8	336707	336714	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015057	CTGT	2	8	336803	336810	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015057	TCCG	2	8	343333	343340	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015057	ATCT	2	8	346031	346038	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015057	CACG	2	8	348919	348926	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015057	GCTT	2	8	354291	354298	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015057	CATC	2	8	354428	354435	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015057	ATCG	2	8	354704	354711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015057	TCGC	2	8	354819	354826	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015057	CGAA	2	8	355031	355038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015057	TTTA	2	8	355131	355138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015057	GTAC	2	8	356799	356806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015057	CCCG	2	8	361645	361652	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
151	NC_015057	TCGT	2	8	361733	361740	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_015057	CTCG	2	8	361864	361871	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_015057	CCGA	2	8	364492	364499	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_015057	GAAA	2	8	364655	364662	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015057	TACA	2	8	364668	364675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_015057	CTTT	2	8	373641	373648	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
157	NC_015057	AAGT	2	8	373796	373803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015057	TTGT	2	8	375796	375803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015057	TCCT	2	8	381309	381316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_015057	GAGG	2	8	384080	384087	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015057	TAGA	2	8	384211	384218	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015057	CAAG	2	8	396903	396910	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
163	NC_015057	GGTT	2	8	396938	396945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015057	GTAG	2	8	397060	397067	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015057	GAAG	2	8	407988	407995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015057	TCCG	2	8	408547	408554	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
167	NC_015057	CAGC	2	8	410038	410045	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
168	NC_015057	AAGA	2	8	412038	412045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
169	NC_015057	CAGC	2	8	421586	421593	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
170	NC_015057	TGAC	2	8	427851	427858	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
171	NC_015057	CTGC	2	8	432952	432959	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
172	NC_015057	TGAG	2	8	433097	433104	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_015057	CGAG	2	8	434501	434508	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
174	NC_015057	TAGC	2	8	434552	434559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
175	NC_015057	CGAC	2	8	434643	434650	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
176	NC_015057	TGCC	2	8	434818	434825	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
177	NC_015057	GAAC	2	8	436192	436199	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
178	NC_015057	CCGT	2	8	436218	436225	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
179	NC_015057	CCGA	2	8	436444	436451	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
180	NC_015057	CCCA	2	8	437266	437273	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
181	NC_015057	TTGT	2	8	437615	437622	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_015057	CGAA	2	8	437848	437855	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
183	NC_015057	CCGC	2	8	437920	437927	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
184	NC_015057	AGCA	2	8	439070	439077	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
185	NC_015057	CGGA	2	8	441180	441187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
186	NC_015057	CATA	2	8	441814	441821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
187	NC_015057	CAAC	2	8	448846	448853	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
188	NC_015057	CAAC	2	8	449413	449420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
189	NC_015057	AGCA	2	8	450080	450087	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
190	NC_015057	ATTT	2	8	450114	450121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_015057	CAAT	2	8	450404	450411	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
192	NC_015057	GTCC	2	8	463278	463285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
193	NC_015057	GAAT	2	8	465099	465106	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
194	NC_015057	GTAA	2	8	465178	465185	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
195	NC_015057	ATTT	2	8	465320	465327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_015057	GAAT	2	8	465354	465361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
197	NC_015057	CGTT	2	8	465369	465376	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
198	NC_015057	GAAT	2	8	465395	465402	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.