MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus sp. Y4.1MC1 plasmid pGY4MC101

Total Repeats: 297

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014651	TTG	2	6	210	215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014651	TGT	2	6	233	238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014651	TGT	2	6	255	260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014651	TTG	2	6	276	281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014651	TGT	2	6	299	304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014651	GCC	2	6	326	331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_014651	AAG	2	6	486	491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014651	CCG	2	6	1060	1065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_014651	GTC	2	6	1097	1102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014651	TTC	2	6	1883	1888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014651	CAA	2	6	1891	1896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014651	ATT	2	6	2038	2043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014651	CCA	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_014651	CTT	2	6	2153	2158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014651	CCT	2	6	3801	3806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_014651	TAA	2	6	3821	3826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014651	AGT	2	6	3828	3833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014651	ATA	2	6	6472	6477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014651	GAG	2	6	6675	6680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014651	AGC	2	6	7513	7518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014651	CAG	2	6	7543	7548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014651	TGA	2	6	7573	7578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014651	ATT	2	6	10412	10417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014651	AGG	2	6	10426	10431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014651	GCG	2	6	10543	10548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014651	TGC	2	6	10553	10558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014651	GGC	2	6	10568	10573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014651	CAA	2	6	10618	10623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014651	GCC	2	6	10648	10653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_014651	AGG	2	6	10666	10671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014651	AGG	2	6	12518	12523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014651	TAT	2	6	17422	17427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014651	ATA	2	6	17443	17448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014651	TAA	2	6	17738	17743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014651	GGT	2	6	17780	17785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014651	TAA	2	6	19401	19406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014651	CAA	2	6	19427	19432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014651	AGG	2	6	19533	19538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014651	TGA	2	6	19633	19638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014651	TTA	2	6	19682	19687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014651	GAA	2	6	19762	19767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014651	ATG	2	6	19838	19843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014651	CCA	2	6	19925	19930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_014651	AAT	2	6	19974	19979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014651	CTT	2	6	20060	20065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014651	TTC	2	6	20363	20368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014651	AAT	2	6	20490	20495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014651	TCA	2	6	20510	20515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014651	TCG	2	6	20561	20566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014651	TCT	2	6	20577	20582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014651	TCT	2	6	20651	20656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014651	GGC	2	6	20736	20741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014651	TGA	2	6	20807	20812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014651	AGA	2	6	20931	20936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014651	GAA	2	6	20948	20953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014651	AAG	2	6	20954	20959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014651	TTG	2	6	20998	21003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014651	AGC	2	6	21050	21055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014651	GCA	2	6	21136	21141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014651	GCG	2	6	21143	21148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014651	GCA	2	6	21158	21163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014651	CTT	2	6	22275	22280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014651	TTC	2	6	22281	22286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014651	TCT	2	6	22358	22363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014651	TAA	2	6	23978	23983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014651	ATT	2	6	24001	24006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014651	AGG	2	6	24090	24095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014651	CAA	3	9	26641	26649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014651	AGG	2	6	26672	26677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014651	CTT	2	6	30690	30695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014651	GCG	2	6	30785	30790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014651	ATG	2	6	31575	31580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014651	AGG	2	6	32262	32267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014651	GGA	2	6	32268	32273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014651	CTT	2	6	32859	32864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014651	ATC	2	6	32869	32874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014651	CTT	2	6	33013	33018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014651	AGG	2	6	33022	33027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014651	TAT	2	6	33096	33101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014651	GTT	2	6	33117	33122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014651	ACC	2	6	33129	33134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_014651	AAC	2	6	33137	33142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014651	GCG	2	6	33280	33285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014651	AGG	2	6	33349	33354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014651	CTT	2	6	34100	34105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014651	ACA	2	6	34178	34183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014651	TTC	2	6	34217	34222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014651	TTC	2	6	34225	34230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014651	GAA	2	6	34329	34334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014651	TCC	2	6	34676	34681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014651	TGT	2	6	34745	34750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014651	ATT	2	6	34856	34861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014651	TAT	2	6	34896	34901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014651	GGA	2	6	35082	35087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014651	GCC	2	6	35099	35104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_014651	GCA	2	6	35111	35116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014651	AAT	3	9	35121	35129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014651	AGA	2	6	35188	35193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014651	GAC	2	6	35229	35234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014651	ACG	2	6	35575	35580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014651	TGG	2	6	35611	35616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014651	AAG	2	6	35720	35725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014651	GCC	2	6	35883	35888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_014651	CAA	2	6	35920	35925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014651	GCG	2	6	36102	36107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014651	GAT	2	6	36193	36198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014651	TTC	2	6	36317	36322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014651	TTC	2	6	36325	36330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014651	AAC	2	6	36349	36354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014651	AAG	2	6	36366	36371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014651	GGC	2	6	36381	36386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014651	ATT	2	6	36496	36501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014651	GCC	2	6	36851	36856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_014651	TGG	2	6	36873	36878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014651	AAC	2	6	36896	36901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014651	GAA	2	6	36914	36919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014651	AAC	2	6	36920	36925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014651	GAA	2	6	36938	36943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014651	AAG	2	6	36944	36949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014651	GGC	2	6	37031	37036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014651	GTT	2	6	37156	37161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014651	ATT	2	6	37192	37197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014651	ATT	2	6	37261	37266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014651	ATT	2	6	37270	37275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014651	CAA	2	6	37373	37378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014651	ATT	2	6	37402	37407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014651	CGT	2	6	37463	37468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014651	ATT	2	6	37672	37677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014651	CTG	2	6	37798	37803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014651	AGG	2	6	37828	37833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014651	AAG	2	6	38606	38611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014651	GAT	2	6	38688	38693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014651	TCC	2	6	38720	38725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_014651	GTT	2	6	38754	38759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014651	TCT	2	6	39073	39078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014651	TCT	2	6	39087	39092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014651	GGC	2	6	39116	39121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014651	AGC	2	6	39179	39184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014651	AAG	2	6	39188	39193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014651	AGC	2	6	39218	39223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014651	GAA	2	6	39240	39245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014651	GTA	2	6	39292	39297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014651	GAG	2	6	39332	39337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014651	GCC	2	6	39396	39401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_014651	GAA	2	6	39620	39625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014651	TCA	2	6	39909	39914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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148	NC_014651	TGC	2	6	40024	40029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014651	GTC	2	6	40038	40043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014651	GAA	2	6	40116	40121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014651	GCG	2	6	40187	40192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_014651	ACA	2	6	40237	40242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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154	NC_014651	GGC	2	6	40500	40505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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173	NC_014651	TAA	2	6	43078	43083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_014651	TTA	2	6	43084	43089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_014651	GAT	2	6	64641	64646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_014651	ATG	2	6	66762	66767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_014651	GGA	2	6	69197	69202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
282	NC_014651	ATT	2	6	69209	69214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_014651	ATG	2	6	69251	69256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_014651	AAT	2	6	69452	69457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_014651	CCG	2	6	69601	69606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_014651	GCG	2	6	69611	69616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_014651	TTG	2	6	69846	69851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_014651	CAA	2	6	69945	69950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_014651	ATG	2	6	69998	70003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_014651	TCA	2	6	70140	70145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_014651	CTT	2	6	70162	70167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_014651	CTT	2	6	70202	70207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_014651	CTT	2	6	70233	70238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_014651	CAT	2	6	70242	70247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_014651	GCG	2	6	70300	70305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_014651	GAA	2	6	70353	70358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
297	NC_014651	TAT	2	6	71596	71601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.