MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus sp. Y4.1MC1 chromosome

Total Repeats: 272

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014650	TTTTAT	2	12	1898	1909	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014650	GCTGAA	2	12	10613	10624	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014650	TGCGTC	2	12	12563	12574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014650	ATTTTT	2	12	23498	23509	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014650	AGAAAA	2	12	24891	24902	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014650	TTCTAT	2	12	27161	27172	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014650	AAGAAA	2	12	37853	37864	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014650	TTTTTG	2	12	52698	52709	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014650	ATTCTA	2	12	58276	58287	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014650	GATGTT	2	12	63528	63539	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014650	AAGAAA	2	12	72123	72134	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014650	GTCTGC	2	12	92931	92942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014650	TGCGTC	2	12	99045	99056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014650	AGTCAA	2	12	102553	102564	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014650	GTTTGC	2	12	134378	134389	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014650	TGAAAA	2	12	134428	134439	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014650	CCCTTA	2	12	156902	156913	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014650	TGCGTC	2	12	160764	160775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014650	TAAAAA	2	12	173835	173846	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014650	TCTTTT	2	12	175444	175455	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014650	TGTTAT	2	12	179332	179343	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014650	ATGATA	2	12	181480	181491	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014650	TTTACG	2	12	193996	194007	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014650	GCTTCC	2	12	233231	233242	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014650	GAAAAG	2	12	233542	233553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014650	GAAAAG	2	12	245449	245460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014650	AAGAAA	2	12	247331	247342	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014650	TGTTTC	2	12	310915	310926	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014650	GGAAAT	2	12	331122	331133	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014650	CGAAGG	2	12	333793	333804	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014650	GAACGA	2	12	335411	335422	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014650	CATTTC	2	12	336038	336049	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014650	TAATGA	2	12	366997	367008	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014650	TTGTTC	2	12	381096	381107	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014650	CAAATT	2	12	403658	403669	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014650	TAAAAT	2	12	409193	409204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014650	AGTCCA	2	12	431850	431861	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014650	TTTTAT	2	12	439364	439375	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014650	GGGGAG	2	12	450933	450944	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014650	GAAAAA	2	12	467653	467664	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014650	GAGAAA	2	12	469791	469802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014650	GGTTAG	2	12	489799	489810	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014650	AGCATT	2	12	493325	493336	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014650	CTGGAA	2	12	494157	494168	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014650	GGAGAG	2	12	494263	494274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014650	AAAATA	2	12	501065	501076	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014650	ATAATT	2	12	515601	515612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014650	TTTCTT	2	12	523286	523297	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014650	ATATTT	2	12	527014	527025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014650	AAAAAG	2	12	545131	545142	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014650	TTTGGC	2	12	546750	546761	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014650	ATAATG	2	12	579934	579945	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014650	AAAAGG	2	12	581400	581411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014650	GCAAAA	2	12	598987	598998	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014650	CTTTTT	2	12	599758	599769	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014650	AAAAAT	2	12	606465	606476	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014650	TCAGGA	2	12	617823	617834	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014650	GAAAAA	2	12	625842	625853	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014650	ATCCCC	2	12	637937	637948	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_014650	TTTTAT	2	12	653123	653134	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014650	GCTGAA	2	12	653520	653531	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014650	TATTTT	2	12	663387	663398	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014650	AGCGAT	2	12	667708	667719	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014650	AAGAGC	2	12	668166	668177	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014650	TTATAG	2	12	668344	668355	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014650	TATGAA	2	12	682114	682125	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014650	TATTTT	2	12	684764	684775	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014650	GAAGGG	2	12	685671	685682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014650	CCAAAA	2	12	699135	699146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014650	TGTTTT	2	12	717439	717450	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014650	GCGGAA	2	12	734949	734960	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014650	AACGCA	2	12	748825	748836	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014650	TCAATA	2	12	813212	813223	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014650	CTTCTA	2	12	835246	835257	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014650	AATAAA	2	12	880633	880644	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014650	TTTATA	2	12	886295	886306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014650	ATCATT	2	12	895373	895384	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014650	TTTATA	2	12	900439	900450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014650	AATGGA	2	12	902646	902657	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014650	TGTTCC	2	12	911236	911247	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014650	CAACGA	2	12	911296	911307	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014650	GAGTCT	2	12	970012	970023	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014650	AATGGG	2	12	992121	992132	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014650	ACTTGT	2	12	1004585	1004596	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014650	CTGTTT	2	12	1011026	1011037	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014650	ATTCAA	2	12	1021356	1021367	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014650	ATATAA	2	12	1029962	1029973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014650	GAAAAA	2	12	1056048	1056059	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014650	ACATTG	2	12	1063834	1063845	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014650	AAAGTC	2	12	1067596	1067607	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014650	AAACAG	2	12	1138122	1138133	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014650	AAAATG	2	12	1141159	1141170	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014650	TAAAAA	2	12	1148219	1148230	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014650	AAGGGC	2	12	1197841	1197852	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014650	TTGCAT	2	12	1285869	1285880	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014650	TTACAA	2	12	1286366	1286377	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014650	TCATAT	2	12	1315707	1315718	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014650	AAAGAG	2	12	1412803	1412814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014650	TATAAA	2	12	1421054	1421065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014650	CCATGT	2	12	1490235	1490246	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014650	CATAAA	2	12	1495632	1495643	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014650	CCTTTA	2	12	1513615	1513626	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014650	GGAAAT	2	12	1515180	1515191	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014650	GAAAGA	2	12	1516801	1516812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014650	CATAAA	2	12	1524473	1524484	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014650	AACGTA	2	12	1533348	1533359	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014650	TGAAAA	2	12	1549607	1549618	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014650	TGCTTG	2	12	1561765	1561776	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014650	AGATAA	2	12	1590427	1590438	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014650	CTAACA	2	12	1592338	1592349	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014650	TTTCTT	2	12	1628483	1628494	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014650	GGGAGA	2	12	1635752	1635763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014650	TTTCTT	2	12	1667997	1668008	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014650	GTTTTC	2	12	1690600	1690611	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014650	TTTCAA	2	12	1702646	1702657	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_014650	TTGTTT	2	12	1703630	1703641	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014650	TTTCCG	2	12	1762745	1762756	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014650	TGGAGA	2	12	1763111	1763122	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014650	GGAACG	2	12	1764983	1764994	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014650	TGGACG	2	12	1809458	1809469	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014650	CGGCTA	2	12	1809587	1809598	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014650	AATGGA	2	12	1810357	1810368	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014650	TTCATA	2	12	1819317	1819328	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014650	ATAAAA	2	12	1821806	1821817	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014650	GTTGGC	2	12	1857979	1857990	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014650	TAATTT	2	12	1859608	1859619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014650	CTAATG	2	12	1859869	1859880	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_014650	CAAAGG	2	12	1871736	1871747	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014650	AAAGAT	2	12	1899333	1899344	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014650	AGGAAA	2	12	1899908	1899919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.