MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Gallionella capsiferriformans ES-2 chromosome

Total Repeats: 225

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014394	CAAAT	2	10	12876	12885	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014394	TAATG	2	10	22034	22043	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014394	AATTA	2	10	30103	30112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014394	TAATC	2	10	42269	42278	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014394	AAGGG	2	10	105120	105129	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014394	CTGAG	2	10	120499	120508	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014394	GTAGG	2	10	153686	153695	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014394	GCTAA	2	10	153906	153915	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014394	GAGCG	2	10	204713	204722	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014394	GCCGC	2	10	206060	206069	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_014394	TTTGA	2	10	206104	206113	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014394	TCGTG	2	10	215106	215115	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014394	TTTAA	2	10	215618	215627	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014394	TCGTG	2	10	253952	253961	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014394	TTTAA	2	10	254464	254473	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014394	AAGGT	2	10	265219	265228	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014394	AAATT	2	10	271436	271445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014394	TGAAG	2	10	321660	321669	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014394	TTAAA	2	10	324318	324327	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014394	GAAGC	2	10	346210	346219	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014394	ATTTT	2	10	370509	370518	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014394	TTTTG	2	10	400203	400212	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014394	ATCGC	2	10	402879	402888	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_014394	ATGAA	2	10	436189	436198	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014394	CGAAG	2	10	436375	436384	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014394	GGCTG	2	10	439849	439858	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014394	AATGA	2	10	463154	463163	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014394	AAAAT	2	10	481043	481052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014394	GCGAG	2	10	482553	482562	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014394	TGTCA	2	10	502933	502942	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014394	AATTA	2	10	524830	524839	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014394	AATAT	2	10	532829	532838	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014394	TGTGT	2	10	536955	536964	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014394	TTTTC	2	10	556518	556527	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014394	TCAGG	2	10	562342	562351	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014394	CTGAG	2	10	668790	668799	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014394	TGTGT	2	10	671793	671802	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014394	TTCAA	2	10	671820	671829	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014394	GTTGA	2	10	713544	713553	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014394	TGGTT	2	10	714668	714677	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014394	GCCGT	2	10	714908	714917	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_014394	CAATT	2	10	716400	716409	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014394	GTGTT	2	10	716469	716478	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014394	TGCAA	2	10	717044	717053	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014394	CGCAG	2	10	717241	717250	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_014394	ATTTA	2	10	743618	743627	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014394	TTAGG	2	10	746597	746606	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014394	TTACA	2	10	752689	752698	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014394	CGTGG	2	10	769617	769626	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014394	TGCGT	2	10	774864	774873	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014394	TGTCA	2	10	774883	774892	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014394	GTTTT	2	10	775215	775224	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014394	CGACA	2	10	810391	810400	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_014394	AAATT	2	10	818639	818648	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014394	AATTG	2	10	818706	818715	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014394	TTTAA	2	10	820002	820011	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014394	AGTGG	2	10	823093	823102	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014394	ATTTC	2	10	823571	823580	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014394	ACGCC	2	10	850588	850597	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
60	NC_014394	GGTTT	2	10	865821	865830	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014394	TTCAG	2	10	865966	865975	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014394	GTTGA	2	10	969560	969569	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014394	TTTTA	2	10	999126	999135	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014394	ATTTA	2	10	1001608	1001617	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014394	TTGTG	2	10	1005527	1005536	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014394	AAGTG	2	10	1005985	1005994	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014394	CGTCA	2	10	1008657	1008666	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_014394	AGGGC	2	10	1008679	1008688	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014394	GGCAA	2	10	1010001	1010010	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014394	CTTGA	2	10	1010352	1010361	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014394	CCAAC	2	10	1012434	1012443	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
72	NC_014394	GGAAA	2	10	1018639	1018648	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014394	TCCAT	2	10	1021602	1021611	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_014394	ATTTT	2	10	1031139	1031148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014394	TATTT	2	10	1041269	1041278	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014394	TGTCA	2	10	1057468	1057477	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014394	CGGCG	2	10	1057903	1057912	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
78	NC_014394	ATTAC	2	10	1079569	1079578	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014394	GTGAG	2	10	1079616	1079625	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014394	AAGGG	2	10	1102884	1102893	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014394	TCAAT	2	10	1135944	1135953	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014394	TCATG	2	10	1198072	1198081	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014394	TCGTG	2	10	1254263	1254272	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014394	TTTAA	2	10	1254775	1254784	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014394	GTAAC	2	10	1261455	1261464	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014394	TATTT	2	10	1262920	1262929	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014394	CAATT	2	10	1263016	1263025	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014394	TAAAT	2	10	1263432	1263441	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014394	GCATG	2	10	1333567	1333576	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014394	GTCGT	2	10	1339535	1339544	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014394	TCAAT	2	10	1345335	1345344	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014394	TTTAG	2	10	1349904	1349913	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014394	CTTTT	2	10	1399828	1399837	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014394	GCAGG	2	10	1406881	1406890	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014394	ATTTA	2	10	1407111	1407120	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014394	CACGA	2	10	1407195	1407204	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_014394	CATGC	2	10	1456173	1456182	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_014394	CAGCG	2	10	1466073	1466082	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_014394	AGCGC	2	10	1472258	1472267	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_014394	AAACA	2	10	1476357	1476366	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_014394	CGCAG	2	10	1511145	1511154	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_014394	TTGAT	2	10	1534296	1534305	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014394	CCATC	2	10	1535719	1535728	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
104	NC_014394	CCGTA	2	10	1538838	1538847	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_014394	AAATC	2	10	1546252	1546261	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014394	CAATT	2	10	1546290	1546299	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014394	TCACC	2	10	1547766	1547775	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
108	NC_014394	AAGTT	2	10	1563852	1563861	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014394	GCCAA	2	10	1564535	1564544	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_014394	CCAGT	2	10	1565586	1565595	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_014394	CCAGC	2	10	1565718	1565727	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_014394	CAGAT	2	10	1577419	1577428	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014394	CAGAT	2	10	1583390	1583399	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014394	TGCAG	2	10	1599450	1599459	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014394	GCCAC	2	10	1612598	1612607	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_014394	GGAAG	2	10	1614949	1614958	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014394	AACTC	2	10	1620368	1620377	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_014394	TGAAA	2	10	1620378	1620387	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014394	TGCCC	2	10	1635127	1635136	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
120	NC_014394	GAAAG	2	10	1651306	1651315	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014394	AATAA	2	10	1651598	1651607	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014394	TCAAA	2	10	1666066	1666075	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014394	AAAAT	2	10	1669170	1669179	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014394	CATCG	2	10	1669226	1669235	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_014394	AAAAG	2	10	1669862	1669871	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014394	GCTAC	2	10	1678133	1678142	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_014394	GCTAC	2	10	1678268	1678277	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_014394	TCACA	2	10	1683776	1683785	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_014394	CCTGC	2	10	1706461	1706470	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_014394	GGTCA	2	10	1715678	1715687	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014394	TTTTC	2	10	1752643	1752652	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014394	CATGC	2	10	1759368	1759377	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_014394	CGTTG	2	10	1811607	1811616	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014394	AATTT	2	10	1811695	1811704	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014394	CATGG	2	10	1811936	1811945	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_014394	CAAAA	2	10	1813579	1813588	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014394	TTCGC	2	10	1815124	1815133	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_014394	CACTT	2	10	1818058	1818067	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_014394	GCAAA	2	10	1823867	1823876	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014394	CTCAC	2	10	1831536	1831545	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
141	NC_014394	GCGTC	2	10	1847584	1847593	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_014394	TTAAA	2	10	1868143	1868152	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014394	TTGCG	2	10	1882969	1882978	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014394	TTTTG	2	10	1883680	1883689	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014394	TTTAT	2	10	1905890	1905899	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014394	ATTTT	2	10	1972815	1972824	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_014394	TCATG	2	10	2214434	2214443	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_014394	CATTG	2	10	2244096	2244105	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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167	NC_014394	TCGCG	2	10	2299483	2299492	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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175	NC_014394	TAACT	2	10	2374468	2374477	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
176	NC_014394	CTAAC	2	10	2377560	2377569	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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180	NC_014394	CTTTA	2	10	2540427	2540436	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
181	NC_014394	ATTGC	2	10	2552258	2552267	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
182	NC_014394	CCCAT	2	10	2571739	2571748	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
183	NC_014394	TTGAA	2	10	2574236	2574245	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_014394	TTGAA	2	10	2587473	2587482	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_014394	TATAT	2	10	2617334	2617343	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_014394	ATAGC	2	10	2623358	2623367	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
188	NC_014394	TTTCA	2	10	2631992	2632001	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
189	NC_014394	CAAAA	2	10	2651909	2651918	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
190	NC_014394	GCAAA	2	10	2668183	2668192	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
191	NC_014394	TCTAA	2	10	2674122	2674131	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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195	NC_014394	TTAAT	2	10	2733169	2733178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_014394	ATCAC	2	10	2748505	2748514	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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207	NC_014394	AATGC	2	10	2833920	2833929	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
208	NC_014394	GCTCA	2	10	2843339	2843348	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
209	NC_014394	GCGCT	2	10	2863233	2863242	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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211	NC_014394	TTACA	2	10	2916030	2916039	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
212	NC_014394	ATTGC	2	10	2933981	2933990	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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215	NC_014394	CTGAC	2	10	2978487	2978496	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
216	NC_014394	CTCTG	2	10	2997840	2997849	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
217	NC_014394	TGCAC	2	10	2999524	2999533	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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219	NC_014394	ATTCA	2	10	3062099	3062108	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
220	NC_014394	TCAGC	2	10	3079148	3079157	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
221	NC_014394	AAAGT	2	10	3104006	3104015	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
222	NC_014394	GGATG	2	10	3111397	3111406	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
223	NC_014394	CTTAA	2	10	3139221	3139230	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
224	NC_014394	CAGGC	2	10	3152877	3152886	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
225	NC_014394	TTGAT	2	10	3162015	3162024	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.