MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 5560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013721	ATT	2	6	497074	497079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_013721	AAT	2	6	497516	497521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_013721	CAA	2	6	497526	497531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_013721	AGT	2	6	499168	499173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_013721	AGT	2	6	499183	499188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_013721	TAA	2	6	499199	499204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_013721	ATT	3	9	499210	499218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_013721	T	7	7	500418	500424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_013721	ATT	2	6	500431	500436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_013721	TAT	2	6	500491	500496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_013721	T	6	6	500510	500515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_013721	CGT	2	6	500532	500537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_013721	CGTG	2	8	500574	500581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_013721	GAG	2	6	501823	501828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_013721	AATT	2	8	502314	502321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_013721	AGC	2	6	502323	502328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_013721	GTTT	2	8	502329	502336	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_013721	AAC	2	6	502337	502342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_013721	GCT	2	6	502347	502352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_013721	T	6	6	502352	502357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_013721	GCC	2	6	503280	503285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_013721	T	6	6	503345	503350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_013721	TGGTT	2	10	503367	503376	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_013721	ACA	2	6	503423	503428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_013721	CT	3	6	503438	503443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_013721	CGC	2	6	503463	503468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_013721	GCG	2	6	503479	503484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_013721	T	6	6	503492	503497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_013721	TGC	2	6	503526	503531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_013721	GCA	2	6	503555	503560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_013721	AT	3	6	503572	503577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_013721	T	6	6	503577	503582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_013721	ATC	2	6	504432	504437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_013721	AGC	2	6	504567	504572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_013721	TAA	2	6	504626	504631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_013721	ATTTT	2	10	504683	504692	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_013721	T	6	6	504689	504694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_013721	GCA	2	6	505625	505630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_013721	TCT	2	6	505661	505666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_013721	CTT	2	6	505669	505674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_013721	ACAA	2	8	505716	505723	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_013721	TAT	4	12	505835	505846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_013721	T	6	6	505849	505854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_013721	TAT	2	6	505867	505872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_013721	TTGC	2	8	507514	507521	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_013721	TAAA	2	8	507539	507546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_013721	T	6	6	507590	507595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_013721	GT	3	6	507686	507691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_013721	TTG	2	6	507714	507719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_013721	AGCG	2	8	507731	507738	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1551	NC_013721	AGT	2	6	507753	507758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_013721	TAA	2	6	509990	509995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_013721	TCT	2	6	511246	511251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_013721	TTGT	2	8	511278	511285	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_013721	GTTA	2	8	511296	511303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_013721	GTTA	2	8	511308	511315	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_013721	GTA	2	6	511322	511327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_013721	TTTAT	2	10	511334	511343	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_013721	CTT	2	6	513187	513192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_013721	TAC	2	6	513994	513999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_013721	TGC	2	6	514043	514048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_013721	ATC	2	6	514057	514062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_013721	TAT	2	6	514122	514127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_013721	GTAT	2	8	514858	514865	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_013721	GCT	2	6	514909	514914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_013721	T	6	6	514914	514919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_013721	ACG	2	6	514920	514925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_013721	CTTGCG	2	12	514929	514940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_013721	AAC	2	6	514979	514984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_013721	TTG	2	6	515053	515058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_013721	TGA	2	6	515075	515080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_013721	AGC	2	6	515701	515706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_013721	AT	3	6	515721	515726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_013721	T	6	6	517047	517052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_013721	AAC	2	6	517109	517114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_013721	AAAAAG	2	12	517127	517138	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_013721	TGA	2	6	518023	518028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_013721	CAAC	2	8	518064	518071	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_013721	T	6	6	518093	518098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_013721	TTA	2	6	518219	518224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_013721	ATT	2	6	518238	518243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_013721	TAG	2	6	518247	518252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_013721	TGT	2	6	518268	518273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_013721	GAG	2	6	518283	518288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_013721	GT	3	6	520229	520234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_013721	T	6	6	520242	520247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_013721	TAG	2	6	520259	520264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_013721	CTT	2	6	520360	520365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_013721	TGC	2	6	520367	520372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_013721	TGC	2	6	520374	520379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_013721	TA	3	6	520385	520390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_013721	CAA	2	6	521861	521866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_013721	TTA	2	6	521873	521878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1595	NC_013721	AAT	2	6	523837	523842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_013721	TA	3	6	523844	523849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_013721	TAA	2	6	523893	523898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_013721	GAA	2	6	523911	523916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_013721	TAT	2	6	525897	525902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_013721	GTC	2	6	525903	525908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_013721	GT	3	6	525957	525962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_013721	AAT	2	6	526330	526335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_013721	AAG	2	6	526369	526374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_013721	T	6	6	526387	526392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_013721	AGT	2	6	526395	526400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1607	NC_013721	TAT	2	6	528854	528859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_013721	GTTTT	2	10	528886	528895	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_013721	ATT	2	6	529914	529919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_013721	T	6	6	529933	529938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_013721	ATA	2	6	529941	529946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_013721	AT	3	6	529977	529982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_013721	A	6	6	529987	529992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_013721	TA	3	6	530006	530011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_013721	AAT	2	6	530012	530017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_013721	TAAT	2	8	530055	530062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_013721	T	7	7	530081	530087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_013721	TTGT	2	8	530109	530116	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_013721	GGAT	2	8	530196	530203	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_013721	T	6	6	530229	530234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_013721	AGTA	2	8	531959	531966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_013721	TTC	2	6	531978	531983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_013721	AAT	2	6	531986	531991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_013721	TGC	2	6	532014	532019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_013721	TAAA	2	8	532035	532042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_013721	TGT	2	6	532066	532071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_013721	T	6	6	532071	532076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_013721	GGA	2	6	534049	534054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_013721	GTTG	2	8	536195	536202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_013721	GTG	2	6	536225	536230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_013721	TGTGT	2	10	536239	536248	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_013721	AAT	2	6	537171	537176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_013721	TA	3	6	537198	537203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_013721	TGCTT	2	10	537218	537227	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1635	NC_013721	AAT	2	6	537258	537263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_013721	TAA	2	6	537267	537272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_013721	AT	3	6	537273	537278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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