MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 5560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013721	AAT	2	6	149028	149033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_013721	ATTT	2	8	149091	149098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_013721	GCAA	2	8	149254	149261	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
504	NC_013721	CAG	2	6	149277	149282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_013721	AGA	2	6	149335	149340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_013721	ATG	2	6	149346	149351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013721	AGT	2	6	149383	149388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_013721	TGT	2	6	149401	149406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013721	GCT	2	6	149438	149443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_013721	CTT	2	6	149446	149451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_013721	TGA	2	6	149484	149489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_013721	TGC	2	6	149512	149517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_013721	TGA	2	6	149539	149544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_013721	AGT	2	6	149599	149604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_013721	CGG	2	6	149608	149613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_013721	ATT	2	6	149637	149642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_013721	TACT	2	8	149688	149695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
518	NC_013721	ATA	2	6	151503	151508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_013721	GGT	2	6	152266	152271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_013721	CTT	2	6	156705	156710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_013721	TGCT	2	8	156727	156734	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
522	NC_013721	AGG	2	6	157466	157471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_013721	TAT	2	6	157476	157481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013721	TGA	2	6	162526	162531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013721	GAC	2	6	162541	162546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_013721	GTA	2	6	162551	162556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_013721	A	6	6	162563	162568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013721	CAA	2	6	162580	162585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_013721	TG	3	6	162598	162603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
530	NC_013721	TAG	2	6	162615	162620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_013721	GCT	2	6	162676	162681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_013721	AGC	2	6	162704	162709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_013721	TCTA	2	8	162710	162717	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
534	NC_013721	AAATTT	2	12	162728	162739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_013721	ATAAAC	2	12	162813	162824	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
536	NC_013721	TAA	2	6	162837	162842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013721	AT	3	6	163932	163937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_013721	TTTCG	2	10	163939	163948	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
539	NC_013721	AT	4	8	163991	163998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013721	ATTGA	2	10	164011	164020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
541	NC_013721	TGAG	2	8	164026	164033	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_013721	AGG	2	6	164070	164075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_013721	TAA	2	6	164985	164990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_013721	AAAG	2	8	165021	165028	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
545	NC_013721	CGAA	2	8	165272	165279	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
546	NC_013721	AAT	2	6	165890	165895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013721	AAAAT	2	10	165899	165908	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_013721	TAT	2	6	165927	165932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_013721	T	6	6	165946	165951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013721	GAG	2	6	165960	165965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_013721	GTG	2	6	170772	170777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013721	TTG	2	6	171059	171064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013721	TTG	2	6	171076	171081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_013721	TCT	2	6	171120	171125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_013721	AAACG	2	10	171307	171316	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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558	NC_013721	CACTTT	2	12	171410	171421	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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560	NC_013721	AGTG	2	8	171451	171458	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_013721	CTTT	2	8	171485	171492	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
562	NC_013721	TTG	2	6	171556	171561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_013721	AAT	2	6	171612	171617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_013721	GCG	2	6	171632	171637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_013721	GTAA	2	8	171680	171687	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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567	NC_013721	TGT	2	6	171707	171712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_013721	GTT	2	6	171749	171754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013721	GT	3	6	171769	171774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_013721	GAA	2	6	171784	171789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013721	TG	3	6	171986	171991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013721	GTG	2	6	172748	172753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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574	NC_013721	GCAA	2	8	172933	172940	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
575	NC_013721	AAT	2	6	172971	172976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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578	NC_013721	AAT	2	6	175384	175389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_013721	AGCT	2	8	175399	175406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
580	NC_013721	GCAA	2	8	175432	175439	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
581	NC_013721	AAAT	2	8	175493	175500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_013721	GTAAA	2	10	175507	175516	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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584	NC_013721	AGA	3	9	175526	175534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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586	NC_013721	ATT	2	6	175598	175603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_013721	TAA	2	6	175629	175634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_013721	TAG	2	6	177026	177031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_013721	GAG	2	6	181128	181133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_013721	TAAT	2	8	182886	182893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013721	CAATAA	2	12	182901	182912	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
603	NC_013721	TAAA	2	8	182914	182921	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_013721	TAAC	2	8	182924	182931	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
605	NC_013721	AACA	2	8	182932	182939	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
606	NC_013721	TAA	2	6	183609	183614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_013721	ATTA	2	8	183621	183628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013721	ATA	2	6	183642	183647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013721	AGG	2	6	183659	183664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013721	GAT	2	6	188568	188573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013721	ACC	2	6	189183	189188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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613	NC_013721	TCGT	2	8	189493	189500	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
614	NC_013721	GCA	2	6	189540	189545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_013721	ATG	2	6	189548	189553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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618	NC_013721	TTA	2	6	190177	190182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_013721	TAC	2	6	190224	190229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_013721	ATCA	2	8	192258	192265	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_013721	CTT	3	9	192563	192571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_013721	ATAA	2	8	192629	192636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_013721	AAC	2	6	192638	192643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_013721	AGA	2	6	192691	192696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_013721	TG	3	6	192709	192714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_013721	AAAT	2	8	192734	192741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_013721	TACC	2	8	192965	192972	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
628	NC_013721	TGT	2	6	192995	193000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_013721	ACT	2	6	193002	193007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_013721	TGC	2	6	193067	193072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_013721	AAAT	2	8	193075	193082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_013721	TAA	2	6	193102	193107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_013721	A	7	7	193106	193112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_013721	TGC	2	6	193204	193209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_013721	A	6	6	193374	193379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_013721	A	6	6	194040	194045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_013721	TCA	2	6	194056	194061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_013721	TGA	2	6	194069	194074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_013721	ACA	2	6	194093	194098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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772	NC_013721	TAA	2	6	247008	247013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
773	NC_013721	A	7	7	247012	247018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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775	NC_013721	TAAA	2	8	250410	250417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
776	NC_013721	AAAGC	2	10	250425	250434	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
777	NC_013721	GTT	2	6	251244	251249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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779	NC_013721	GTT	2	6	251315	251320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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