MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus sp. Y412MC61 chromosome

Total Repeats: 195

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013411	GTTTTT	2	12	1583	1594	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013411	CGAAGG	2	12	12258	12269	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013411	TGCGTC	2	12	12782	12793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013411	CGAAGG	2	12	15918	15929	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013411	AAGCGA	2	12	21920	21931	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013411	CGAAGG	2	12	31497	31508	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013411	CGAAGG	2	12	35059	35070	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013411	ATTTTT	2	12	49828	49839	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013411	TTTGCG	2	12	57564	57575	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013411	TGCGTC	2	12	92078	92089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013411	TGCGTC	2	12	92366	92377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013411	CGAAGG	2	12	95501	95512	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013411	AGTAAG	2	12	95933	95944	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013411	AGTCAA	2	12	95954	95965	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_013411	GTTCCG	2	12	116061	116072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013411	CGAAGG	2	12	155517	155528	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013411	CGAAGG	2	12	158589	158600	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013411	AAAGGG	2	12	179906	179917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013411	ACGGTG	2	12	181658	181669	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013411	CATAGC	2	12	190430	190441	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013411	TTGCTT	2	12	190536	190547	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013411	CGGCCG	2	12	203766	203777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013411	AGGGGA	2	12	215382	215393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013411	GAGCGG	2	12	229353	229364	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013411	CGCGTC	2	12	229674	229685	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013411	TTCTCG	2	12	230400	230411	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013411	ATTTTT	2	12	260019	260030	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013411	CCATCG	2	12	272808	272819	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013411	GAGACG	2	12	273488	273499	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013411	CCATCG	2	12	278193	278204	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013411	CTTGGC	2	12	320246	320257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013411	AAAAAT	2	12	321309	321320	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013411	AGACGA	2	12	341124	341135	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013411	ACGTAT	2	12	345308	345319	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_013411	GGGAAA	2	12	348051	348062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013411	AAGCGG	2	12	363538	363549	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013411	GAATGA	2	12	366763	366774	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013411	CATTAT	2	12	397612	397623	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013411	TGTATT	2	12	507426	507437	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013411	AAACAA	2	12	524529	524540	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013411	AAAAAT	2	12	536709	536720	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013411	CGAAGG	2	12	548425	548436	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013411	TAAATG	2	12	553910	553921	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013411	TGAAAA	2	12	585113	585124	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013411	CAAAAA	2	12	618192	618203	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013411	AAGGCA	2	12	624988	624999	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013411	CATTTC	2	12	627883	627894	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013411	ATTGAA	2	12	643740	643751	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013411	GGAAAA	2	12	660557	660568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013411	CATTTC	2	12	660855	660866	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013411	ATGAAG	2	12	744341	744352	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013411	TCCTTT	2	12	760713	760724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013411	CGTTTC	2	12	838316	838327	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013411	CTTTTG	2	12	928121	928132	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013411	GCGATC	2	12	972015	972026	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013411	AAAGTC	2	12	1011601	1011612	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013411	TTTTCT	2	12	1028533	1028544	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013411	TTTTGT	2	12	1094729	1094740	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013411	CGAAGG	2	12	1107625	1107636	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013411	CTTTTT	2	12	1107951	1107962	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013411	TTCTTT	2	12	1118694	1118705	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013411	CTTGGC	2	12	1123890	1123901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013411	ATGGGT	2	12	1137469	1137480	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013411	CGAAGG	2	12	1139261	1139272	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_013411	GGAAAC	2	12	1139700	1139711	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013411	GGATAC	2	12	1172910	1172921	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013411	AGTAAA	2	12	1173469	1173480	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013411	TTCGAT	2	12	1223719	1223730	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_013411	AAAGAA	2	12	1262253	1262264	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013411	GCATAA	2	12	1269225	1269236	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013411	TGCAAA	2	12	1269637	1269648	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013411	AGACGG	2	12	1283947	1283958	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_013411	TTAACG	2	12	1285646	1285657	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_013411	TCAATG	2	12	1296990	1297001	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013411	TCATTG	2	12	1298857	1298868	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013411	TGACGG	2	12	1299981	1299992	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_013411	GCCGCT	2	12	1323866	1323877	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013411	AGTCAG	2	12	1333974	1333985	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013411	GTTTTT	2	12	1345470	1345481	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013411	GTTCCA	2	12	1358320	1358331	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013411	ATGGAT	2	12	1367285	1367296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013411	TAATTT	2	12	1371303	1371314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013411	TGCGTC	2	12	1389337	1389348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013411	TGCGTC	2	12	1389512	1389523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013411	CGAAGG	2	12	1389685	1389696	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_013411	CGAAGG	2	12	1392879	1392890	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_013411	GAAGAG	2	12	1394070	1394081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013411	GAAAAT	2	12	1416763	1416774	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013411	GAAAAG	2	12	1423027	1423038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013411	AACGAA	2	12	1423609	1423620	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_013411	GAAAAA	2	12	1485048	1485059	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013411	CTTTTT	2	12	1499367	1499378	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_013411	GATCGC	2	12	1521623	1521634	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013411	TTTCGT	2	12	1529628	1529639	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_013411	GAAAGA	2	12	1537285	1537296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013411	GGATAG	2	12	1537570	1537581	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013411	AGAAAA	2	12	1547912	1547923	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013411	CTTTTT	2	12	1607206	1607217	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_013411	GAGATG	2	12	1608042	1608053	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013411	CTTTTC	2	12	1645451	1645462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013411	GAGAAA	2	12	1667100	1667111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013411	GCGGAT	2	12	1676509	1676520	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_013411	TCCCCG	2	12	1689184	1689195	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_013411	GAAAAA	2	12	1705232	1705243	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013411	GTTCAT	2	12	1708176	1708187	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_013411	GAAAAG	2	12	1726792	1726803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013411	ACAGAG	2	12	1736630	1736641	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_013411	CTGAAA	2	12	1741562	1741573	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_013411	TTTTCA	2	12	1745648	1745659	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_013411	TGACTT	2	12	1789545	1789556	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_013411	AAGGAG	2	12	1790612	1790623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013411	GTATCC	2	12	1813013	1813024	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013411	CTATCG	2	12	1848085	1848096	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013411	CTTTTT	2	12	1851148	1851159	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_013411	GGCCTT	2	12	1855071	1855082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013411	CCAATT	2	12	1855924	1855935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013411	ACAAGC	2	12	1862400	1862411	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013411	GGTGGA	2	12	1865024	1865035	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013411	GCAAGG	2	12	1885572	1885583	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_013411	GGCCAA	2	12	1954268	1954279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013411	TCCATT	2	12	2060240	2060251	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013411	TTTCTT	2	12	2079704	2079715	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_013411	TTTCTT	2	12	2126339	2126350	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_013411	AAAATA	2	12	2134213	2134224	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013411	GTTTTT	2	12	2167477	2167488	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013411	TAATGG	2	12	2172644	2172655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013411	TTCCGG	2	12	2172763	2172774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.